Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G150000.1,Sobic.009G150000.2
Synonym Sb09g021420
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt A0A1B6P8L6 , A0A1B6P8M0
Pfam PF06749
Panther DB PTHR31769 PTHR31769:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G17210 : Protein of unknown function (DUF1218)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g35930.1,LOC_Os05g35830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043853
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1A02G270900 , TraesCS1D02G271200 , TraesCS1D02G271100 , TraesCS1B02G281200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G207000 protein kinase domain containing protein, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
2 Sobic.004G197800 expressed protein -
3 Sobic.004G019100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@terpene synthase, putative, expressed K15086: (3S)-linalool synthase
4 Sobic.001G291500 - -
5 Sobic.006G027500 terpene synthase, putative, expressed -
6 Sobic.010G171900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate oxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@L-ascorbate oxidase precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G265400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed K13691: pathogen-inducible salicylic acid glucosyltransferase
8 Sobic.005G119100 OsFBX70 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G129201 - -
10 Sobic.002G371900 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G190900 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.003G098700 expressed protein -
13 Sobic.001G432500 expressed protein -
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15 Sobic.005G118300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G093300 - -
17 Sobic.001G024500 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G037800 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.005G021950 - -
20 Sobic.004G210601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G150000 Sobic009G150000 Sobic005G207000 Sobic005G207000 Sobic009G150000--Sobic005G207000 Sobic004G197800 Sobic004G197800 Sobic009G150000--Sobic004G197800 Sobic004G019100 Sobic004G019100 Sobic009G150000--Sobic004G019100 Sobic001G291500 Sobic001G291500 Sobic009G150000--Sobic001G291500 Sobic006G027500 Sobic006G027500 Sobic009G150000--Sobic006G027500 Sobic010G171900 Sobic010G171900 Sobic009G150000--Sobic010G171900 Sobic002G265400 Sobic002G265400 Sobic009G150000--Sobic002G265400 Sobic005G119100 Sobic005G119100 Sobic009G150000--Sobic005G119100 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic009G150000--Sobic007G129201 Sobic005G207000--Sobic005G119100 Sobic009G252100 Sobic009G252100 Sobic005G207000--Sobic009G252100 Sobic005G207000--Sobic004G019100 Sobic005G207000--Sobic001G291500 Sobic005G207000--Sobic002G265400 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic005G207000--Sobic007G037800 Sobic005G207000--Sobic007G129201 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic005G207000--Sobic008G060300 Sobic006G005400 Sobic006G005400 Sobic005G207000--Sobic006G005400 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic004G197800--Sobic009G202400 Sobic004G197800--Sobic007G037800 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic004G197800--Sobic001G198700 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic004G197800--Sobic005G093300 Sobic005G192600 Sobic005G192600 Sobic004G197800--Sobic005G192600 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic004G197800--Sobic004G210601 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic004G197800--Sobic003G106500 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic004G197800--Sobic005G167500 Sobic004G197800--Sobic002G265400 Sobic006G007100 Sobic006G007100 Sobic004G019100--Sobic006G007100 Sobic004G019100--Sobic006G005400 Sobic004G019100--Sobic001G291500 Sobic005G219100 Sobic005G219100 Sobic004G019100--Sobic005G219100 Sobic005G186500 Sobic005G186500 Sobic004G019100--Sobic005G186500 Sobic004G019100--Sobic006G027500 Sobic006G007600 Sobic006G007600 Sobic004G019100--Sobic006G007600 Sobic005G219000 Sobic005G219000 Sobic004G019100--Sobic005G219000 Sobic003G388400 Sobic003G388400 Sobic004G019100--Sobic003G388400 Sobic001G291500--Sobic006G007100 Sobic001G291500--Sobic005G219100 Sobic001G291500--Sobic005G219000 Sobic001G291500--Sobic006G005400 Sobic001G125700 Sobic001G125700 Sobic001G291500--Sobic001G125700 Sobic006G005500 Sobic006G005500 Sobic001G291500--Sobic006G005500 Sobic006G007300 Sobic006G007300 Sobic001G291500--Sobic006G007300 Sobic001G432500 Sobic001G432500 Sobic001G291500--Sobic001G432500 Sobic008G077800 Sobic008G077800 Sobic001G291500--Sobic008G077800 Sobic006G027500--Sobic010G171900 Sobic004G018900 Sobic004G018900 Sobic006G027500--Sobic004G018900 Sobic006G027500--Sobic005G186500 Sobic008G080600 Sobic008G080600 Sobic006G027500--Sobic008G080600 Sobic006G027500--Sobic006G007100 Sobic006G027500--Sobic004G019100 Sobic006G027500--Sobic006G005400 Sobic006G027500--Sobic001G291500 Sobic006G027500--Sobic006G007600 Sobic010G171900--Sobic004G018900 Sobic010G171900--Sobic006G027500 Sobic010G171900--Sobic005G186500 Sobic010G171900--Sobic008G080600 Sobic010G171900--Sobic006G007100 Sobic010G171900--Sobic004G019100 Sobic010G171900--Sobic006G007600 Sobic010G171900--Sobic006G005400 Sobic010G171900--Sobic001G291500 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic002G265400--Sobic001G019300 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic002G265400--Sobic004G063200 Sobic005G063900 Sobic005G063900 Sobic002G265400--Sobic005G063900 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic002G265400--Sobic002G281000 Sobic002G265400--Sobic001G198700 Sobic005G190900 Sobic005G190900 Sobic002G265400--Sobic005G190900 Sobic002G265400--Sobic009G202400 Sobic002G371900 Sobic002G371900 Sobic002G265400--Sobic002G371900 Sobic002G265400--Sobic009G252100 Sobic005G119100--Sobic005G207000 Sobic003G339900 Sobic003G339900 Sobic005G119100--Sobic003G339900 Sobic007G025900 Sobic007G025900 Sobic005G119100--Sobic007G025900 Sobic004G099700 Sobic004G099700 Sobic005G119100--Sobic004G099700 Sobic005G119100--Sobic007G129201 Sobic005G119100--Sobic008G060300 Sobic003G376200 Sobic003G376200 Sobic005G119100--Sobic003G376200 Sobic004G092000 Sobic004G092000 Sobic005G119100--Sobic004G092000 Sobic006G065900 Sobic006G065900 Sobic005G119100--Sobic006G065900 Sobic007G129201--Sobic008G060300 Sobic007G129201--Sobic009G252100 Sobic005G193600 Sobic005G193600 Sobic007G129201--Sobic005G193600 Sobic003G098700 Sobic003G098700 Sobic007G129201--Sobic003G098700 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic007G129201--Sobic005G193500 Sobic007G129201--Sobic007G037800 Sobic007G129201--Sobic009G202400 Sobic006G060800 Sobic006G060800 Sobic007G129201--Sobic006G060800 Sobic007G129201--Sobic004G019100
Octagon: transcription factors


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