Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G013100.3,Sobic.009G013100.4,Sobic.009G013100.1
Synonym
Functional annotation rp3 protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R0C7 , B3VTC2 , B2LTI9 , B2LTJ0
Pfam PF05729
Panther DB PTHR23155
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g23990.1 : rp3 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G316500 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G099150 - -
3 Sobic.010G139301 - -
4 Sobic.008G000800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10398: KIF11, kinesin family member 11
5 Sobic.002G182300 - -
6 Sobic.010G229000 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@auxin response factor, putative, expressed -
7 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
8 Sobic.004G227500 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G323900 - -
10 Sobic.002G212800 - -
11 Sobic.005G096000 resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G033700 - -
14 Sobic.007G100100 - -
15 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
16 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G030300 RNA polymerase II-associated protein 3, putative, expressed -
18 Sobic.008G099500 - -
19 Sobic.008G091671 - -
20 Sobic.010G015000 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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