Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G245300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRD9
Pfam -
Panther DB PTHR35547 PTHR35547:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G065500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine protease 1 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.009G254600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G195200 - -
4 Sobic.002G195100 - -
5 Sobic.004G223500 OsWAK14 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
6 Sobic.004G018900 terpene synthase, putative, expressed K15086: (3S)-linalool synthase
7 Sobic.007G214300 OsWAK14 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
8 Sobic.002G195300 - -
9 Sobic.010G038500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.006G006700 - -
11 Sobic.001G098600 expressed protein -
12 Sobic.010G157000 - -
13 Sobic.001G189100 coatomer subunit beta-1, putative, expressed K17301: COPB1, coatomer subunit beta
14 Sobic.001G189100 coatomer subunit beta-1, putative, expressed K17301: COPB1, coatomer subunit beta
15 Sobic.005G217900 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
16 Sobic.008G081200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peptide transporter PTR3-A, putative, expressed -
17 Sobic.003G237600 expressed protein -
18 Sobic.001G068400 - -
19 Sobic.007G226200 - -
20 Sobic.004G035700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G245300 Sobic004G245300 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic004G245300--Sobic005G065500 Sobic009G254600 Sobic009G254600 Sobic004G245300--Sobic009G254600 Sobic002G195200 Sobic002G195200 Sobic004G245300--Sobic002G195200 Sobic002G195100 Sobic002G195100 Sobic004G245300--Sobic002G195100 Sobic004G223500 Sobic004G223500 Sobic004G245300--Sobic004G223500 Sobic004G018900 Sobic004G018900 Sobic004G245300--Sobic004G018900 Sobic007G214300 Sobic007G214300 Sobic004G245300--Sobic007G214300 Sobic002G195300 Sobic002G195300 Sobic004G245300--Sobic002G195300 Sobic010G038500 Sobic010G038500 Sobic004G245300--Sobic010G038500 Sobic005G065500--Sobic004G245300 Sobic005G217900 Sobic005G217900 Sobic005G065500--Sobic005G217900 Sobic010G157000 Sobic010G157000 Sobic005G065500--Sobic010G157000 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic005G065500--Sobic005G167500 Sobic003G058001 Sobic003G058001 Sobic005G065500--Sobic003G058001 Sobic005G065500--Sobic002G195300 Sobic005G065500--Sobic010G038500 Sobic006G006700 Sobic006G006700 Sobic005G065500--Sobic006G006700 Sobic005G065500--Sobic004G223500 Sobic009G254600--Sobic010G038500 Sobic008G081200 Sobic008G081200 Sobic009G254600--Sobic008G081200 Sobic001G189100 Sobic001G189100 Sobic009G254600--Sobic001G189100 Sobic004G035700 Sobic004G035700 Sobic009G254600--Sobic004G035700 Sobic003G237600 Sobic003G237600 Sobic009G254600--Sobic003G237600 Sobic010G183100 Sobic010G183100 Sobic009G254600--Sobic010G183100 Sobic001G068400 Sobic001G068400 Sobic009G254600--Sobic001G068400 Sobic007G189700 Sobic007G189700 Sobic009G254600--Sobic007G189700 Sobic002G195200--Sobic002G195100 Sobic002G195200--Sobic004G245300 Sobic002G195200--Sobic007G214300 Sobic002G195200--Sobic002G195300 Sobic007G058800 Sobic007G058800 Sobic002G195200--Sobic007G058800 Sobic002G023000 Sobic002G023000 Sobic002G195200--Sobic002G023000 Sobic002G195200--Sobic005G065500 Sobic004G094600 Sobic004G094600 Sobic002G195200--Sobic004G094600 Sobic007G215700 Sobic007G215700 Sobic002G195200--Sobic007G215700 Sobic002G195100--Sobic006G006700 Sobic002G195100--Sobic002G195200 Sobic002G195100--Sobic004G245300 Sobic002G195100--Sobic005G065500 Sobic002G195100--Sobic002G023000 Sobic002G195100--Sobic003G237600 Sobic002G195100--Sobic001G189100 Sobic002G195100--Sobic007G214300 Sobic004G223500--Sobic002G195300 Sobic004G223500--Sobic005G065500 Sobic004G223500--Sobic004G245300 Sobic004G223500--Sobic005G217900 Sobic004G223500--Sobic007G214300 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic004G223500--Sobic005G193500 Sobic004G223500--Sobic004G018900 Sobic004G223500--Sobic006G006700 Sobic004G223500--Sobic002G195200 Sobic010G171900 Sobic010G171900 Sobic004G018900--Sobic010G171900 Sobic006G027500 Sobic006G027500 Sobic004G018900--Sobic006G027500 Sobic005G186500 Sobic005G186500 Sobic004G018900--Sobic005G186500 Sobic008G080600 Sobic008G080600 Sobic004G018900--Sobic008G080600 Sobic004G018900--Sobic004G245300 Sobic008G060200 Sobic008G060200 Sobic004G018900--Sobic008G060200 Sobic004G018900--Sobic005G065500 Sobic006G180800 Sobic006G180800 Sobic004G018900--Sobic006G180800 Sobic004G019100 Sobic004G019100 Sobic004G018900--Sobic004G019100 Sobic007G214300--Sobic002G195200 Sobic007G214300--Sobic004G245300 Sobic007G214300--Sobic005G065500 Sobic007G214300--Sobic006G006700 Sobic007G214300--Sobic002G195100 Sobic007G214300--Sobic004G223500 Sobic007G214300--Sobic002G195300 Sobic003G231800 Sobic003G231800 Sobic007G214300--Sobic003G231800 Sobic007G004850 Sobic007G004850 Sobic007G214300--Sobic007G004850 Sobic002G195300--Sobic005G065500 Sobic006G003700 Sobic006G003700 Sobic002G195300--Sobic006G003700 Sobic002G195300--Sobic004G223500 Sobic002G195300--Sobic002G195200 Sobic002G195300--Sobic004G245300 Sobic002G195300--Sobic010G157000 Sobic004G158050 Sobic004G158050 Sobic002G195300--Sobic004G158050 Sobic002G195300--Sobic005G217900 Sobic002G195300--Sobic007G215700 Sobic010G038500--Sobic008G081200 Sobic010G038500--Sobic009G254600 Sobic010G038500--Sobic001G068400 Sobic002G040100 Sobic002G040100 Sobic010G038500--Sobic002G040100 Sobic010G038500--Sobic004G035700 Sobic010G038500--Sobic010G183100 Sobic002G233300 Sobic002G233300 Sobic010G038500--Sobic002G233300 Sobic003G199800 Sobic003G199800 Sobic010G038500--Sobic003G199800 Sobic003G131000 Sobic003G131000 Sobic010G038500--Sobic003G131000
Octagon: transcription factors


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