Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G032600.1
Synonym Sb08g002800
Functional annotation saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed
UniProt C5YRM9
Pfam PF03489 PF05184
Panther DB PTHR11480 PTHR11480:SF45
NCBI CDD KOG1340; Prosaposin
KEGG Orthology K12382; PSAP, saposin
Gene Ontology GO:0006629; lipid metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G51730 : saposin B domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g02094.1 : saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029028
Brachypodium KQJ89423
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G032600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G049100 acyl-coenzyme A oxidase 1.2, peroxisomal, putative, expressed K00232: E1.3.3.6, ACOX1, acyl-CoA oxidase
2 Sobic.008G156700 phosphoribulokinase/Uridine kinase family protein, expressed -
3 Sobic.004G080100 fumarylacetoacetase, putative, expressed K01555: FAH, fumarylacetoacetase
4 Sobic.009G133600 - -
5 Sobic.005G168600 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed K10046: GDP-D-mannose 3', 5'-epimerase
6 Sobic.003G110400 inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G055700 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
8 Sobic.006G244700 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K00794: ribH, 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase
9 Sobic.008G033500 nucleolar GTPase, putative, expressed -
10 Sobic.005G044800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G226900 zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2, putative, expressed K07119: PTGR3, prostaglandin reductase 3
12 Sobic.001G048200 elongation factor P, putative, expressed -
13 Sobic.004G296400 amino acid permease, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
14 Sobic.002G116900 expressed protein -
15 Sobic.007G188300 integral membrane family protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G203800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@lipase precursor, putative, expressed -
17 Sobic.009G117500 lipase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.005G020900 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G219300 lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed K00025: malate dehydrogenase
20 Sobic.002G111200 dehydrogenase/reductase SDR family member 2, putative, expressed K11147: dehydrogenase/reductase SDR family member 4


Gene co-expression network
sample Sobic008G032600 Sobic008G032600 Sobic010G049100 Sobic010G049100 Sobic008G032600--Sobic010G049100 Sobic008G156700 Sobic008G156700 Sobic008G032600--Sobic008G156700 Sobic004G080100 Sobic004G080100 Sobic008G032600--Sobic004G080100 Sobic009G133600 Sobic009G133600 Sobic008G032600--Sobic009G133600 Sobic005G168600 Sobic005G168600 Sobic008G032600--Sobic005G168600 Sobic003G110400 Sobic003G110400 Sobic008G032600--Sobic003G110400 Sobic003G055700 Sobic003G055700 Sobic008G032600--Sobic003G055700 Sobic006G244700 Sobic006G244700 Sobic008G032600--Sobic006G244700 Sobic008G033500 Sobic008G033500 Sobic008G032600--Sobic008G033500 Sobic010G049100--Sobic004G080100 Sobic003G246700 Sobic003G246700 Sobic010G049100--Sobic003G246700 Sobic001G014800 Sobic001G014800 Sobic010G049100--Sobic001G014800 Sobic010G049100--Sobic008G032600 Sobic004G121300 Sobic004G121300 Sobic010G049100--Sobic004G121300 Sobic002G226900 Sobic002G226900 Sobic010G049100--Sobic002G226900 Sobic004G296400 Sobic004G296400 Sobic010G049100--Sobic004G296400 Sobic009G139900 Sobic009G139900 Sobic010G049100--Sobic009G139900 Sobic004G136300 Sobic004G136300 Sobic010G049100--Sobic004G136300 Sobic007G098200 Sobic007G098200 Sobic008G156700--Sobic007G098200 Sobic008G156700--Sobic008G032600 Sobic002G364800 Sobic002G364800 Sobic008G156700--Sobic002G364800 Sobic004G310500 Sobic004G310500 Sobic008G156700--Sobic004G310500 Sobic009G075800 Sobic009G075800 Sobic008G156700--Sobic009G075800 Sobic008G156700--Sobic008G033500 Sobic006G136400 Sobic006G136400 Sobic008G156700--Sobic006G136400 Sobic002G262900 Sobic002G262900 Sobic008G156700--Sobic002G262900 Sobic008G156700--Sobic002G226900 Sobic004G080100--Sobic010G049100 Sobic004G067100 Sobic004G067100 Sobic004G080100--Sobic004G067100 Sobic004G080100--Sobic003G246700 Sobic004G080100--Sobic002G226900 Sobic001G219300 Sobic001G219300 Sobic004G080100--Sobic001G219300 Sobic004G080100--Sobic008G032600 Sobic003G139800 Sobic003G139800 Sobic004G080100--Sobic003G139800 Sobic008G179900 Sobic008G179900 Sobic004G080100--Sobic008G179900 Sobic008G089900 Sobic008G089900 Sobic004G080100--Sobic008G089900 Sobic009G133500 Sobic009G133500 Sobic009G133600--Sobic009G133500 Sobic005G203800 Sobic005G203800 Sobic009G133600--Sobic005G203800 Sobic009G133600--Sobic008G032600 Sobic009G133600--Sobic004G136300 Sobic009G133600--Sobic009G139900 Sobic009G133600--Sobic004G296400 Sobic010G130200 Sobic010G130200 Sobic009G133600--Sobic010G130200 Sobic003G273600 Sobic003G273600 Sobic009G133600--Sobic003G273600 Sobic004G127700 Sobic004G127700 Sobic009G133600--Sobic004G127700 Sobic001G047400 Sobic001G047400 Sobic005G168600--Sobic001G047400 Sobic002G116900 Sobic002G116900 Sobic005G168600--Sobic002G116900 Sobic001G085100 Sobic001G085100 Sobic005G168600--Sobic001G085100 Sobic006G280600 Sobic006G280600 Sobic005G168600--Sobic006G280600 Sobic010G277100 Sobic010G277100 Sobic005G168600--Sobic010G277100 Sobic005G168600--Sobic004G296400 Sobic005G168600--Sobic002G262900 Sobic001G261436 Sobic001G261436 Sobic005G168600--Sobic001G261436 Sobic005G168600--Sobic006G244700 Sobic003G110400--Sobic001G014800 Sobic003G110400--Sobic008G032600 Sobic003G110400--Sobic010G049100 Sobic006G160300 Sobic006G160300 Sobic003G110400--Sobic006G160300 Sobic003G110400--Sobic010G277100 Sobic003G110400--Sobic008G179900 Sobic003G110400--Sobic004G121300 Sobic001G053000 Sobic001G053000 Sobic003G110400--Sobic001G053000 Sobic002G111200 Sobic002G111200 Sobic003G110400--Sobic002G111200 Sobic007G136100 Sobic007G136100 Sobic003G055700--Sobic007G136100 Sobic005G044800 Sobic005G044800 Sobic003G055700--Sobic005G044800 Sobic003G055700--Sobic001G219300 Sobic001G048200 Sobic001G048200 Sobic003G055700--Sobic001G048200 Sobic003G055700--Sobic006G244700 Sobic003G055700--Sobic008G032600 Sobic003G055700--Sobic009G139900 Sobic003G372000 Sobic003G372000 Sobic003G055700--Sobic003G372000 Sobic003G055700--Sobic004G080100 Sobic001G263000 Sobic001G263000 Sobic006G244700--Sobic001G263000 Sobic006G244700--Sobic001G048200 Sobic006G244700--Sobic005G044800 Sobic007G188300 Sobic007G188300 Sobic006G244700--Sobic007G188300 Sobic004G130900 Sobic004G130900 Sobic006G244700--Sobic004G130900 Sobic009G004600 Sobic009G004600 Sobic006G244700--Sobic009G004600 Sobic003G261400 Sobic003G261400 Sobic006G244700--Sobic003G261400 Sobic002G209400 Sobic002G209400 Sobic006G244700--Sobic002G209400 Sobic004G081800 Sobic004G081800 Sobic006G244700--Sobic004G081800 Sobic010G020400 Sobic010G020400 Sobic008G033500--Sobic010G020400 Sobic008G033500--Sobic001G014800 Sobic001G333100 Sobic001G333100 Sobic008G033500--Sobic001G333100 Sobic002G020700 Sobic002G020700 Sobic008G033500--Sobic002G020700 Sobic007G162100 Sobic007G162100 Sobic008G033500--Sobic007G162100 Sobic006G127600 Sobic006G127600 Sobic008G033500--Sobic006G127600 Sobic003G422900 Sobic003G422900 Sobic008G033500--Sobic003G422900 Sobic009G068500 Sobic009G068500 Sobic008G033500--Sobic009G068500 Sobic001G193300 Sobic001G193300 Sobic008G033500--Sobic001G193300
Octagon: transcription factors


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