Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G109100.2,Sobic.008G109100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R619 , A0A1B6PCZ8
Pfam -
Panther DB PTHR34835
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g40940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G065800 - -
2 Sobic.005G079700 expressed protein -
3 Sobic.008G106600 - -
4 Sobic.008G000800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10398: KIF11, kinesin family member 11
5 Sobic.010G004400 septum site-determining protein minD, putative, expressed K03609: septum site-determining protein MinD
6 Sobic.003G277900 "D61(Ortholog in rice:Morinaka et al., 2006(PubMedID : 31659871)@systemin receptor SR160 precursor, putative, expressed K13415: protein brassinosteroid insensitive 1
7 Sobic.010G166700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
8 Sobic.008G091671 - -
9 Sobic.002G205900 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G103000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G120300 - -
12 Sobic.010G033700 - -
13 Sobic.009G013100 rp3 protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
15 Sobic.004G289600 - -
16 Sobic.002G359000 formin, putative, expressed -
17 Sobic.004G054200 avr9/Cf-9 rapidly elicited protein 137, putative, expressed -
18 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
19 Sobic.003G161700 expressed protein -
20 Sobic.004G053300 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K07375: tubulin beta


Gene co-expression network
sample Sobic008G109100 Sobic008G109100 Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic008G109100--Sobic008G065800 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G109100--Sobic005G079700 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic008G109100--Sobic008G106600 Sobic008G000800 Sobic008G000800 Sobic008G109100--Sobic008G000800 Sobic010G004400 Sobic010G004400 Sobic008G109100--Sobic010G004400 Sobic003G277900 Sobic003G277900 Sobic008G109100--Sobic003G277900 Sobic010G166700 Sobic010G166700 Sobic008G109100--Sobic010G166700 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic008G109100--Sobic008G091671 Sobic002G205900 Sobic002G205900 Sobic008G109100--Sobic002G205900 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic008G065800--Sobic004G289600 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic008G065800--Sobic001G022100 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic008G065800--Sobic008G065400 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G065800--Sobic009G067501 Sobic010G197700 Sobic010G197700 Sobic008G065800--Sobic010G197700 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic008G065800--Sobic006G068400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065800--Sobic001G278600 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic008G065800--Sobic001G262900 Sobic003G424400 Sobic003G424400 Sobic008G065800--Sobic003G424400 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic008G106600--Sobic001G261537 Sobic008G106600--Sobic006G068400 Sobic008G106600--Sobic008G091671 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic008G106600--Sobic005G128000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic005G064700 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic008G106600--Sobic009G197200 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic008G106600--Sobic010G139301 Sobic008G106600--Sobic009G067501 Sobic008G106600--Sobic004G289600 Sobic010G229000 Sobic010G229000 Sobic008G000800--Sobic010G229000 Sobic004G053300 Sobic004G053300 Sobic008G000800--Sobic004G053300 Sobic008G000800--Sobic010G139301 Sobic008G000800--Sobic006G068400 Sobic003G432900 Sobic003G432900 Sobic008G000800--Sobic003G432900 Sobic009G013100 Sobic009G013100 Sobic008G000800--Sobic009G013100 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic008G000800--Sobic004G227500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G000800--Sobic001G305400 Sobic008G000800--Sobic003G277900 Sobic010G004400--Sobic004G227500 Sobic010G277200 Sobic010G277200 Sobic010G004400--Sobic010G277200 Sobic007G000400 Sobic007G000400 Sobic010G004400--Sobic007G000400 Sobic007G219200 Sobic007G219200 Sobic010G004400--Sobic007G219200 Sobic004G217900 Sobic004G217900 Sobic010G004400--Sobic004G217900 Sobic003G051500 Sobic003G051500 Sobic010G004400--Sobic003G051500 Sobic001G187800 Sobic001G187800 Sobic010G004400--Sobic001G187800 Sobic001G261585 Sobic001G261585 Sobic010G004400--Sobic001G261585 Sobic009G155400 Sobic009G155400 Sobic010G004400--Sobic009G155400 Sobic003G277900--Sobic004G053300 Sobic005G159600 Sobic005G159600 Sobic003G277900--Sobic005G159600 Sobic001G494100 Sobic001G494100 Sobic003G277900--Sobic001G494100 Sobic006G046600 Sobic006G046600 Sobic003G277900--Sobic006G046600 Sobic003G277900--Sobic008G000800 Sobic008G086200 Sobic008G086200 Sobic003G277900--Sobic008G086200 Sobic009G123500 Sobic009G123500 Sobic003G277900--Sobic009G123500 Sobic001G315400 Sobic001G315400 Sobic003G277900--Sobic001G315400 Sobic007G187400 Sobic007G187400 Sobic003G277900--Sobic007G187400 Sobic002G110100 Sobic002G110100 Sobic010G166700--Sobic002G110100 Sobic010G166700--Sobic008G109100 Sobic010G050900 Sobic010G050900 Sobic010G166700--Sobic010G050900 Sobic004G201300 Sobic004G201300 Sobic010G166700--Sobic004G201300 Sobic002G226700 Sobic002G226700 Sobic010G166700--Sobic002G226700 Sobic010G123300 Sobic010G123300 Sobic010G166700--Sobic010G123300 Sobic001G021500 Sobic001G021500 Sobic010G166700--Sobic001G021500 Sobic009G136900 Sobic009G136900 Sobic010G166700--Sobic009G136900 Sobic007G154800 Sobic007G154800 Sobic010G166700--Sobic007G154800 Sobic008G091671--Sobic009G197200 Sobic008G091671--Sobic006G068400 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic007G112900 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic002G212800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic008G091671--Sobic004G291800 Sobic008G091671--Sobic009G067501 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic008G091671--Sobic003G159450 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic010G139301 Sobic003G161700 Sobic003G161700 Sobic002G205900--Sobic003G161700 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic002G205900--Sobic009G157500 Sobic002G205900--Sobic001G262900 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic002G205900--Sobic007G037301 Sobic002G205900--Sobic008G000800 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic002G205900--Sobic002G224450 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic002G205900--Sobic003G429500 Sobic002G205900--Sobic006G068400 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic002G205900--Sobic004G121000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.