Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G393800.1
Synonym Sb02g040910, RPS3, RPM1
Functional annotation MLA10, putative, expressed
UniProt C5X3E5
Pfam PF00085 PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF490
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology K13457; RPM1, disease resistance protein RPM1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g37740.1 : resistance protein LR10, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G393900 NB-ARC domain containing protein, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
2 Sobic.010G098350 - -
3 Sobic.001G192250 - -
4 Sobic.010G102366 - -
5 Sobic.001G267000 - -
6 Sobic.003G134700 exonuclease, putative, expressed -
7 Sobic.003G128550 - -
8 Sobic.009G074250 - -
9 Sobic.010G137100 - -
10 Sobic.002G321100 NB-ARC domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G075500 - -
12 Sobic.001G178800 - -
13 Sobic.003G112001 - -
14 Sobic.005G117200 - -
15 Sobic.009G181300 TKL_IRAK_DUF26-la.1 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
16 Sobic.004G158050 - -
17 Sobic.005G193600 3 Ketoacyl CoA synthetase 2 KCS2 (fatty acid elongase) (At)(PubMedID : 27208977)@3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
18 Sobic.001G339300 expressed protein -
19 Sobic.005G110439 - -
20 Sobic.007G129201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G393800 Sobic002G393800 Sobic002G393900 Sobic002G393900 Sobic002G393800--Sobic002G393900 Sobic010G098350 Sobic010G098350 Sobic002G393800--Sobic010G098350 Sobic001G192250 Sobic001G192250 Sobic002G393800--Sobic001G192250 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic002G393800--Sobic010G102366 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic002G393800--Sobic001G267000 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic002G393800--Sobic003G134700 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic002G393800--Sobic003G128550 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic002G393800--Sobic009G074250 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic002G393800--Sobic010G137100 Sobic003G151100 Sobic003G151100 Sobic002G393900--Sobic003G151100 Sobic002G393900--Sobic002G393800 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic002G393900--Sobic007G129201 Sobic006G243200 Sobic006G243200 Sobic002G393900--Sobic006G243200 Sobic006G164300 Sobic006G164300 Sobic002G393900--Sobic006G164300 Sobic003G096500 Sobic003G096500 Sobic002G393900--Sobic003G096500 Sobic001G182850 Sobic001G182850 Sobic002G393900--Sobic001G182850 Sobic006G123500 Sobic006G123500 Sobic002G393900--Sobic006G123500 Sobic005G203300 Sobic005G203300 Sobic002G393900--Sobic005G203300 Sobic005G133166 Sobic005G133166 Sobic010G098350--Sobic005G133166 Sobic006G045000 Sobic006G045000 Sobic010G098350--Sobic006G045000 Sobic004G209500 Sobic004G209500 Sobic010G098350--Sobic004G209500 Sobic001G233200 Sobic001G233200 Sobic010G098350--Sobic001G233200 Sobic005G085500 Sobic005G085500 Sobic010G098350--Sobic005G085500 Sobic002G423600 Sobic002G423600 Sobic010G098350--Sobic002G423600 Sobic004G161800 Sobic004G161800 Sobic010G098350--Sobic004G161800 Sobic002G041800 Sobic002G041800 Sobic010G098350--Sobic002G041800 Sobic001G387000 Sobic001G387000 Sobic010G098350--Sobic001G387000 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic001G192250--Sobic009G097900 Sobic001G192250--Sobic001G267000 Sobic001G178800 Sobic001G178800 Sobic001G192250--Sobic001G178800 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic001G192250--Sobic003G112001 Sobic001G192250--Sobic003G134700 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic001G192250--Sobic005G108225 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G192250--Sobic001G091200 Sobic001G192250--Sobic002G393800 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic001G192250--Sobic009G093800 Sobic010G102366--Sobic010G137100 Sobic010G102366--Sobic003G134700 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic010G102366--Sobic010G135250 Sobic004G350800 Sobic004G350800 Sobic010G102366--Sobic004G350800 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic010G102366--Sobic004G340300 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G102366--Sobic010G132900 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic010G102366--Sobic003G351401 Sobic010G102366--Sobic003G112001 Sobic002G286300 Sobic002G286300 Sobic010G102366--Sobic002G286300 Sobic001G267000--Sobic003G128550 Sobic001G267000--Sobic001G178800 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic001G267000--Sobic009G070300 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic001G267000--Sobic005G115400 Sobic005G117200 Sobic005G117200 Sobic001G267000--Sobic005G117200 Sobic001G267000--Sobic009G097900 Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic001G267000--Sobic002G066901 Sobic001G267000--Sobic001G192250 Sobic009G128000 Sobic009G128000 Sobic001G267000--Sobic009G128000 Sobic003G134700--Sobic003G112001 Sobic003G134700--Sobic009G097900 Sobic003G134700--Sobic009G093800 Sobic003G134700--Sobic009G074250 Sobic003G134700--Sobic010G102366 Sobic008G178450 Sobic008G178450 Sobic003G134700--Sobic008G178450 Sobic003G134700--Sobic001G178800 Sobic003G115400 Sobic003G115400 Sobic003G134700--Sobic003G115400 Sobic003G134700--Sobic003G128550 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic003G128550--Sobic009G107020 Sobic003G128550--Sobic009G074250 Sobic003G128550--Sobic005G115400 Sobic003G128550--Sobic001G267000 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic003G128550--Sobic010G115900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic003G128550--Sobic009G214800 Sobic010G214400 Sobic010G214400 Sobic003G128550--Sobic010G214400 Sobic002G413900 Sobic002G413900 Sobic003G128550--Sobic002G413900 Sobic003G128550--Sobic009G070300 Sobic009G074250--Sobic003G112001 Sobic009G074250--Sobic009G097900 Sobic009G074250--Sobic009G107020 Sobic009G074250--Sobic003G128550 Sobic009G074250--Sobic003G134700 Sobic009G074250--Sobic009G093800 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic009G074250--Sobic010G143000 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic009G074250--Sobic008G120132 Sobic009G074250--Sobic001G178800 Sobic010G137100--Sobic010G102366 Sobic010G137100--Sobic010G135250 Sobic010G137100--Sobic002G286300 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic010G137100--Sobic003G207500 Sobic010G137100--Sobic004G340300 Sobic010G137100--Sobic010G132900 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G137100--Sobic010G163400 Sobic010G137100--Sobic001G182850 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic010G137100--Sobic003G251100
Octagon: transcription factors


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