Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G467700.1
Synonym emb1027
Functional annotation arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QPU8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26300 : Arginyl-tRNA synthetase, class Ic
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g07030.1 : arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G070300 - -
2 Sobic.002G093500 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
3 Sobic.005G115400 - -
4 Sobic.010G115900 ureide permease, putative, expressed -
5 Sobic.009G214800 - -
6 Sobic.010G143000 - -
7 Sobic.005G089000 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
8 Sobic.008G073400 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@B-box zinc finger family protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G198700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G520100 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
11 Sobic.001G148400 Ca exchanger(PubMedID : 22196357)@sodium/calcium exchanger protein, putative, expressed K13754: SLC24A6, solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 6
12 Sobic.002G195700 Cinnamyl alcohol dehydrogenase(PubMedID : 28606901)@Cinnamyl alcohol dehydrogenase(PubMedID : 19087955)@dehydrogenase, putative, expressed K00083: cinnamyl-alcohol dehydrogenase
13 Sobic.004G007500 cytochrome P450, putative, expressed K10528: hydroperoxide lyase
14 Sobic.009G075100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
15 Sobic.009G000900 methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
16 Sobic.003G106500 expressed protein -
17 Sobic.002G337001 - -
18 Sobic.010G089200 expressed protein -
19 Sobic.001G315800 shikimate/quinate 5-dehydrogenase, putative, expressed -
20 Sobic.003G128550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G467700 Sobic001G467700 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic001G467700--Sobic009G070300 Sobic002G093500 Sobic002G093500 Sobic001G467700--Sobic002G093500 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic001G467700--Sobic005G115400 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic001G467700--Sobic010G115900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic001G467700--Sobic009G214800 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic001G467700--Sobic010G143000 Sobic005G089000 Sobic005G089000 Sobic001G467700--Sobic005G089000 Sobic008G073400 Sobic008G073400 Sobic001G467700--Sobic008G073400 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic001G467700--Sobic001G198700 Sobic009G070300--Sobic005G115400 Sobic009G070300--Sobic001G467700 Sobic009G070300--Sobic010G115900 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic009G070300--Sobic001G267000 Sobic009G070300--Sobic009G214800 Sobic001G148400 Sobic001G148400 Sobic009G070300--Sobic001G148400 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic009G070300--Sobic005G124300 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic009G070300--Sobic003G128550 Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic009G070300--Sobic002G066901 Sobic010G134200 Sobic010G134200 Sobic002G093500--Sobic010G134200 Sobic002G093500--Sobic001G467700 Sobic001G269000 Sobic001G269000 Sobic002G093500--Sobic001G269000 Sobic002G093500--Sobic008G073400 Sobic001G407900 Sobic001G407900 Sobic002G093500--Sobic001G407900 Sobic001G268850 Sobic001G268850 Sobic002G093500--Sobic001G268850 Sobic007G178500 Sobic007G178500 Sobic002G093500--Sobic007G178500 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic002G093500--Sobic003G106500 Sobic007G023300 Sobic007G023300 Sobic002G093500--Sobic007G023300 Sobic005G115400--Sobic009G070300 Sobic005G115400--Sobic010G115900 Sobic005G115400--Sobic009G214800 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic005G115400--Sobic009G107020 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic003G128550 Sobic005G115400--Sobic010G143000 Sobic005G115400--Sobic001G467700 Sobic005G115400--Sobic005G124300 Sobic010G115900--Sobic005G115400 Sobic010G115900--Sobic009G214800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic010G115900--Sobic005G128800 Sobic010G115900--Sobic010G143000 Sobic010G115900--Sobic009G070300 Sobic010G115900--Sobic008G120132 Sobic010G115900--Sobic009G107020 Sobic002G337001 Sobic002G337001 Sobic010G115900--Sobic002G337001 Sobic010G115900--Sobic001G467700 Sobic009G214800--Sobic005G115400 Sobic009G214800--Sobic010G115900 Sobic009G214800--Sobic010G143000 Sobic002G321100 Sobic002G321100 Sobic009G214800--Sobic002G321100 Sobic009G214800--Sobic008G120132 Sobic004G197800 Sobic004G197800 Sobic009G214800--Sobic004G197800 Sobic009G214800--Sobic001G467700 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic009G214800--Sobic010G168000 Sobic009G214800--Sobic009G070300 Sobic010G143000--Sobic008G120132 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic010G143000--Sobic001G318100 Sobic010G143000--Sobic005G128800 Sobic010G143000--Sobic009G214800 Sobic010G143000--Sobic010G115900 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic010G143000--Sobic001G353800 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic010G143000--Sobic005G075500 Sobic010G143000--Sobic005G115400 Sobic010G143000--Sobic010G168000 Sobic002G195700 Sobic002G195700 Sobic005G089000--Sobic002G195700 Sobic001G321600 Sobic001G321600 Sobic005G089000--Sobic001G321600 Sobic005G089000--Sobic008G073400 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic005G089000--Sobic001G019300 Sobic001G005500 Sobic001G005500 Sobic005G089000--Sobic001G005500 Sobic003G135800 Sobic003G135800 Sobic005G089000--Sobic003G135800 Sobic003G291400 Sobic003G291400 Sobic005G089000--Sobic003G291400 Sobic005G089000--Sobic003G106500 Sobic001G452700 Sobic001G452700 Sobic005G089000--Sobic001G452700 Sobic008G073400--Sobic002G195700 Sobic008G073400--Sobic001G019300 Sobic008G073400--Sobic003G106500 Sobic008G073400--Sobic001G321600 Sobic008G073400--Sobic001G005500 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic008G073400--Sobic002G281000 Sobic005G021600 Sobic005G021600 Sobic008G073400--Sobic005G021600 Sobic008G073400--Sobic001G198700 Sobic008G073400--Sobic005G089000 Sobic001G198700--Sobic003G106500 Sobic001G198700--Sobic001G019300 Sobic002G265400 Sobic002G265400 Sobic001G198700--Sobic002G265400 Sobic001G198700--Sobic002G195700 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic001G198700--Sobic008G063100 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic001G198700--Sobic004G063200 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic001G198700--Sobic005G093300 Sobic002G371900 Sobic002G371900 Sobic001G198700--Sobic002G371900 Sobic004G078600 Sobic004G078600 Sobic001G198700--Sobic004G078600
Octagon: transcription factors


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