Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G202400.1
Synonym Sb09g025990
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z1C3
Pfam PF05553
Panther DB PTHR33265 PTHR33265:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G52140 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g44420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044323 , Zm00025a037976
Brachypodium PNT70895
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G202400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G037800 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.002G281000 aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
3 Sobic.004G210601 - -
4 Sobic.005G097800 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@dirigent, putative, expressed -
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7 Sobic.005G093300 - -
8 Sobic.008G063100 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
9 Sobic.004G019400 Protein terpene synthase 14 (At)(PubMedID : 27208977)@"Protein terpene synthase 14, S-linalool synthase (Os)"(PubMedID : 27208977)@terpene synthase, putative, expressed -
10 Sobic.004G197800 expressed protein -
11 Sobic.002G265400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed K13691: pathogen-inducible salicylic acid glucosyltransferase
12 Sobic.001G198700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G225600 - -
14 Sobic.003G058001 - -
15 Sobic.001G019300 WD40-like Beta Propeller Repeat family protein, expressed -
16 Sobic.008G060200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.007G129201 - -
18 Sobic.004G063200 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G036350 - -
20 Sobic.002G337001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic009G202400--Sobic007G037800 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic009G202400--Sobic002G281000 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic009G202400--Sobic004G210601 Sobic005G097800 Sobic005G097800 Sobic009G202400--Sobic005G097800 Sobic005G192600 Sobic005G192600 Sobic009G202400--Sobic005G192600 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic009G202400--Sobic005G167500 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic009G202400--Sobic005G093300 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic009G202400--Sobic008G063100 Sobic004G019400 Sobic004G019400 Sobic009G202400--Sobic004G019400 Sobic009G252100 Sobic009G252100 Sobic007G037800--Sobic009G252100 Sobic007G037800--Sobic009G202400 Sobic007G037800--Sobic004G019400 Sobic007G037800--Sobic004G210601 Sobic008G060200 Sobic008G060200 Sobic007G037800--Sobic008G060200 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic007G037800--Sobic008G060300 Sobic007G037800--Sobic005G093300 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic007G037800--Sobic007G129201 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic007G037800--Sobic005G193500 Sobic001G525900 Sobic001G525900 Sobic002G281000--Sobic001G525900 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic002G281000--Sobic001G019300 Sobic002G281000--Sobic008G063100 Sobic002G281000--Sobic009G202400 Sobic002G195700 Sobic002G195700 Sobic002G281000--Sobic002G195700 Sobic002G281000--Sobic005G097800 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic002G281000--Sobic004G063200 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic002G281000--Sobic001G404500 Sobic005G021600 Sobic005G021600 Sobic002G281000--Sobic005G021600 Sobic004G210601--Sobic005G167500 Sobic004G210601--Sobic009G202400 Sobic003G058001 Sobic003G058001 Sobic004G210601--Sobic003G058001 Sobic004G210601--Sobic007G037800 Sobic010G157000 Sobic010G157000 Sobic004G210601--Sobic010G157000 Sobic008G036300 Sobic008G036300 Sobic004G210601--Sobic008G036300 Sobic003G097800 Sobic003G097800 Sobic004G210601--Sobic003G097800 Sobic008G036350 Sobic008G036350 Sobic004G210601--Sobic008G036350 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic004G210601--Sobic005G065500 Sobic005G097800--Sobic002G281000 Sobic005G097800--Sobic009G202400 Sobic005G220900 Sobic005G220900 Sobic005G097800--Sobic005G220900 Sobic005G097800--Sobic001G404500 Sobic002G265400 Sobic002G265400 Sobic005G097800--Sobic002G265400 Sobic003G292600 Sobic003G292600 Sobic005G097800--Sobic003G292600 Sobic005G097800--Sobic008G063100 Sobic010G225600 Sobic010G225600 Sobic005G097800--Sobic010G225600 Sobic006G135100 Sobic006G135100 Sobic005G097800--Sobic006G135100 Sobic005G192600--Sobic005G167500 Sobic004G182700 Sobic004G182700 Sobic005G192600--Sobic004G182700 Sobic005G192600--Sobic008G036300 Sobic005G192600--Sobic008G036350 Sobic005G192600--Sobic009G202400 Sobic001G498300 Sobic001G498300 Sobic005G192600--Sobic001G498300 Sobic001G198800 Sobic001G198800 Sobic005G192600--Sobic001G198800 Sobic005G192600--Sobic003G058001 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic005G192600--Sobic003G106500 Sobic005G167500--Sobic008G036300 Sobic005G167500--Sobic003G058001 Sobic005G167500--Sobic004G182700 Sobic005G167500--Sobic005G192600 Sobic005G167500--Sobic008G036350 Sobic005G167500--Sobic004G210601 Sobic005G167500--Sobic001G198800 Sobic005G167500--Sobic005G065500 Sobic005G167500--Sobic009G202400 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic005G093300--Sobic001G198700 Sobic005G093300--Sobic009G202400 Sobic005G093300--Sobic007G037800 Sobic002G257100 Sobic002G257100 Sobic005G093300--Sobic002G257100 Sobic005G093300--Sobic002G265400 Sobic001G201800 Sobic001G201800 Sobic005G093300--Sobic001G201800 Sobic005G093300--Sobic009G252100 Sobic005G093300--Sobic001G019300 Sobic002G366100 Sobic002G366100 Sobic005G093300--Sobic002G366100 Sobic004G343100 Sobic004G343100 Sobic008G063100--Sobic004G343100 Sobic008G063100--Sobic005G021600 Sobic008G063100--Sobic002G281000 Sobic008G063100--Sobic001G404500 Sobic008G063100--Sobic001G198700 Sobic008G063100--Sobic004G063200 Sobic008G063100--Sobic002G195700 Sobic008G063100--Sobic009G202400 Sobic005G175600 Sobic005G175600 Sobic008G063100--Sobic005G175600 Sobic005G186500 Sobic005G186500 Sobic004G019400--Sobic005G186500 Sobic004G019400--Sobic007G037800 Sobic004G019400--Sobic001G201800 Sobic003G096500 Sobic003G096500 Sobic004G019400--Sobic003G096500 Sobic004G019400--Sobic008G060200 Sobic004G019400--Sobic009G202400 Sobic004G019400--Sobic008G060300 Sobic004G019400--Sobic005G193500 Sobic002G108400 Sobic002G108400 Sobic004G019400--Sobic002G108400
Octagon: transcription factors


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