Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G065500.1
Synonym Sb05g005530, SAG12
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
cysteine protease 1 precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RH26
Pfam PF08246 PF00112
Panther DB PTHR12411 PTHR12411:SF401
NCBI CDD KOG1543; Cysteine proteinase Cathepsin L
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G49340 : Cysteine proteinases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g17540.1 : vignain precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029759 , Zm00025a029757 , Zm00025a041837
Brachypodium KQJ90836
Barley -
Wheat TraesCS5D02G401300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G245300 - -
2 Sobic.005G217900 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
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20 Sobic.003G131000 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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