Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G019400.2,Sobic.004G019400.1
Synonym Sb04g001810, ATTPS14, TPS14
Functional annotation Protein terpene synthase 14 (At) (PubMedID : 27208977)
"Protein terpene synthase 14, S-linalool synthase (Os)" (PubMedID : 27208977)
terpene synthase, putative, expressed
UniProt A0A194YM98 , A0A194YMB1
Pfam PF01397 PF03936
Panther DB PTHR31225 PTHR31225:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016829; lyase activity GO:0010333terpene synthase activity GO:0008152metabolic process GO:0000287magnesium ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G61680 : terpene synthase 14
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02930.1 : terpene synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034932 , Zm00025a034929 , Zm00025a018761
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G012110.5 , HORVU6Hr1G012110.6 , HORVU6Hr1G012110.1 , HORVU6Hr1G012110.3 , HORVU6Hr1G012110.2 , HORVU6Hr1G012110.9 , HORVU6Hr1G012110.8 , HORVU6Hr1G012110.7 , HORVU6Hr1G012110.11 , HORVU6Hr1G012110.10
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G186500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSCP1 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K08249: hydroxymandelonitrile lyase
2 Sobic.007G037800 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
3 Sobic.001G201800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transferase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G096500 protein kinase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G060200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.009G202400 expressed protein -
7 Sobic.008G060300 transcription factor(PubMedID : 30367619)@WRKY45, expressed -
8 Sobic.005G193500 receptor-like kinase, putative, expressed -
9 Sobic.002G108400 cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.005G193600 3 Ketoacyl CoA synthetase 2 KCS2 (fatty acid elongase) (At)(PubMedID : 27208977)@3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
11 Sobic.009G252100 expressed protein -
12 Sobic.001G198700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G180800 - -
14 Sobic.008G080600 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
15 Sobic.005G093300 - -
16 Sobic.004G343100 YCF37, putative, expressed -
17 Sobic.007G129201 - -
18 Sobic.004G078600 lipoxygenase, putative, expressed K00454: lipoxygenase
19 Sobic.005G167500 resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G007600 polyphenol oxidase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G019400 Sobic004G019400 Sobic005G186500 Sobic005G186500 Sobic004G019400--Sobic005G186500 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic004G019400--Sobic007G037800 Sobic001G201800 Sobic001G201800 Sobic004G019400--Sobic001G201800 Sobic003G096500 Sobic003G096500 Sobic004G019400--Sobic003G096500 Sobic008G060200 Sobic008G060200 Sobic004G019400--Sobic008G060200 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic004G019400--Sobic009G202400 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic004G019400--Sobic008G060300 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic004G019400--Sobic005G193500 Sobic002G108400 Sobic002G108400 Sobic004G019400--Sobic002G108400 Sobic006G005400 Sobic006G005400 Sobic005G186500--Sobic006G005400 Sobic006G007100 Sobic006G007100 Sobic005G186500--Sobic006G007100 Sobic006G007600 Sobic006G007600 Sobic005G186500--Sobic006G007600 Sobic010G171900 Sobic010G171900 Sobic005G186500--Sobic010G171900 Sobic006G027500 Sobic006G027500 Sobic005G186500--Sobic006G027500 Sobic004G019100 Sobic004G019100 Sobic005G186500--Sobic004G019100 Sobic004G018900 Sobic004G018900 Sobic005G186500--Sobic004G018900 Sobic005G219100 Sobic005G219100 Sobic005G186500--Sobic005G219100 Sobic005G186500--Sobic004G019400 Sobic009G252100 Sobic009G252100 Sobic007G037800--Sobic009G252100 Sobic007G037800--Sobic009G202400 Sobic007G037800--Sobic004G019400 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic007G037800--Sobic004G210601 Sobic007G037800--Sobic008G060200 Sobic007G037800--Sobic008G060300 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic007G037800--Sobic005G093300 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic007G037800--Sobic007G129201 Sobic007G037800--Sobic005G193500 Sobic004G078600 Sobic004G078600 Sobic001G201800--Sobic004G078600 Sobic009G115400 Sobic009G115400 Sobic001G201800--Sobic009G115400 Sobic002G423600 Sobic002G423600 Sobic001G201800--Sobic002G423600 Sobic001G012000 Sobic001G012000 Sobic001G201800--Sobic001G012000 Sobic001G201800--Sobic009G252100 Sobic002G202700 Sobic002G202700 Sobic001G201800--Sobic002G202700 Sobic006G045000 Sobic006G045000 Sobic001G201800--Sobic006G045000 Sobic001G056400 Sobic001G056400 Sobic001G201800--Sobic001G056400 Sobic001G201800--Sobic002G108400 Sobic006G060800 Sobic006G060800 Sobic003G096500--Sobic006G060800 Sobic003G096500--Sobic001G201800 Sobic003G096500--Sobic004G019400 Sobic003G096500--Sobic004G078600 Sobic003G096500--Sobic009G252100 Sobic003G096500--Sobic008G060300 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic003G096500--Sobic004G063200 Sobic005G193600 Sobic005G193600 Sobic003G096500--Sobic005G193600 Sobic003G410900 Sobic003G410900 Sobic003G096500--Sobic003G410900 Sobic008G060200--Sobic004G019400 Sobic008G060200--Sobic007G037800 Sobic008G060200--Sobic009G202400 Sobic008G060200--Sobic005G186500 Sobic008G060200--Sobic009G252100 Sobic010G045000 Sobic010G045000 Sobic008G060200--Sobic010G045000 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic008G060200--Sobic005G065500 Sobic002G195300 Sobic002G195300 Sobic008G060200--Sobic002G195300 Sobic008G060200--Sobic007G129201 Sobic009G202400--Sobic007G037800 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic009G202400--Sobic002G281000 Sobic009G202400--Sobic004G210601 Sobic005G097800 Sobic005G097800 Sobic009G202400--Sobic005G097800 Sobic005G192600 Sobic005G192600 Sobic009G202400--Sobic005G192600 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic009G202400--Sobic005G167500 Sobic009G202400--Sobic005G093300 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic009G202400--Sobic008G063100 Sobic009G202400--Sobic004G019400 Sobic008G060300--Sobic006G060800 Sobic008G060300--Sobic009G252100 Sobic008G060300--Sobic005G193600 Sobic008G060300--Sobic001G201800 Sobic008G060300--Sobic002G202700 Sobic008G060300--Sobic007G129201 Sobic008G060300--Sobic005G193500 Sobic004G195800 Sobic004G195800 Sobic008G060300--Sobic004G195800 Sobic003G366100 Sobic003G366100 Sobic008G060300--Sobic003G366100 Sobic005G193500--Sobic005G193600 Sobic005G193500--Sobic008G060300 Sobic005G193500--Sobic009G252100 Sobic005G193500--Sobic007G129201 Sobic005G193500--Sobic007G037800 Sobic005G193500--Sobic004G019400 Sobic005G193500--Sobic002G108400 Sobic005G193500--Sobic005G186500 Sobic005G193500--Sobic003G366100 Sobic002G108400--Sobic002G202700 Sobic002G108400--Sobic009G115400 Sobic002G108400--Sobic006G005400 Sobic002G108400--Sobic001G201800 Sobic002G108400--Sobic006G007100 Sobic010G225500 Sobic010G225500 Sobic002G108400--Sobic010G225500 Sobic002G108400--Sobic006G007600 Sobic002G108400--Sobic005G186500 Sobic006G005500 Sobic006G005500 Sobic002G108400--Sobic006G005500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.