Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G175400.1
Synonym Sb02g022420
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
desaturase/cytochrome b5 protein, putative, expressed
UniProt C5XAI0
Pfam PF00173 PF00487
Panther DB PTHR19353 PTHR19353:SF20
NCBI CDD KOG4232; Delta 6-fatty acid desaturase/delta-8 sphingolipid desaturase
KEGG Orthology K13076; sphingolipid 8-(E)-desaturase
Gene Ontology GO:0006629; lipid metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G46210 : Fatty acid/sphingolipid desaturase
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g16920.1 : desaturase/cytochrome b5 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046569 , Zm00025a013769
Brachypodium KQJ89887
Barley HORVU7Hr1G010360.1 , HORVU3Hr1G047140.1 , HORVU5Hr1G041490.1 , HORVU3Hr1G047170.1 , HORVU3Hr1G008940.1 , HORVU5Hr1G032760.1 , HORVU4Hr1G052440.1 , HORVU2Hr1G103070.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G175400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.006G078800 - -
20 Sobic.002G322700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G175400 Sobic002G175400 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic002G175400--Sobic001G440000 Sobic008G181400 Sobic008G181400 Sobic002G175400--Sobic008G181400 Sobic004G319000 Sobic004G319000 Sobic002G175400--Sobic004G319000 Sobic001G415700 Sobic001G415700 Sobic002G175400--Sobic001G415700 Sobic002G138300 Sobic002G138300 Sobic002G175400--Sobic002G138300 Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic002G175400--Sobic005G067400 Sobic010G109400 Sobic010G109400 Sobic002G175400--Sobic010G109400 Sobic004G162500 Sobic004G162500 Sobic002G175400--Sobic004G162500 Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic002G175400--Sobic008G126500 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic001G440000--Sobic002G239400 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic001G440000--Sobic010G153400 Sobic009G066200 Sobic009G066200 Sobic001G440000--Sobic009G066200 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic001G440000--Sobic004G298600 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic001G440000--Sobic001G131900 Sobic003G435300 Sobic003G435300 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Octagon: transcription factors


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