Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G214800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P9T7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G115400 - -
2 Sobic.010G115900 ureide permease, putative, expressed -
3 Sobic.010G143000 - -
4 Sobic.002G321100 NB-ARC domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G120132 - -
6 Sobic.004G197800 expressed protein -
7 Sobic.001G467700 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
8 Sobic.010G168000 - -
9 Sobic.009G070300 - -
10 Sobic.003G128550 - -
11 Sobic.002G069500 - -
12 Sobic.004G201400 cadmium tolerance factor, putative, expressed -
13 Sobic.009G107020 - -
14 Sobic.004G081201 - -
15 Sobic.001G318100 - -
16 Sobic.005G075500 - -
17 Sobic.003G122100 FAD binding domain containing protein, expressed K10960: chlP, geranylgeranyl diphosphate/geranylgeranyl-bacteriochlorophyllide a reductase
18 Sobic.009G074250 - -
19 Sobic.005G071800 - -
20 Sobic.001G513600 C-methyltransferase, putative, expressed K08242: 24-methylenesterol C-methyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic009G214800--Sobic005G115400 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic009G214800--Sobic010G115900 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic009G214800--Sobic010G143000 Sobic002G321100 Sobic002G321100 Sobic009G214800--Sobic002G321100 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic009G214800--Sobic008G120132 Sobic004G197800 Sobic004G197800 Sobic009G214800--Sobic004G197800 Sobic001G467700 Sobic001G467700 Sobic009G214800--Sobic001G467700 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic009G214800--Sobic010G168000 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic009G214800--Sobic009G070300 Sobic005G115400--Sobic009G070300 Sobic005G115400--Sobic010G115900 Sobic005G115400--Sobic009G214800 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic005G115400--Sobic009G107020 Sobic005G115400--Sobic008G120132 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic005G115400--Sobic003G128550 Sobic005G115400--Sobic010G143000 Sobic005G115400--Sobic001G467700 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic005G115400--Sobic005G124300 Sobic010G115900--Sobic005G115400 Sobic010G115900--Sobic009G214800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic010G115900--Sobic005G128800 Sobic010G115900--Sobic010G143000 Sobic010G115900--Sobic009G070300 Sobic010G115900--Sobic008G120132 Sobic010G115900--Sobic009G107020 Sobic002G337001 Sobic002G337001 Sobic010G115900--Sobic002G337001 Sobic010G115900--Sobic001G467700 Sobic010G143000--Sobic008G120132 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic010G143000--Sobic001G318100 Sobic010G143000--Sobic005G128800 Sobic010G143000--Sobic009G214800 Sobic010G143000--Sobic010G115900 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic010G143000--Sobic001G353800 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic010G143000--Sobic005G075500 Sobic010G143000--Sobic005G115400 Sobic010G143000--Sobic010G168000 Sobic002G321100--Sobic009G214800 Sobic002G321100--Sobic010G143000 Sobic002G321100--Sobic005G115400 Sobic002G321100--Sobic010G168000 Sobic002G321100--Sobic005G075500 Sobic008G047200 Sobic008G047200 Sobic002G321100--Sobic008G047200 Sobic002G321100--Sobic001G318100 Sobic002G321100--Sobic010G115900 Sobic002G321100--Sobic008G120132 Sobic008G120132--Sobic010G143000 Sobic008G120132--Sobic005G128800 Sobic008G120132--Sobic001G318100 Sobic008G120132--Sobic005G115400 Sobic008G120132--Sobic010G115900 Sobic008G120132--Sobic009G214800 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic008G120132--Sobic009G070250 Sobic008G120132--Sobic001G353800 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic008G120132--Sobic005G108225 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic004G197800--Sobic009G202400 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic004G197800--Sobic007G037800 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic004G197800--Sobic001G198700 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic004G197800--Sobic005G093300 Sobic005G192600 Sobic005G192600 Sobic004G197800--Sobic005G192600 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic004G197800--Sobic004G210601 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic004G197800--Sobic003G106500 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic004G197800--Sobic005G167500 Sobic002G265400 Sobic002G265400 Sobic004G197800--Sobic002G265400 Sobic001G467700--Sobic009G070300 Sobic002G093500 Sobic002G093500 Sobic001G467700--Sobic002G093500 Sobic001G467700--Sobic005G115400 Sobic001G467700--Sobic010G115900 Sobic001G467700--Sobic009G214800 Sobic001G467700--Sobic010G143000 Sobic005G089000 Sobic005G089000 Sobic001G467700--Sobic005G089000 Sobic008G073400 Sobic008G073400 Sobic001G467700--Sobic008G073400 Sobic001G467700--Sobic001G198700 Sobic010G168000--Sobic005G108225 Sobic010G168000--Sobic010G143000 Sobic010G168000--Sobic005G115400 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic010G168000--Sobic002G101100 Sobic010G168000--Sobic009G214800 Sobic010G168000--Sobic010G115900 Sobic010G168000--Sobic001G318100 Sobic010G168000--Sobic002G321100 Sobic008G090100 Sobic008G090100 Sobic010G168000--Sobic008G090100 Sobic009G070300--Sobic005G115400 Sobic009G070300--Sobic001G467700 Sobic009G070300--Sobic010G115900 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic009G070300--Sobic001G267000 Sobic009G070300--Sobic009G214800 Sobic001G148400 Sobic001G148400 Sobic009G070300--Sobic001G148400 Sobic009G070300--Sobic005G124300 Sobic009G070300--Sobic003G128550 Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic009G070300--Sobic002G066901
Octagon: transcription factors


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