Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G192600.1
Synonym Sb05g024940
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
dirigent, putative, expressed
UniProt Q8L434
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF74
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42510 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g10800.1 : dirigent, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029315
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G076040.3 , HORVU4Hr1G076040.2 , HORVU4Hr1G076040.1 , HORVU4Hr1G076040.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G167500 resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G182700 OsFBK8 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -
3 Sobic.008G036300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G036350 - -
5 Sobic.009G202400 expressed protein -
6 Sobic.001G498300 galactose mutarotase-like, putative, expressed -
7 Sobic.001G198800 -(PubMedID : 26465154)@invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G058001 - -
9 Sobic.003G106500 expressed protein -
10 Sobic.010G218600 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.007G178500 cytochrome P450, putative, expressed -
12 Sobic.008G080600 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
13 Sobic.003G209900 Chorophyll a/b binding protein 2(PubMedID : 26186930)@Chlorophyll a/b-binding protein(PubMedID : 26317421)@Protein chlorophyll a-b binding protein 2 (Os)(PubMedID : 27208977)@chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08912: light-harvesting complex II chlorophyll a/b binding protein 1
14 Sobic.004G343100 YCF37, putative, expressed -
15 Sobic.001G198700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G210601 - -
17 Sobic.002G033800 expressed protein -
18 Sobic.008G063100 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
19 Sobic.004G197800 expressed protein -
20 Sobic.005G167400 resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G192600 Sobic005G192600 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic005G192600--Sobic005G167500 Sobic004G182700 Sobic004G182700 Sobic005G192600--Sobic004G182700 Sobic008G036300 Sobic008G036300 Sobic005G192600--Sobic008G036300 Sobic008G036350 Sobic008G036350 Sobic005G192600--Sobic008G036350 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic005G192600--Sobic009G202400 Sobic001G498300 Sobic001G498300 Sobic005G192600--Sobic001G498300 Sobic001G198800 Sobic001G198800 Sobic005G192600--Sobic001G198800 Sobic003G058001 Sobic003G058001 Sobic005G192600--Sobic003G058001 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic005G192600--Sobic003G106500 Sobic005G167500--Sobic008G036300 Sobic005G167500--Sobic003G058001 Sobic005G167500--Sobic004G182700 Sobic005G167500--Sobic005G192600 Sobic005G167500--Sobic008G036350 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic005G167500--Sobic004G210601 Sobic005G167500--Sobic001G198800 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic005G167500--Sobic005G065500 Sobic005G167500--Sobic009G202400 Sobic004G182700--Sobic008G036300 Sobic004G182700--Sobic001G198800 Sobic004G182700--Sobic005G167500 Sobic004G182700--Sobic005G192600 Sobic008G080400 Sobic008G080400 Sobic004G182700--Sobic008G080400 Sobic004G182700--Sobic003G058001 Sobic008G080600 Sobic008G080600 Sobic004G182700--Sobic008G080600 Sobic003G310400 Sobic003G310400 Sobic004G182700--Sobic003G310400 Sobic003G131000 Sobic003G131000 Sobic004G182700--Sobic003G131000 Sobic008G036300--Sobic005G167500 Sobic008G036300--Sobic004G182700 Sobic008G036300--Sobic005G192600 Sobic008G036300--Sobic008G036350 Sobic008G036300--Sobic001G198800 Sobic008G036300--Sobic008G080400 Sobic008G036300--Sobic003G058001 Sobic001G338700 Sobic001G338700 Sobic008G036300--Sobic001G338700 Sobic008G036300--Sobic008G080600 Sobic008G036350--Sobic008G036300 Sobic008G036350--Sobic005G167500 Sobic008G036350--Sobic005G192600 Sobic001G435500 Sobic001G435500 Sobic008G036350--Sobic001G435500 Sobic008G036350--Sobic001G338700 Sobic004G056900 Sobic004G056900 Sobic008G036350--Sobic004G056900 Sobic001G070500 Sobic001G070500 Sobic008G036350--Sobic001G070500 Sobic008G036350--Sobic001G498300 Sobic002G242000 Sobic002G242000 Sobic008G036350--Sobic002G242000 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic009G202400--Sobic007G037800 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic009G202400--Sobic002G281000 Sobic009G202400--Sobic004G210601 Sobic005G097800 Sobic005G097800 Sobic009G202400--Sobic005G097800 Sobic009G202400--Sobic005G192600 Sobic009G202400--Sobic005G167500 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic009G202400--Sobic005G093300 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic009G202400--Sobic008G063100 Sobic004G019400 Sobic004G019400 Sobic009G202400--Sobic004G019400 Sobic010G218600 Sobic010G218600 Sobic001G498300--Sobic010G218600 Sobic003G187000 Sobic003G187000 Sobic001G498300--Sobic003G187000 Sobic007G178500 Sobic007G178500 Sobic001G498300--Sobic007G178500 Sobic001G407900 Sobic001G407900 Sobic001G498300--Sobic001G407900 Sobic008G063500 Sobic008G063500 Sobic001G498300--Sobic008G063500 Sobic004G343100 Sobic004G343100 Sobic001G498300--Sobic004G343100 Sobic005G021600 Sobic005G021600 Sobic001G498300--Sobic005G021600 Sobic001G498300--Sobic005G192600 Sobic004G314800 Sobic004G314800 Sobic001G498300--Sobic004G314800 Sobic001G198800--Sobic004G182700 Sobic001G198800--Sobic003G310400 Sobic001G198800--Sobic008G036300 Sobic001G198800--Sobic001G338700 Sobic002G033800 Sobic002G033800 Sobic001G198800--Sobic002G033800 Sobic001G198800--Sobic003G131000 Sobic006G234100 Sobic006G234100 Sobic001G198800--Sobic006G234100 Sobic001G448400 Sobic001G448400 Sobic001G198800--Sobic001G448400 Sobic001G198800--Sobic008G080400 Sobic003G058001--Sobic005G167500 Sobic010G157000 Sobic010G157000 Sobic003G058001--Sobic010G157000 Sobic003G058001--Sobic008G036300 Sobic003G058001--Sobic004G182700 Sobic003G058001--Sobic004G210601 Sobic003G058001--Sobic005G065500 Sobic003G058001--Sobic005G192600 Sobic010G100200 Sobic010G100200 Sobic003G058001--Sobic010G100200 Sobic003G058001--Sobic009G202400 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic003G106500--Sobic001G198700 Sobic008G073400 Sobic008G073400 Sobic003G106500--Sobic008G073400 Sobic002G001800 Sobic002G001800 Sobic003G106500--Sobic002G001800 Sobic002G371900 Sobic002G371900 Sobic003G106500--Sobic002G371900 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic003G106500--Sobic001G019300 Sobic005G190900 Sobic005G190900 Sobic003G106500--Sobic005G190900 Sobic003G106500--Sobic002G281000 Sobic003G106500--Sobic005G192600 Sobic002G195700 Sobic002G195700 Sobic003G106500--Sobic002G195700
Octagon: transcription factors


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