Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G429900.1,Sobic.003G429900.2
Synonym Sb03g046180
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XIH2 , A0A1W0W1H8
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G219200 - -
2 Sobic.005G111900 uncharacterized protein family UPF0016 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G026925 - K01689: ENO, enolase
4 Sobic.005G033200 expressed protein -
5 Sobic.004G352500 vacuolar ATP synthase subunit F, putative, expressed K02151: ATPeV1F, V-type H+-transporting ATPase subunit F
6 Sobic.003G440800 vacuolar protein sorting 55 family protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G300600 - -
8 Sobic.001G261484 - -
9 Sobic.008G118900 OsAPRL6 adenosine 5\'-phosphosulfate reductase-like OsAPRL6, expressed -
10 Sobic.003G279200 ubiquinone oxidoreductase, putative, expressed K03940: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 7
11 Sobic.001G148500 expressed protein -
12 Sobic.001G260300 - -
13 Sobic.001G462200 mannose-1-phosphate guanyltransferase, putative, expressed K00966: mannose-1-phosphate guanylyltransferase
14 Sobic.001G072800 expressed protein -
15 Sobic.001G290700 AGAP003819-PA, putative, expressed K09008: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3
16 Sobic.001G475200 expressed protein -
17 Sobic.010G216200 OsGrx_C4 - glutaredoxin subgroup I, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
18 Sobic.006G220800 -(PubMedID : 26976818)@aminomethyltransferase, putative, expressed K00605: gcvT, aminomethyltransferase
19 Sobic.009G216700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
20 Sobic.001G193200 cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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