Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G080000.1
Synonym
Functional annotation leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PC46
Pfam -
Panther DB PTHR24106 PTHR24106:SF146
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G20210 : RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g12740.1 : leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025035
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G080000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G193850 - -
2 Sobic.001G486000 tentative name(PubMedID : 31536532)@nuclear transcription factor Y subunit, putative, expressed K08064: NFYA, nuclear transcription factor Y, alpha
3 Sobic.003G408300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14791: periodic tryptophan protein 1
4 Sobic.002G177500 expressed protein -
5 Sobic.009G065200 zinc finger family protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G111700 expressed protein -
7 Sobic.002G148300 - -
8 Sobic.002G088700 domain of unknown function domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G057800 URED, putative, expressed K03190: ureD, urease accessory protein
10 Sobic.010G012600 expressed protein -
11 Sobic.004G077000 expressed protein -
12 Sobic.003G436600 expressed protein -
13 Sobic.006G067900 expressed protein -
14 Sobic.001G543300 dehydrogenase, putative, expressed -
15 Sobic.010G015700 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.010G063566 - K11111: TERF2, telomeric repeat-binding factor 2
17 Sobic.004G018800 HVA22, putative, expressed -
18 Sobic.009G233700 CobW/P47K family protein, putative, expressed K03189: urease accessory protein
19 Sobic.005G122900 - -
20 Sobic.001G370300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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