Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G197800.1
Synonym Sb04g024460
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XWE7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g37610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031780
Brachypodium KQK00097
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G197800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G202400 expressed protein -
2 Sobic.007G037800 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
3 Sobic.001G198700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G093300 - -
5 Sobic.005G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@dirigent, putative, expressed -
6 Sobic.004G210601 - -
7 Sobic.003G106500 expressed protein -
8 Sobic.005G167500 resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G265400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed K13691: pathogen-inducible salicylic acid glucosyltransferase
10 Sobic.007G129201 - -
11 Sobic.004G019400 Protein terpene synthase 14 (At)(PubMedID : 27208977)@"Protein terpene synthase 14, S-linalool synthase (Os)"(PubMedID : 27208977)@terpene synthase, putative, expressed -
12 Sobic.002G281000 aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
13 Sobic.001G019300 WD40-like Beta Propeller Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.009G252100 expressed protein -
15 Sobic.002G337001 - -
16 Sobic.009G150000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.001G291500 - -
18 Sobic.004G201400 cadmium tolerance factor, putative, expressed -
19 Sobic.005G190900 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.008G036350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G197800 Sobic004G197800 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic004G197800--Sobic009G202400 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic004G197800--Sobic007G037800 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic004G197800--Sobic001G198700 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic004G197800--Sobic005G093300 Sobic005G192600 Sobic005G192600 Sobic004G197800--Sobic005G192600 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic004G197800--Sobic004G210601 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic004G197800--Sobic003G106500 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic004G197800--Sobic005G167500 Sobic002G265400 Sobic002G265400 Sobic004G197800--Sobic002G265400 Sobic009G202400--Sobic007G037800 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic009G202400--Sobic002G281000 Sobic009G202400--Sobic004G210601 Sobic005G097800 Sobic005G097800 Sobic009G202400--Sobic005G097800 Sobic009G202400--Sobic005G192600 Sobic009G202400--Sobic005G167500 Sobic009G202400--Sobic005G093300 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic009G202400--Sobic008G063100 Sobic004G019400 Sobic004G019400 Sobic009G202400--Sobic004G019400 Sobic009G252100 Sobic009G252100 Sobic007G037800--Sobic009G252100 Sobic007G037800--Sobic009G202400 Sobic007G037800--Sobic004G019400 Sobic007G037800--Sobic004G210601 Sobic008G060200 Sobic008G060200 Sobic007G037800--Sobic008G060200 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic007G037800--Sobic008G060300 Sobic007G037800--Sobic005G093300 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic007G037800--Sobic007G129201 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic007G037800--Sobic005G193500 Sobic001G198700--Sobic003G106500 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic001G198700--Sobic001G019300 Sobic001G198700--Sobic002G265400 Sobic002G195700 Sobic002G195700 Sobic001G198700--Sobic002G195700 Sobic001G198700--Sobic008G063100 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic001G198700--Sobic004G063200 Sobic001G198700--Sobic005G093300 Sobic002G371900 Sobic002G371900 Sobic001G198700--Sobic002G371900 Sobic004G078600 Sobic004G078600 Sobic001G198700--Sobic004G078600 Sobic005G093300--Sobic001G198700 Sobic005G093300--Sobic009G202400 Sobic005G093300--Sobic007G037800 Sobic002G257100 Sobic002G257100 Sobic005G093300--Sobic002G257100 Sobic005G093300--Sobic002G265400 Sobic001G201800 Sobic001G201800 Sobic005G093300--Sobic001G201800 Sobic005G093300--Sobic009G252100 Sobic005G093300--Sobic001G019300 Sobic002G366100 Sobic002G366100 Sobic005G093300--Sobic002G366100 Sobic005G192600--Sobic005G167500 Sobic004G182700 Sobic004G182700 Sobic005G192600--Sobic004G182700 Sobic008G036300 Sobic008G036300 Sobic005G192600--Sobic008G036300 Sobic008G036350 Sobic008G036350 Sobic005G192600--Sobic008G036350 Sobic005G192600--Sobic009G202400 Sobic001G498300 Sobic001G498300 Sobic005G192600--Sobic001G498300 Sobic001G198800 Sobic001G198800 Sobic005G192600--Sobic001G198800 Sobic003G058001 Sobic003G058001 Sobic005G192600--Sobic003G058001 Sobic005G192600--Sobic003G106500 Sobic004G210601--Sobic005G167500 Sobic004G210601--Sobic009G202400 Sobic004G210601--Sobic003G058001 Sobic004G210601--Sobic007G037800 Sobic010G157000 Sobic010G157000 Sobic004G210601--Sobic010G157000 Sobic004G210601--Sobic008G036300 Sobic003G097800 Sobic003G097800 Sobic004G210601--Sobic003G097800 Sobic004G210601--Sobic008G036350 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic004G210601--Sobic005G065500 Sobic003G106500--Sobic001G198700 Sobic008G073400 Sobic008G073400 Sobic003G106500--Sobic008G073400 Sobic002G001800 Sobic002G001800 Sobic003G106500--Sobic002G001800 Sobic003G106500--Sobic002G371900 Sobic003G106500--Sobic001G019300 Sobic005G190900 Sobic005G190900 Sobic003G106500--Sobic005G190900 Sobic003G106500--Sobic002G281000 Sobic003G106500--Sobic005G192600 Sobic003G106500--Sobic002G195700 Sobic005G167500--Sobic008G036300 Sobic005G167500--Sobic003G058001 Sobic005G167500--Sobic004G182700 Sobic005G167500--Sobic005G192600 Sobic005G167500--Sobic008G036350 Sobic005G167500--Sobic004G210601 Sobic005G167500--Sobic001G198800 Sobic005G167500--Sobic005G065500 Sobic005G167500--Sobic009G202400 Sobic002G265400--Sobic001G019300 Sobic002G265400--Sobic004G063200 Sobic005G063900 Sobic005G063900 Sobic002G265400--Sobic005G063900 Sobic002G265400--Sobic002G281000 Sobic002G265400--Sobic001G198700 Sobic002G265400--Sobic005G190900 Sobic002G265400--Sobic009G202400 Sobic002G265400--Sobic002G371900 Sobic002G265400--Sobic009G252100
Octagon: transcription factors


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