Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G058100.1
Synonym Sb03g004960
Functional annotation kelch repeat-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q1L0
Pfam PF10539 PF01344
Panther DB PTHR24412 PTHR24412:SF228
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G01660 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g07140.2 : kelch repeat-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035680
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G058100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.003G401800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G058100 Sobic003G058100 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic003G058100--Sobic005G108225 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic003G058100--Sobic005G127900 Sobic009G186001 Sobic009G186001 Sobic003G058100--Sobic009G186001 Sobic008G176900 Sobic008G176900 Sobic003G058100--Sobic008G176900 Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic003G058100--Sobic008G126500 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic003G058100--Sobic009G070250 Sobic001G510300 Sobic001G510300 Sobic003G058100--Sobic001G510300 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic003G058100--Sobic008G120132 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic003G058100--Sobic001G273000 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic005G108225--Sobic005G098900 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic005G108225--Sobic010G168000 Sobic005G108225--Sobic005G127900 Sobic008G047200 Sobic008G047200 Sobic005G108225--Sobic008G047200 Sobic010G248500 Sobic010G248500 Sobic005G108225--Sobic010G248500 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic005G108225--Sobic002G101100 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic005G108225--Sobic001G318100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic005G108225--Sobic010G165900 Sobic005G108225--Sobic008G120132 Sobic005G127900--Sobic009G070250 Sobic005G127900--Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic005G108225 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic002G013800 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic005G127900--Sobic005G110547 Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic005G127900--Sobic007G026900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic008G120132 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic005G127900--Sobic005G145800 Sobic009G186001--Sobic003G058100 Sobic009G186001--Sobic005G108225 Sobic009G186001--Sobic008G047200 Sobic009G186001--Sobic005G127900 Sobic009G186001--Sobic002G101100 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic009G186001--Sobic005G115400 Sobic002G321100 Sobic002G321100 Sobic009G186001--Sobic002G321100 Sobic009G186001--Sobic002G013800 Sobic010G156200 Sobic010G156200 Sobic009G186001--Sobic010G156200 Sobic006G140300 Sobic006G140300 Sobic008G176900--Sobic006G140300 Sobic001G467800 Sobic001G467800 Sobic008G176900--Sobic001G467800 Sobic002G064900 Sobic002G064900 Sobic008G176900--Sobic002G064900 Sobic008G041900 Sobic008G041900 Sobic008G176900--Sobic008G041900 Sobic009G254000 Sobic009G254000 Sobic008G176900--Sobic009G254000 Sobic001G399600 Sobic001G399600 Sobic008G176900--Sobic001G399600 Sobic004G014100 Sobic004G014100 Sobic008G176900--Sobic004G014100 Sobic007G167300 Sobic007G167300 Sobic008G176900--Sobic007G167300 Sobic008G176900--Sobic003G058100 Sobic008G126500--Sobic005G127900 Sobic008G126500--Sobic005G110547 Sobic008G126500--Sobic009G070250 Sobic008G126500--Sobic002G013800 Sobic002G175400 Sobic002G175400 Sobic008G126500--Sobic002G175400 Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic008G126500--Sobic005G067400 Sobic008G126500--Sobic005G108225 Sobic008G126500--Sobic003G058100 Sobic008G030600 Sobic008G030600 Sobic008G126500--Sobic008G030600 Sobic009G070250--Sobic005G127900 Sobic009G070250--Sobic008G120132 Sobic009G070250--Sobic005G110547 Sobic009G070250--Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic005G145800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G108225 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic010G165700 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic009G070250--Sobic005G115350 Sobic010G164500 Sobic010G164500 Sobic001G510300--Sobic010G164500 Sobic010G037600 Sobic010G037600 Sobic001G510300--Sobic010G037600 Sobic009G210900 Sobic009G210900 Sobic001G510300--Sobic009G210900 Sobic001G510300--Sobic003G058100 Sobic001G510300--Sobic002G064900 Sobic001G510300--Sobic008G176900 Sobic008G159400 Sobic008G159400 Sobic001G510300--Sobic008G159400 Sobic001G537001 Sobic001G537001 Sobic001G510300--Sobic001G537001 Sobic004G070800 Sobic004G070800 Sobic001G510300--Sobic004G070800 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic008G120132--Sobic010G143000 Sobic008G120132--Sobic005G128800 Sobic008G120132--Sobic001G318100 Sobic008G120132--Sobic005G115400 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic008G120132--Sobic010G115900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic008G120132--Sobic009G214800 Sobic008G120132--Sobic009G070250 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic008G120132--Sobic001G353800 Sobic008G120132--Sobic005G108225 Sobic003G071901 Sobic003G071901 Sobic001G273000--Sobic003G071901 Sobic002G236500 Sobic002G236500 Sobic001G273000--Sobic002G236500 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G273000--Sobic002G035300 Sobic001G273000--Sobic005G145800 Sobic001G465500 Sobic001G465500 Sobic001G273000--Sobic001G465500 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G273000--Sobic001G091200 Sobic001G273000--Sobic005G115350 Sobic004G078500 Sobic004G078500 Sobic001G273000--Sobic004G078500 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic001G273000--Sobic002G343000
Octagon: transcription factors


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