Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G339300.1
Synonym Sb01g032640
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WWL8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002845
Brachypodium KQK21303
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G158050 - -
2 Sobic.002G195300 - -
3 Sobic.006G003700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
4 Sobic.001G381300 WRKY79, expressed -
5 Sobic.009G174500 receptor-like protein kinase, putative, expressed -
6 Sobic.001G339200 - -
7 Sobic.005G186500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSCP1 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K08249: hydroxymandelonitrile lyase
8 Sobic.002G249600 OsWAK80 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
9 Sobic.007G215700 OsWAK73 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
10 Sobic.005G193500 receptor-like kinase, putative, expressed -
11 Sobic.005G193600 3 Ketoacyl CoA synthetase 2 KCS2 (fatty acid elongase) (At)(PubMedID : 27208977)@3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
12 Sobic.007G129201 - -
13 Sobic.003G098700 expressed protein -
14 Sobic.004G223500 OsWAK14 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
15 Sobic.007G037800 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.004G018900 terpene synthase, putative, expressed K15086: (3S)-linalool synthase
17 Sobic.006G229500 receptor-like kinase, putative, expressed -
18 Sobic.004G019400 Protein terpene synthase 14 (At)(PubMedID : 27208977)@"Protein terpene synthase 14, S-linalool synthase (Os)"(PubMedID : 27208977)@terpene synthase, putative, expressed -
19 Sobic.004G245300 - -
20 Sobic.001G040400 EF hand family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G339300 Sobic001G339300 Sobic004G158050 Sobic004G158050 Sobic001G339300--Sobic004G158050 Sobic002G195300 Sobic002G195300 Sobic001G339300--Sobic002G195300 Sobic006G003700 Sobic006G003700 Sobic001G339300--Sobic006G003700 Sobic001G381300 Sobic001G381300 Sobic001G339300--Sobic001G381300 Sobic009G174500 Sobic009G174500 Sobic001G339300--Sobic009G174500 Sobic001G339200 Sobic001G339200 Sobic001G339300--Sobic001G339200 Sobic005G186500 Sobic005G186500 Sobic001G339300--Sobic005G186500 Sobic002G249600 Sobic002G249600 Sobic001G339300--Sobic002G249600 Sobic007G215700 Sobic007G215700 Sobic001G339300--Sobic007G215700 Sobic004G158050--Sobic006G003700 Sobic004G158050--Sobic001G381300 Sobic005G193600 Sobic005G193600 Sobic004G158050--Sobic005G193600 Sobic004G158050--Sobic002G195300 Sobic006G229500 Sobic006G229500 Sobic004G158050--Sobic006G229500 Sobic004G158050--Sobic001G339300 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic004G158050--Sobic007G129201 Sobic007G037800 Sobic007G037800 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Octagon: transcription factors


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