Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G195300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QCE3
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G065500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine protease 1 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.006G003700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
3 Sobic.004G223500 OsWAK14 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
4 Sobic.002G195200 - -
5 Sobic.004G245300 - -
6 Sobic.010G157000 - -
7 Sobic.004G158050 - -
8 Sobic.005G217900 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
9 Sobic.007G215700 OsWAK73 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
10 Sobic.008G060200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G195100 - -
12 Sobic.007G214300 OsWAK14 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
13 Sobic.004G018900 terpene synthase, putative, expressed K15086: (3S)-linalool synthase
14 Sobic.007G037800 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.005G193500 receptor-like kinase, putative, expressed -
16 Sobic.001G339300 expressed protein -
17 Sobic.007G226200 - -
18 Sobic.003G058001 - -
19 Sobic.010G045000 VQ domain containing protein, putative -
20 Sobic.007G129201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G195300 Sobic002G195300 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic002G195300--Sobic005G065500 Sobic006G003700 Sobic006G003700 Sobic002G195300--Sobic006G003700 Sobic004G223500 Sobic004G223500 Sobic002G195300--Sobic004G223500 Sobic002G195200 Sobic002G195200 Sobic002G195300--Sobic002G195200 Sobic004G245300 Sobic004G245300 Sobic002G195300--Sobic004G245300 Sobic010G157000 Sobic010G157000 Sobic002G195300--Sobic010G157000 Sobic004G158050 Sobic004G158050 Sobic002G195300--Sobic004G158050 Sobic005G217900 Sobic005G217900 Sobic002G195300--Sobic005G217900 Sobic007G215700 Sobic007G215700 Sobic002G195300--Sobic007G215700 Sobic005G065500--Sobic004G245300 Sobic005G065500--Sobic005G217900 Sobic005G065500--Sobic010G157000 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic005G065500--Sobic005G167500 Sobic003G058001 Sobic003G058001 Sobic005G065500--Sobic003G058001 Sobic005G065500--Sobic002G195300 Sobic010G038500 Sobic010G038500 Sobic005G065500--Sobic010G038500 Sobic006G006700 Sobic006G006700 Sobic005G065500--Sobic006G006700 Sobic005G065500--Sobic004G223500 Sobic006G003700--Sobic004G158050 Sobic006G229500 Sobic006G229500 Sobic006G003700--Sobic006G229500 Sobic006G003700--Sobic002G195300 Sobic005G193600 Sobic005G193600 Sobic006G003700--Sobic005G193600 Sobic002G169200 Sobic002G169200 Sobic006G003700--Sobic002G169200 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic006G003700--Sobic007G037800 Sobic001G381300 Sobic001G381300 Sobic006G003700--Sobic001G381300 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic006G003700--Sobic005G193500 Sobic001G146500 Sobic001G146500 Sobic006G003700--Sobic001G146500 Sobic004G223500--Sobic002G195300 Sobic004G223500--Sobic005G065500 Sobic004G223500--Sobic004G245300 Sobic004G223500--Sobic005G217900 Sobic007G214300 Sobic007G214300 Sobic004G223500--Sobic007G214300 Sobic004G223500--Sobic005G193500 Sobic004G018900 Sobic004G018900 Sobic004G223500--Sobic004G018900 Sobic004G223500--Sobic006G006700 Sobic004G223500--Sobic002G195200 Sobic002G195100 Sobic002G195100 Sobic002G195200--Sobic002G195100 Sobic002G195200--Sobic004G245300 Sobic002G195200--Sobic007G214300 Sobic002G195200--Sobic002G195300 Sobic007G058800 Sobic007G058800 Sobic002G195200--Sobic007G058800 Sobic002G023000 Sobic002G023000 Sobic002G195200--Sobic002G023000 Sobic002G195200--Sobic005G065500 Sobic004G094600 Sobic004G094600 Sobic002G195200--Sobic004G094600 Sobic002G195200--Sobic007G215700 Sobic004G245300--Sobic005G065500 Sobic009G254600 Sobic009G254600 Sobic004G245300--Sobic009G254600 Sobic004G245300--Sobic002G195200 Sobic004G245300--Sobic002G195100 Sobic004G245300--Sobic004G223500 Sobic004G245300--Sobic004G018900 Sobic004G245300--Sobic007G214300 Sobic004G245300--Sobic002G195300 Sobic004G245300--Sobic010G038500 Sobic010G157000--Sobic003G058001 Sobic010G157000--Sobic005G065500 Sobic010G157000--Sobic005G167500 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic010G157000--Sobic004G210601 Sobic010G157000--Sobic002G195300 Sobic010G157000--Sobic010G038500 Sobic010G157000--Sobic005G217900 Sobic010G100200 Sobic010G100200 Sobic010G157000--Sobic010G100200 Sobic001G098600 Sobic001G098600 Sobic010G157000--Sobic001G098600 Sobic004G158050--Sobic006G003700 Sobic004G158050--Sobic001G381300 Sobic004G158050--Sobic005G193600 Sobic004G158050--Sobic002G195300 Sobic004G158050--Sobic006G229500 Sobic001G339300 Sobic001G339300 Sobic004G158050--Sobic001G339300 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic004G158050--Sobic007G129201 Sobic004G158050--Sobic007G037800 Sobic004G158050--Sobic002G169200 Sobic005G217900--Sobic005G065500 Sobic005G118300 Sobic005G118300 Sobic005G217900--Sobic005G118300 Sobic003G097800 Sobic003G097800 Sobic005G217900--Sobic003G097800 Sobic005G217900--Sobic004G223500 Sobic005G217900--Sobic001G098600 Sobic005G217900--Sobic002G195300 Sobic005G217900--Sobic010G157000 Sobic005G217900--Sobic004G210601 Sobic001G317400 Sobic001G317400 Sobic005G217900--Sobic001G317400 Sobic007G215700--Sobic002G195300 Sobic010G045000 Sobic010G045000 Sobic007G215700--Sobic010G045000 Sobic007G215700--Sobic002G195200 Sobic003G291700 Sobic003G291700 Sobic007G215700--Sobic003G291700 Sobic007G215700--Sobic007G214300 Sobic007G215700--Sobic006G003700 Sobic008G060200 Sobic008G060200 Sobic007G215700--Sobic008G060200 Sobic007G215700--Sobic004G223500 Sobic007G058900 Sobic007G058900 Sobic007G215700--Sobic007G058900
Octagon: transcription factors


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