Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G148500.1
Synonym Sb01g012920
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WQG6
Pfam -
Panther DB PTHR15852 PTHR15852:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G17840 : DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g45344.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017205 , Zm00025a007554
Brachypodium KQK13902
Barley -
Wheat TraesCS4D02G013200 , TraesCS4D02G013200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G210800 iron-stress related protein, putative, expressed -
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6 Sobic.002G111200 dehydrogenase/reductase SDR family member 2, putative, expressed K11147: dehydrogenase/reductase SDR family member 4
7 Sobic.009G243100 pex14, putative, expressed -
8 Sobic.008G087900 expressed protein -
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14 Sobic.002G332900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
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17 Sobic.005G033200 expressed protein -
18 Sobic.004G070700 GA16396-PA, putative, expressed -
19 Sobic.006G002201 - -
20 Sobic.005G111900 uncharacterized protein family UPF0016 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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