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Transcriptome id Sobic.001G178800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QJK8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G267000 - -
2 Sobic.009G097900 - -
3 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
4 Sobic.003G134700 exonuclease, putative, expressed -
5 Sobic.001G192250 - -
6 Sobic.009G074250 - -
7 Sobic.005G115400 - -
8 Sobic.005G081000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.007G043600 LSM domain containing protein, expressed K12621: U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
10 Sobic.003G128550 - -
11 Sobic.009G128000 - -
12 Sobic.003G112001 - -
13 Sobic.007G031100 RNA polymerase II complex component SRB7, putative, expressed K15152: MED21, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21
14 Sobic.003G115400 RPA3 - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 3, expressed K10740: replication factor A3
15 Sobic.005G117200 - -
16 Sobic.009G070300 - -
17 Sobic.005G110526 - -
18 Sobic.008G107900 glycine-rich protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G093800 - -
20 Sobic.001G007300 NFD2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G178800 Sobic001G178800 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic001G178800--Sobic001G267000 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic001G178800--Sobic009G097900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic001G178800--Sobic001G538100 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic001G178800--Sobic003G134700 Sobic001G192250 Sobic001G192250 Sobic001G178800--Sobic001G192250 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic001G178800--Sobic009G074250 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic001G178800--Sobic005G115400 Sobic005G081000 Sobic005G081000 Sobic001G178800--Sobic005G081000 Sobic007G043600 Sobic007G043600 Sobic001G178800--Sobic007G043600 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic001G267000--Sobic003G128550 Sobic001G267000--Sobic001G178800 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic001G267000--Sobic009G070300 Sobic001G267000--Sobic005G115400 Sobic005G117200 Sobic005G117200 Sobic001G267000--Sobic005G117200 Sobic001G267000--Sobic009G097900 Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic001G267000--Sobic002G066901 Sobic001G267000--Sobic001G192250 Sobic009G128000 Sobic009G128000 Sobic001G267000--Sobic009G128000 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic009G097900--Sobic009G093800 Sobic009G097900--Sobic003G134700 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic009G097900--Sobic003G112001 Sobic009G097900--Sobic009G074250 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic009G097900--Sobic001G318100 Sobic009G097900--Sobic001G178800 Sobic009G097900--Sobic001G192250 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic009G097900--Sobic005G108225 Sobic003G115400 Sobic003G115400 Sobic009G097900--Sobic003G115400 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic001G538100--Sobic008G168700 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic001G538100--Sobic005G127900 Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic001G538100--Sobic005G067400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic001G538100--Sobic002G239400 Sobic001G538100--Sobic001G178800 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic001G538100--Sobic005G110547 Sobic001G538100--Sobic009G093800 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G538100--Sobic001G091200 Sobic007G154350 Sobic007G154350 Sobic001G538100--Sobic007G154350 Sobic003G134700--Sobic003G112001 Sobic003G134700--Sobic009G097900 Sobic003G134700--Sobic009G093800 Sobic003G134700--Sobic009G074250 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic003G134700--Sobic010G102366 Sobic008G178450 Sobic008G178450 Sobic003G134700--Sobic008G178450 Sobic003G134700--Sobic001G178800 Sobic003G134700--Sobic003G115400 Sobic003G134700--Sobic003G128550 Sobic001G192250--Sobic009G097900 Sobic001G192250--Sobic001G267000 Sobic001G192250--Sobic001G178800 Sobic001G192250--Sobic003G112001 Sobic001G192250--Sobic003G134700 Sobic001G192250--Sobic005G108225 Sobic001G192250--Sobic001G091200 Sobic002G393800 Sobic002G393800 Sobic001G192250--Sobic002G393800 Sobic001G192250--Sobic009G093800 Sobic009G074250--Sobic003G112001 Sobic009G074250--Sobic009G097900 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic009G074250--Sobic009G107020 Sobic009G074250--Sobic003G128550 Sobic009G074250--Sobic003G134700 Sobic009G074250--Sobic009G093800 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic009G074250--Sobic010G143000 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic009G074250--Sobic008G120132 Sobic009G074250--Sobic001G178800 Sobic005G115400--Sobic009G070300 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic005G115400--Sobic010G115900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic005G115400--Sobic009G214800 Sobic005G115400--Sobic009G107020 Sobic005G115400--Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic003G128550 Sobic005G115400--Sobic010G143000 Sobic001G467700 Sobic001G467700 Sobic005G115400--Sobic001G467700 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic005G115400--Sobic005G124300 Sobic002G317600 Sobic002G317600 Sobic005G081000--Sobic002G317600 Sobic005G081000--Sobic007G043600 Sobic001G436300 Sobic001G436300 Sobic005G081000--Sobic001G436300 Sobic007G031100 Sobic007G031100 Sobic005G081000--Sobic007G031100 Sobic005G081000--Sobic001G178800 Sobic004G015300 Sobic004G015300 Sobic005G081000--Sobic004G015300 Sobic009G089366 Sobic009G089366 Sobic005G081000--Sobic009G089366 Sobic001G176900 Sobic001G176900 Sobic005G081000--Sobic001G176900 Sobic005G081000--Sobic003G115400 Sobic003G003000 Sobic003G003000 Sobic007G043600--Sobic003G003000 Sobic006G281200 Sobic006G281200 Sobic007G043600--Sobic006G281200 Sobic010G018000 Sobic010G018000 Sobic007G043600--Sobic010G018000 Sobic001G473400 Sobic001G473400 Sobic007G043600--Sobic001G473400 Sobic006G079900 Sobic006G079900 Sobic007G043600--Sobic006G079900 Sobic009G188300 Sobic009G188300 Sobic007G043600--Sobic009G188300 Sobic009G124400 Sobic009G124400 Sobic007G043600--Sobic009G124400 Sobic004G137900 Sobic004G137900 Sobic007G043600--Sobic004G137900 Sobic006G276200 Sobic006G276200 Sobic007G043600--Sobic006G276200
Octagon: transcription factors


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