Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G043900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q956
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G049900 - -
2 Sobic.003G279800 plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, putative, expressed K13199: plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein
3 Sobic.008G057100 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G143700 ATP-citrate synthase subunit 1, putative, expressed K01648: ATP citrate (pro-S)-lyase
5 Sobic.006G096500 glutamate decarboxylase, putative, expressed K01580: E4.1.1.15, gadB, gadA, glutamate decarboxylase
6 Sobic.002G064600 expressed protein -
7 Sobic.003G269100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AWPM-19-like membrane family protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G067500 OsSCP32 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
9 Sobic.004G038200 - -
10 Sobic.010G007000 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.010G232750 - -
12 Sobic.005G065200 - -
13 Sobic.006G001800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G276700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Sucrose synthase genes(PubMedID : 24456189)@sucrose synthase(PubMedID : 26616172)@Sugar synthesis(PubMedID : 27330561)@sucrose synthase, putative, expressed K00695: sucrose synthase
15 Sobic.008G114000 expressed protein -
16 Sobic.010G096100 ras-related protein, putative, expressed K04392: Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1
17 Sobic.005G071800 - -
18 Sobic.010G236600 oligopeptidase, putative, expressed K01410: mitochondrial intermediate peptidase
19 Sobic.003G296500 leucine rich repeat family protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G110400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G043900 Sobic002G043900 Sobic003G049900 Sobic003G049900 Sobic002G043900--Sobic003G049900 Sobic003G279800 Sobic003G279800 Sobic002G043900--Sobic003G279800 Sobic008G057100 Sobic008G057100 Sobic002G043900--Sobic008G057100 Sobic003G143700 Sobic003G143700 Sobic002G043900--Sobic003G143700 Sobic006G096500 Sobic006G096500 Sobic002G043900--Sobic006G096500 Sobic002G064600 Sobic002G064600 Sobic002G043900--Sobic002G064600 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic002G043900--Sobic003G269100 Sobic010G067500 Sobic010G067500 Sobic002G043900--Sobic010G067500 Sobic004G038200 Sobic004G038200 Sobic002G043900--Sobic004G038200 Sobic003G206700 Sobic003G206700 Sobic003G049900--Sobic003G206700 Sobic001G208600 Sobic001G208600 Sobic003G049900--Sobic001G208600 Sobic002G053900 Sobic002G053900 Sobic003G049900--Sobic002G053900 Sobic002G347300 Sobic002G347300 Sobic003G049900--Sobic002G347300 Sobic008G178800 Sobic008G178800 Sobic003G049900--Sobic008G178800 Sobic003G049900--Sobic003G269100 Sobic009G017500 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Octagon: transcription factors


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