Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G393900.1,Sobic.002G393900.2
Synonym Sb02g040920
Functional annotation NB-ARC domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QFV9
Pfam PF13173
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF528
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13457; RPM1, disease resistance protein RPM1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46730 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14830.1 : NB-ARC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G151100 - -
2 Sobic.002G393800 MLA10, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
3 Sobic.007G129201 - -
4 Sobic.006G243200 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K13051: ASRGL1, L-asparaginase / beta-aspartyl-peptidase
5 Sobic.006G164300 YELLOW STRIPE like 2(PubMedID : 26465154)@- -
6 Sobic.003G096500 protein kinase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G182850 - -
8 Sobic.006G123500 peptide methionine sulfoxide reductase, putative, expressed K07304: peptide-methionine (S)-S-oxide reductase
9 Sobic.005G203300 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
10 Sobic.008G060300 transcription factor(PubMedID : 30367619)@WRKY45, expressed -
11 Sobic.001G404500 gamma-interferon-inducible lysosomal thiol reductase precursor, putative, expressed K08059: IFI30, interferon, gamma-inducible protein 30
12 Sobic.004G099700 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.004G019400 Protein terpene synthase 14 (At)(PubMedID : 27208977)@"Protein terpene synthase 14, S-linalool synthase (Os)"(PubMedID : 27208977)@terpene synthase, putative, expressed -
14 Sobic.005G193500 receptor-like kinase, putative, expressed -
15 Sobic.003G410900 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G255900 expressed protein -
17 Sobic.009G202400 expressed protein -
18 Sobic.002G046900 HNH endonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G060800 basic proline-rich protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G096900 resistance-related receptor-like kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G393900 Sobic002G393900 Sobic003G151100 Sobic003G151100 Sobic002G393900--Sobic003G151100 Sobic002G393800 Sobic002G393800 Sobic002G393900--Sobic002G393800 Sobic007G129201 Sobic007G129201 Sobic002G393900--Sobic007G129201 Sobic006G243200 Sobic006G243200 Sobic002G393900--Sobic006G243200 Sobic006G164300 Sobic006G164300 Sobic002G393900--Sobic006G164300 Sobic003G096500 Sobic003G096500 Sobic002G393900--Sobic003G096500 Sobic001G182850 Sobic001G182850 Sobic002G393900--Sobic001G182850 Sobic006G123500 Sobic006G123500 Sobic002G393900--Sobic006G123500 Sobic005G203300 Sobic005G203300 Sobic002G393900--Sobic005G203300 Sobic001G102350 Sobic001G102350 Sobic003G151100--Sobic001G102350 Sobic010G130800 Sobic010G130800 Sobic003G151100--Sobic010G130800 Sobic003G151100--Sobic002G393900 Sobic004G164200 Sobic004G164200 Sobic003G151100--Sobic004G164200 Sobic006G060800 Sobic006G060800 Sobic003G151100--Sobic006G060800 Sobic002G046900 Sobic002G046900 Sobic003G151100--Sobic002G046900 Sobic006G201100 Sobic006G201100 Sobic003G151100--Sobic006G201100 Sobic008G111300 Sobic008G111300 Sobic003G151100--Sobic008G111300 Sobic003G361900 Sobic003G361900 Sobic003G151100--Sobic003G361900 Sobic002G393800--Sobic002G393900 Sobic010G098350 Sobic010G098350 Sobic002G393800--Sobic010G098350 Sobic001G192250 Sobic001G192250 Sobic002G393800--Sobic001G192250 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic002G393800--Sobic010G102366 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic002G393800--Sobic001G267000 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic002G393800--Sobic003G134700 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic002G393800--Sobic003G128550 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic002G393800--Sobic009G074250 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic002G393800--Sobic010G137100 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic007G129201--Sobic008G060300 Sobic009G252100 Sobic009G252100 Sobic007G129201--Sobic009G252100 Sobic005G193600 Sobic005G193600 Sobic007G129201--Sobic005G193600 Sobic003G098700 Sobic003G098700 Sobic007G129201--Sobic003G098700 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic007G129201--Sobic005G193500 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic007G129201--Sobic007G037800 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic007G129201--Sobic009G202400 Sobic007G129201--Sobic006G060800 Sobic004G019100 Sobic004G019100 Sobic007G129201--Sobic004G019100 Sobic005G186700 Sobic005G186700 Sobic006G243200--Sobic005G186700 Sobic006G243200--Sobic003G096500 Sobic004G051100 Sobic004G051100 Sobic006G243200--Sobic004G051100 Sobic006G243200--Sobic006G164300 Sobic006G020200 Sobic006G020200 Sobic006G243200--Sobic006G020200 Sobic006G243200--Sobic006G123500 Sobic006G243200--Sobic009G202400 Sobic006G243200--Sobic004G019100 Sobic004G019400 Sobic004G019400 Sobic006G243200--Sobic004G019400 Sobic001G525900 Sobic001G525900 Sobic006G164300--Sobic001G525900 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic006G164300--Sobic001G404500 Sobic006G164300--Sobic005G203300 Sobic006G164300--Sobic002G046900 Sobic004G099700 Sobic004G099700 Sobic006G164300--Sobic004G099700 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic006G164300--Sobic002G281000 Sobic006G164300--Sobic009G202400 Sobic003G410900 Sobic003G410900 Sobic006G164300--Sobic003G410900 Sobic005G175600 Sobic005G175600 Sobic006G164300--Sobic005G175600 Sobic003G096500--Sobic006G060800 Sobic001G201800 Sobic001G201800 Sobic003G096500--Sobic001G201800 Sobic003G096500--Sobic004G019400 Sobic004G078600 Sobic004G078600 Sobic003G096500--Sobic004G078600 Sobic003G096500--Sobic009G252100 Sobic003G096500--Sobic008G060300 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic003G096500--Sobic004G063200 Sobic003G096500--Sobic005G193600 Sobic003G096500--Sobic003G410900 Sobic001G182850--Sobic010G137100 Sobic001G182850--Sobic002G393900 Sobic001G182850--Sobic005G203300 Sobic009G205700 Sobic009G205700 Sobic001G182850--Sobic009G205700 Sobic001G391900 Sobic001G391900 Sobic001G182850--Sobic001G391900 Sobic002G030500 Sobic002G030500 Sobic001G182850--Sobic002G030500 Sobic001G182850--Sobic010G102366 Sobic005G171300 Sobic005G171300 Sobic001G182850--Sobic005G171300 Sobic010G058200 Sobic010G058200 Sobic001G182850--Sobic010G058200 Sobic004G268500 Sobic004G268500 Sobic006G123500--Sobic004G268500 Sobic006G123500--Sobic001G404500 Sobic006G123500--Sobic004G099700 Sobic005G187900 Sobic005G187900 Sobic006G123500--Sobic005G187900 Sobic003G284800 Sobic003G284800 Sobic006G123500--Sobic003G284800 Sobic006G123500--Sobic002G046900 Sobic006G123500--Sobic004G063200 Sobic008G065200 Sobic008G065200 Sobic006G123500--Sobic008G065200 Sobic002G001900 Sobic002G001900 Sobic006G123500--Sobic002G001900 Sobic010G193000 Sobic010G193000 Sobic005G203300--Sobic010G193000 Sobic005G203300--Sobic005G171300 Sobic005G203300--Sobic002G046900 Sobic005G203300--Sobic006G164300 Sobic005G203300--Sobic009G205700 Sobic004G224500 Sobic004G224500 Sobic005G203300--Sobic004G224500 Sobic009G037200 Sobic009G037200 Sobic005G203300--Sobic009G037200 Sobic005G203300--Sobic001G404500 Sobic009G019100 Sobic009G019100 Sobic005G203300--Sobic009G019100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.