Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G001800.1
Synonym Sb06g000340
Functional annotation NB-ARC domain containing protein, expressed
UniProt C5YB86
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF576
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46730 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g46210.1 : NB-ARC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G006480.4 , HORVU2Hr1G006480.5 , HORVU2Hr1G006480.2 , HORVU2Hr1G006480.1 , HORVU5Hr1G062610.2 , HORVU5Hr1G062610.3 , HORVU5Hr1G062610.1 , HORVU5Hr1G062610.6 , HORVU5Hr1G062610.7 , HORVU5Hr1G062610.4 , HORVU5Hr1G062610.5 , HORVU5Hr1G062610.8 , HORVU5Hr1G062610.9 , HORVU2Hr1G006480.10 , HORVU2Hr1G006480.11 , HORVU2Hr1G006480.6 , HORVU2Hr1G006480.7 , HORVU2Hr1G006480.3 , HORVU2Hr1G006480.8 , HORVU2Hr1G006480.9 , HORVU5Hr1G062610.10 , HORVU5Hr1G062610.11
Wheat TraesCS7D02G549200 , TraesCS2D02G041400 , TraesCS2A02G042400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.005G140100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G001800 Sobic006G001800 Sobic001G261484 Sobic001G261484 Sobic006G001800--Sobic001G261484 Sobic005G154300 Sobic005G154300 Sobic006G001800--Sobic005G154300 Sobic005G192100 Sobic005G192100 Sobic006G001800--Sobic005G192100 Sobic001G091100 Sobic001G091100 Sobic006G001800--Sobic001G091100 Sobic001G300600 Sobic001G300600 Sobic006G001800--Sobic001G300600 Sobic006G188800 Sobic006G188800 Sobic006G001800--Sobic006G188800 Sobic001G475200 Sobic001G475200 Sobic006G001800--Sobic001G475200 Sobic006G079900 Sobic006G079900 Sobic006G001800--Sobic006G079900 Sobic001G007300 Sobic001G007300 Sobic006G001800--Sobic001G007300 Sobic001G261484--Sobic006G001800 Sobic003G287300 Sobic003G287300 Sobic001G261484--Sobic003G287300 Sobic005G105500 Sobic005G105500 Sobic001G261484--Sobic005G105500 Sobic002G177700 Sobic002G177700 Sobic001G261484--Sobic002G177700 Sobic009G240700 Sobic009G240700 Sobic001G261484--Sobic009G240700 Sobic005G111900 Sobic005G111900 Sobic001G261484--Sobic005G111900 Sobic001G025600 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Octagon: transcription factors


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