Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G204800.1
Synonym
Functional annotation protein phosphatase 2C, putative, expressed
UniProt A0A1B6PTT2
Pfam -
Panther DB PTHR13832 PTHR13832:SF356
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006470; protein dephosphorylation GO:0004722protein serine/threonine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G31860 : Protein phosphatase 2C family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g44210.1 : protein phosphatase 2C, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047901
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G088700.1 , HORVU5Hr1G088700.2 , HORVU5Hr1G088700.3
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G204800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G326100 expressed protein -
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9 Sobic.007G061900 - -
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11 Sobic.003G304800 OsRhmbd4 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
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13 Sobic.002G148300 - -
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17 Sobic.005G166000 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
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19 Sobic.005G099200 - -
20 Sobic.004G206300 pre-mRNA-splicing factor ISY1, putative, expressed K12870: pre-mRNA-splicing factor ISY1


Gene co-expression network
sample Sobic005G204800 Sobic005G204800 Sobic001G326100 Sobic001G326100 Sobic005G204800--Sobic001G326100 Sobic005G229800 Sobic005G229800 Sobic005G204800--Sobic005G229800 Sobic006G072501 Sobic006G072501 Sobic005G204800--Sobic006G072501 Sobic010G004400 Sobic010G004400 Sobic005G204800--Sobic010G004400 Sobic006G180700 Sobic006G180700 Sobic005G204800--Sobic006G180700 Sobic003G060300 Sobic003G060300 Sobic005G204800--Sobic003G060300 Sobic003G259600 Sobic003G259600 Sobic005G204800--Sobic003G259600 Sobic003G061000 Sobic003G061000 Sobic005G204800--Sobic003G061000 Sobic007G061900 Sobic007G061900 Sobic005G204800--Sobic007G061900 Sobic009G067551 Sobic009G067551 Sobic001G326100--Sobic009G067551 Sobic001G326100--Sobic005G204800 Sobic001G326100--Sobic005G229800 Sobic001G326100--Sobic003G060300 Sobic001G326100--Sobic006G180700 Sobic009G044900 Sobic009G044900 Sobic001G326100--Sobic009G044900 Sobic005G114400 Sobic005G114400 Sobic001G326100--Sobic005G114400 Sobic004G180033 Sobic004G180033 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Octagon: transcription factors


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