Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G219200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YS51
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.004G219200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G429900 expressed protein -
2 Sobic.002G272500 6-phosphogluconolactonase, putative, expressed K01057: PGLS, pgl, 6-phosphogluconolactonase
3 Sobic.001G290700 AGAP003819-PA, putative, expressed K09008: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3
4 Sobic.003G279200 ubiquinone oxidoreductase, putative, expressed K03940: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 7
5 Sobic.006G149000 expressed protein -
6 Sobic.001G388600 histidine triad family protein, putative, expressed K02503: HINT1, hinT, histidine triad (HIT) family protein
7 Sobic.007G052700 acyl CoA binding protein, putative, expressed K08762: DBI, diazepam-binding inhibitor (GABA receptor modulator, acyl-CoA-binding protein)
8 Sobic.001G139001 - -
9 Sobic.004G162000 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
10 Sobic.001G503801 - -
11 Sobic.003G150200 esterase/lipase/thioesterase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G216500 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K03661: ATPeV0B, V-type H+-transporting ATPase 21kDa proteolipid subunit
13 Sobic.010G026925 - K01689: ENO, enolase
14 Sobic.006G220800 -(PubMedID : 26976818)@aminomethyltransferase, putative, expressed K00605: gcvT, aminomethyltransferase
15 Sobic.005G155300 BSD domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G072800 expressed protein -
17 Sobic.001G447600 squalene monooxygenase, putative, expressed K00511: SQLE, squalene monooxygenase
18 Sobic.006G211800 coatomer subunit epsilon, putative, expressed K17268: coatomer subunit epsilon
19 Sobic.002G340700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@secretory carrier-associated membrane protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G143000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G219200 Sobic004G219200 Sobic003G429900 Sobic003G429900 Sobic004G219200--Sobic003G429900 Sobic002G272500 Sobic002G272500 Sobic004G219200--Sobic002G272500 Sobic001G290700 Sobic001G290700 Sobic004G219200--Sobic001G290700 Sobic003G279200 Sobic003G279200 Sobic004G219200--Sobic003G279200 Sobic006G149000 Sobic006G149000 Sobic004G219200--Sobic006G149000 Sobic001G388600 Sobic001G388600 Sobic004G219200--Sobic001G388600 Sobic007G052700 Sobic007G052700 Sobic004G219200--Sobic007G052700 Sobic001G139001 Sobic001G139001 Sobic004G219200--Sobic001G139001 Sobic004G162000 Sobic004G162000 Sobic004G219200--Sobic004G162000 Sobic003G429900--Sobic004G219200 Sobic005G111900 Sobic005G111900 Sobic003G429900--Sobic005G111900 Sobic010G026925 Sobic010G026925 Sobic003G429900--Sobic010G026925 Sobic005G033200 Sobic005G033200 Sobic003G429900--Sobic005G033200 Sobic004G352500 Sobic004G352500 Sobic003G429900--Sobic004G352500 Sobic003G440800 Sobic003G440800 Sobic003G429900--Sobic003G440800 Sobic001G300600 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Octagon: transcription factors


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