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Transcriptome id Sobic.008G065800.1
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Functional annotation -
UniProt C5YTB2
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cDNA sequences
Sobic.008G065800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G289600 - -
2 Sobic.001G022100 expressed protein -
3 Sobic.008G065400 - -
4 Sobic.009G067501 - -
5 Sobic.010G197700 cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
7 Sobic.001G278600 - -
8 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
9 Sobic.003G424400 Spotted leaf protein(PubMedID : 24906815)@armadillo repeat-containing protein, putative, expressed K08332: vacuolar protein 8
10 Sobic.004G332000 alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, putative, expressed K00736: alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase
11 Sobic.005G090600 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
12 Sobic.007G136700 YGL010w, putative, expressed -
13 Sobic.010G101700 - -
14 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G230700 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@transcription factor like protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G266700 expressed protein -
18 Sobic.008G109100 expressed protein -
19 Sobic.001G485400 "BG1(Ortholog in rice:Liu et al., 2015)"(PubMedID : 31659849)@expressed protein -
20 Sobic.005G046100 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic008G065800--Sobic004G289600 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic008G065800--Sobic001G022100 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic008G065800--Sobic008G065400 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G065800--Sobic009G067501 Sobic010G197700 Sobic010G197700 Sobic008G065800--Sobic010G197700 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic008G065800--Sobic006G068400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065800--Sobic001G278600 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic008G065800--Sobic001G262900 Sobic003G424400 Sobic003G424400 Sobic008G065800--Sobic003G424400 Sobic004G289600--Sobic008G065800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic004G289600--Sobic008G125600 Sobic004G289600--Sobic001G022100 Sobic003G020600 Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic006G068400 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G289600--Sobic010G033700 Sobic004G289600--Sobic009G067501 Sobic008G106600 Sobic008G106600 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Octagon: transcription factors


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