Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G065200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQI7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G164600 - -
2 Sobic.003G439900 40S ribosomal protein S15, putative, expressed -
3 Sobic.008G121240 - -
4 Sobic.001G262200 expressed protein -
5 Sobic.009G013300 rp3 protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G096801 - -
7 Sobic.005G163866 - -
8 Sobic.002G069500 - -
9 Sobic.006G248350 - -
10 Sobic.001G300600 - -
11 Sobic.005G159801 - -
12 Sobic.007G170700 male sterility protein 2, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
13 Sobic.002G043900 - -
14 Sobic.006G275700 expressed protein -
15 Sobic.009G214800 - -
16 Sobic.004G166800 ribosomal protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G208400 OsProCP2 - Putative Lysosomal Pro-x Carboxypeptidase homologue, expressed K01285: lysosomal Pro-X carboxypeptidase
18 Sobic.001G312400 - -
19 Sobic.001G486700 adenylosuccinate synthetase, chloroplast precursor, putative, expressed K01939: purA, adenylosuccinate synthase
20 Sobic.006G152000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G065200 Sobic005G065200 Sobic003G164600 Sobic003G164600 Sobic005G065200--Sobic003G164600 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic005G065200--Sobic003G439900 Sobic008G121240 Sobic008G121240 Sobic005G065200--Sobic008G121240 Sobic001G262200 Sobic001G262200 Sobic005G065200--Sobic001G262200 Sobic009G013300 Sobic009G013300 Sobic005G065200--Sobic009G013300 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic005G065200--Sobic004G096801 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic005G065200--Sobic005G163866 Sobic002G069500 Sobic002G069500 Sobic005G065200--Sobic002G069500 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic005G065200--Sobic006G248350 Sobic003G164600--Sobic005G065200 Sobic003G164600--Sobic005G163866 Sobic003G385401 Sobic003G385401 Sobic003G164600--Sobic003G385401 Sobic003G164600--Sobic003G439900 Sobic006G275700 Sobic006G275700 Sobic003G164600--Sobic006G275700 Sobic003G164600--Sobic004G096801 Sobic001G486700 Sobic001G486700 Sobic003G164600--Sobic001G486700 Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic003G164600--Sobic010G142700 Sobic007G170700 Sobic007G170700 Sobic003G164600--Sobic007G170700 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic003G439900--Sobic005G159801 Sobic003G439900--Sobic001G262200 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic003G439900--Sobic001G262800 Sobic003G439900--Sobic005G065200 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic003G439900--Sobic001G312400 Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic003G439900--Sobic002G128101 Sobic003G439900--Sobic008G121240 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic003G439900--Sobic001G260300 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic003G439900--Sobic002G398200 Sobic008G121240--Sobic001G262800 Sobic008G121240--Sobic001G262200 Sobic008G121240--Sobic002G069500 Sobic008G121240--Sobic005G065200 Sobic008G121240--Sobic003G439900 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic008G121240--Sobic002G035300 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic008G121240--Sobic001G318100 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic008G121240--Sobic002G101100 Sobic002G056400 Sobic002G056400 Sobic008G121240--Sobic002G056400 Sobic001G262100 Sobic001G262100 Sobic001G262200--Sobic001G262100 Sobic001G262200--Sobic003G439900 Sobic001G262200--Sobic001G262800 Sobic001G262200--Sobic008G121240 Sobic001G262200--Sobic005G065200 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G262200--Sobic003G351401 Sobic001G091100 Sobic001G091100 Sobic001G262200--Sobic001G091100 Sobic001G253800 Sobic001G253800 Sobic001G262200--Sobic001G253800 Sobic001G262200--Sobic001G260300 Sobic009G013300--Sobic006G248350 Sobic005G192300 Sobic005G192300 Sobic009G013300--Sobic005G192300 Sobic009G013300--Sobic005G065200 Sobic004G117800 Sobic004G117800 Sobic009G013300--Sobic004G117800 Sobic001G448700 Sobic001G448700 Sobic009G013300--Sobic001G448700 Sobic009G013300--Sobic003G439900 Sobic001G012100 Sobic001G012100 Sobic009G013300--Sobic001G012100 Sobic006G142266 Sobic006G142266 Sobic009G013300--Sobic006G142266 Sobic001G202500 Sobic001G202500 Sobic009G013300--Sobic001G202500 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic004G096801--Sobic005G184050 Sobic004G096801--Sobic005G163866 Sobic009G029001 Sobic009G029001 Sobic004G096801--Sobic009G029001 Sobic004G096801--Sobic005G065200 Sobic007G181300 Sobic007G181300 Sobic004G096801--Sobic007G181300 Sobic002G128900 Sobic002G128900 Sobic004G096801--Sobic002G128900 Sobic002G279700 Sobic002G279700 Sobic004G096801--Sobic002G279700 Sobic008G006200 Sobic008G006200 Sobic004G096801--Sobic008G006200 Sobic005G183400 Sobic005G183400 Sobic004G096801--Sobic005G183400 Sobic005G163866--Sobic005G184050 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic005G163866--Sobic005G145550 Sobic005G163866--Sobic004G096801 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic005G163866--Sobic010G214500 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic005G163866--Sobic006G165600 Sobic005G163866--Sobic003G351401 Sobic005G163866--Sobic003G164600 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic005G163866--Sobic007G188800 Sobic005G163866--Sobic005G159801 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic002G069500--Sobic005G115400 Sobic002G069500--Sobic001G318100 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic002G069500--Sobic010G143000 Sobic005G117200 Sobic005G117200 Sobic002G069500--Sobic005G117200 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic002G069500--Sobic009G214800 Sobic002G069500--Sobic008G121240 Sobic002G069500--Sobic001G262800 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic002G069500--Sobic010G168000 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic002G069500--Sobic005G075500 Sobic006G248350--Sobic001G312400 Sobic010G214400 Sobic010G214400 Sobic006G248350--Sobic010G214400 Sobic006G248350--Sobic006G165600 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic006G248350--Sobic003G128550 Sobic006G248350--Sobic009G013300 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic006G248350--Sobic005G124300 Sobic002G413900 Sobic002G413900 Sobic006G248350--Sobic002G413900 Sobic006G248350--Sobic005G115400 Sobic006G248350--Sobic001G260300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.