Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G261496.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDA0 , A0A109NDV6 , A0A109NDM8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G222300 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.003G205801 - -
3 Sobic.004G096500 KH domain-containing protein, putative, expressed K13210: far upstream element-binding protein
4 Sobic.010G143200 - -
5 Sobic.002G144933 - -
6 Sobic.009G102500 - -
7 Sobic.003G084900 expressed protein -
8 Sobic.001G228700 - -
9 Sobic.009G083500 - -
10 Sobic.007G011600 KH domain-containing protein, putative, expressed K13210: far upstream element-binding protein
11 Sobic.003G174450 - -
12 Sobic.010G136600 - -
13 Sobic.009G100050 - -
14 Sobic.003G170100 - -
15 Sobic.001G303675 - -
16 Sobic.007G227000 riboflavin biosynthesis protein ribAB, chloroplast precursor, putative, expressed K14652: 3,4-dihydroxy 2-butanone 4-phosphate synthase / GTP cyclohydrolase II
17 Sobic.010G068400 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
18 Sobic.009G086900 expressed protein -
19 Sobic.008G125501 - -
20 Sobic.001G267900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G261496 Sobic001G261496 Sobic006G222300 Sobic006G222300 Sobic001G261496--Sobic006G222300 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic001G261496--Sobic003G205801 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic001G261496--Sobic004G096500 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic001G261496--Sobic010G143200 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G261496--Sobic002G144933 Sobic009G102500 Sobic009G102500 Sobic001G261496--Sobic009G102500 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G261496--Sobic003G084900 Sobic001G228700 Sobic001G228700 Sobic001G261496--Sobic001G228700 Sobic009G083500 Sobic009G083500 Sobic001G261496--Sobic009G083500 Sobic006G222300--Sobic009G083500 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic006G222300--Sobic001G311500 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic006G222300--Sobic007G159900 Sobic006G222300--Sobic004G096500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic006G222300--Sobic010G136600 Sobic010G028800 Sobic010G028800 Sobic006G222300--Sobic010G028800 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic006G222300--Sobic009G086900 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic006G222300--Sobic001G241200 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic006G222300--Sobic002G264200 Sobic003G205801--Sobic003G084900 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic003G205801--Sobic003G241200 Sobic003G205801--Sobic010G028800 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic003G205801--Sobic003G088700 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G205801--Sobic001G152320 Sobic003G205801--Sobic001G261496 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G205801--Sobic010G056000 Sobic006G165000 Sobic006G165000 Sobic003G205801--Sobic006G165000 Sobic009G178800 Sobic009G178800 Sobic003G205801--Sobic009G178800 Sobic007G011600 Sobic007G011600 Sobic004G096500--Sobic007G011600 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic004G096500--Sobic001G303675 Sobic004G096500--Sobic006G222300 Sobic006G052300 Sobic006G052300 Sobic004G096500--Sobic006G052300 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic004G096500--Sobic008G011100 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic004G096500--Sobic002G259800 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic004G096500--Sobic001G306900 Sobic005G079800 Sobic005G079800 Sobic004G096500--Sobic005G079800 Sobic004G096500--Sobic001G261496 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic010G143200--Sobic007G112900 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic010G143200--Sobic003G159450 Sobic010G143200--Sobic001G261496 Sobic001G191100 Sobic001G191100 Sobic010G143200--Sobic001G191100 Sobic008G000900 Sobic008G000900 Sobic010G143200--Sobic008G000900 Sobic010G143200--Sobic004G096500 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic010G143200--Sobic008G125600 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic010G143200--Sobic008G091671 Sobic010G143200--Sobic009G178800 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic002G144933--Sobic008G173900 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic002G144933--Sobic002G157000 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic002G144933--Sobic001G420200 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G144933--Sobic003G268300 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic002G144933--Sobic001G274200 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic002G144933--Sobic007G037900 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic002G144933--Sobic004G145500 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic002G144933--Sobic003G170100 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G144933--Sobic009G065100 Sobic009G102500--Sobic003G170100 Sobic003G173950 Sobic003G173950 Sobic009G102500--Sobic003G173950 Sobic009G102500--Sobic002G144933 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic009G102500--Sobic007G096600 Sobic009G102500--Sobic002G157000 Sobic009G102500--Sobic008G173900 Sobic009G102500--Sobic001G152320 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic009G102500--Sobic003G200200 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic009G102500--Sobic001G356500 Sobic003G084900--Sobic010G056000 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic003G084900--Sobic007G096000 Sobic003G084900--Sobic010G028800 Sobic003G084900--Sobic008G173900 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic003G084900--Sobic008G054500 Sobic003G084900--Sobic006G165000 Sobic003G084900--Sobic002G144933 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G084900--Sobic001G111900 Sobic003G084900--Sobic003G268300 Sobic001G228700--Sobic009G178800 Sobic001G228700--Sobic008G173900 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic001G228700--Sobic001G206100 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic001G228700--Sobic001G257300 Sobic007G227000 Sobic007G227000 Sobic001G228700--Sobic007G227000 Sobic001G228700--Sobic002G144933 Sobic001G228700--Sobic001G303675 Sobic001G228700--Sobic009G102500 Sobic001G228700--Sobic003G170100 Sobic009G083500--Sobic006G222300 Sobic009G083500--Sobic010G136600 Sobic009G083500--Sobic010G028800 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic009G083500--Sobic007G065400 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic009G083500--Sobic002G191800 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic009G083500--Sobic003G372700 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic009G083500--Sobic010G069100 Sobic009G083500--Sobic003G170100 Sobic009G083500--Sobic008G173900
Octagon: transcription factors


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