Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G192250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6E2
Pfam PF12717
Panther DB PTHR14222 PTHR14222:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007076; mitotic chromosome condensation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G15890 : binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g36170.1 : HEAT repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054329
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G113260.1 , HORVU5Hr1G113260.8 , HORVU5Hr1G113260.5 , HORVU5Hr1G113260.2 , HORVU5Hr1G113260.3
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G097900 - -
2 Sobic.001G267000 - -
3 Sobic.001G178800 - -
4 Sobic.003G112001 - -
5 Sobic.003G134700 exonuclease, putative, expressed -
6 Sobic.005G108225 - -
7 Sobic.001G091200 - -
8 Sobic.002G393800 MLA10, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
9 Sobic.009G093800 - -
10 Sobic.009G074250 - -
11 Sobic.001G318100 - -
12 Sobic.005G117200 - -
13 Sobic.004G081201 - -
14 Sobic.010G135250 - -
15 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
16 Sobic.010G168000 - -
17 Sobic.005G115400 - -
18 Sobic.005G075500 - -
19 Sobic.003G115400 RPA3 - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 3, expressed K10740: replication factor A3
20 Sobic.010G165900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G192250 Sobic001G192250 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic001G192250--Sobic009G097900 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic001G192250--Sobic001G267000 Sobic001G178800 Sobic001G178800 Sobic001G192250--Sobic001G178800 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic001G192250--Sobic003G112001 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic001G192250--Sobic003G134700 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic001G192250--Sobic005G108225 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G192250--Sobic001G091200 Sobic002G393800 Sobic002G393800 Sobic001G192250--Sobic002G393800 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic001G192250--Sobic009G093800 Sobic009G097900--Sobic009G093800 Sobic009G097900--Sobic003G134700 Sobic009G097900--Sobic003G112001 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic009G097900--Sobic009G074250 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic009G097900--Sobic001G318100 Sobic009G097900--Sobic001G178800 Sobic009G097900--Sobic001G192250 Sobic009G097900--Sobic005G108225 Sobic003G115400 Sobic003G115400 Sobic009G097900--Sobic003G115400 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic001G267000--Sobic003G128550 Sobic001G267000--Sobic001G178800 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic001G267000--Sobic009G070300 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic001G267000--Sobic005G115400 Sobic005G117200 Sobic005G117200 Sobic001G267000--Sobic005G117200 Sobic001G267000--Sobic009G097900 Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic001G267000--Sobic002G066901 Sobic001G267000--Sobic001G192250 Sobic009G128000 Sobic009G128000 Sobic001G267000--Sobic009G128000 Sobic001G178800--Sobic001G267000 Sobic001G178800--Sobic009G097900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic001G178800--Sobic001G538100 Sobic001G178800--Sobic003G134700 Sobic001G178800--Sobic001G192250 Sobic001G178800--Sobic009G074250 Sobic001G178800--Sobic005G115400 Sobic005G081000 Sobic005G081000 Sobic001G178800--Sobic005G081000 Sobic007G043600 Sobic007G043600 Sobic001G178800--Sobic007G043600 Sobic003G112001--Sobic003G134700 Sobic003G112001--Sobic009G074250 Sobic003G112001--Sobic009G097900 Sobic003G112001--Sobic009G093800 Sobic003G112001--Sobic001G318100 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic003G112001--Sobic010G102366 Sobic010G060166 Sobic010G060166 Sobic003G112001--Sobic010G060166 Sobic003G112001--Sobic001G192250 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic003G112001--Sobic003G351401 Sobic003G134700--Sobic003G112001 Sobic003G134700--Sobic009G097900 Sobic003G134700--Sobic009G093800 Sobic003G134700--Sobic009G074250 Sobic003G134700--Sobic010G102366 Sobic008G178450 Sobic008G178450 Sobic003G134700--Sobic008G178450 Sobic003G134700--Sobic001G178800 Sobic003G134700--Sobic003G115400 Sobic003G134700--Sobic003G128550 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic005G108225--Sobic005G098900 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic005G108225--Sobic010G168000 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G108225--Sobic005G127900 Sobic008G047200 Sobic008G047200 Sobic005G108225--Sobic008G047200 Sobic010G248500 Sobic010G248500 Sobic005G108225--Sobic010G248500 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic005G108225--Sobic002G101100 Sobic005G108225--Sobic001G318100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic005G108225--Sobic010G165900 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G108225--Sobic008G120132 Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic001G091200--Sobic004G146100 Sobic003G208500 Sobic003G208500 Sobic001G091200--Sobic003G208500 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic001G091200--Sobic003G388000 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic001G091200--Sobic005G159801 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic001G091200--Sobic001G260300 Sobic001G475000 Sobic001G475000 Sobic001G091200--Sobic001G475000 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic001G091200--Sobic001G273000 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic001G091200--Sobic008G168700 Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic001G091200--Sobic005G104300 Sobic002G393900 Sobic002G393900 Sobic002G393800--Sobic002G393900 Sobic010G098350 Sobic010G098350 Sobic002G393800--Sobic010G098350 Sobic002G393800--Sobic001G192250 Sobic002G393800--Sobic010G102366 Sobic002G393800--Sobic001G267000 Sobic002G393800--Sobic003G134700 Sobic002G393800--Sobic003G128550 Sobic002G393800--Sobic009G074250 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic002G393800--Sobic010G137100 Sobic009G093800--Sobic009G097900 Sobic009G093800--Sobic003G134700 Sobic009G093800--Sobic003G112001 Sobic009G093800--Sobic009G074250 Sobic009G106000 Sobic009G106000 Sobic009G093800--Sobic009G106000 Sobic009G093800--Sobic008G178450 Sobic009G093800--Sobic005G127900 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic009G093800--Sobic009G070250 Sobic009G051800 Sobic009G051800 Sobic009G093800--Sobic009G051800
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