Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G128000.4,Sobic.009G128000.1,Sobic.009G128000.2,Sobic.009G128000.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8Q3 , A0A1Z5R2I4 , A0A1B6P8F0 , A0A1Z5R3C2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G333300 serine-rich protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G003000 DNA-binding protein-related, putative, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
3 Sobic.001G267000 - -
4 Sobic.010G171501 - -
5 Sobic.004G018400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
6 Sobic.005G117200 - -
7 Sobic.001G178800 - -
8 Sobic.003G016400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
9 Sobic.002G349400 - -
10 Sobic.005G127100 expressed protein -
11 Sobic.004G209500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.010G135200 - -
13 Sobic.003G385500 "Lypoxygenase, probably induced by oxidative stress, up-regulated under severe drought stress"(PubMedID : 24655390)@lipoxygenase, putative, expressed K15718: linoleate 9S-lipoxygenase
14 Sobic.001G198200 CRP3 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
15 Sobic.001G315800 shikimate/quinate 5-dehydrogenase, putative, expressed -
16 Sobic.010G018000 39S ribosomal protein L47, mitochondrial precursor, putative, expressed K17428: MRPL47, large subunit ribosomal protein L47
17 Sobic.001G129400 ribosomal protein-related, putative, expressed K02970: RP-S21, MRPS21, small subunit ribosomal protein S21
18 Sobic.007G043600 LSM domain containing protein, expressed K12621: U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
19 Sobic.010G066000 Cinnamoyl-CoA reductase CCR1 (At)(PubMedID : 27208977)@Protein dihydroflavonol-4-reductase CCR1 (Os)(PubMedID : 27208977)@cinnamoyl-CoA reductase, putative, expressed K09753: cinnamoyl-CoA reductase
20 Sobic.001G125900 lipoxygenase, putative, expressed K15718: linoleate 9S-lipoxygenase


Gene co-expression network
sample Sobic009G128000 Sobic009G128000 Sobic004G333300 Sobic004G333300 Sobic009G128000--Sobic004G333300 Sobic003G003000 Sobic003G003000 Sobic009G128000--Sobic003G003000 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic009G128000--Sobic001G267000 Sobic010G171501 Sobic010G171501 Sobic009G128000--Sobic010G171501 Sobic004G018400 Sobic004G018400 Sobic009G128000--Sobic004G018400 Sobic005G117200 Sobic005G117200 Sobic009G128000--Sobic005G117200 Sobic001G178800 Sobic001G178800 Sobic009G128000--Sobic001G178800 Sobic003G016400 Sobic003G016400 Sobic009G128000--Sobic003G016400 Sobic002G349400 Sobic002G349400 Sobic009G128000--Sobic002G349400 Sobic001G345400 Sobic001G345400 Sobic004G333300--Sobic001G345400 Sobic009G216050 Sobic009G216050 Sobic004G333300--Sobic009G216050 Sobic004G209500 Sobic004G209500 Sobic004G333300--Sobic004G209500 Sobic008G038100 Sobic008G038100 Sobic004G333300--Sobic008G038100 Sobic004G174000 Sobic004G174000 Sobic004G333300--Sobic004G174000 Sobic003G310500 Sobic003G310500 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Octagon: transcription factors


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