Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G098230.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5X4
Pfam -
Panther DB PTHR12286 PTHR12286:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G50450 : Saccharopine dehydrogenase
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04260.1 : astaxanthin synthase KC28, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013088 , Zm00025a013095
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G024600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
2 Sobic.006G066000 - -
3 Sobic.004G332600 OsFBL15 - F-box domain and LRR containing protein, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
4 Sobic.002G054901 - -
5 Sobic.007G105000 - -
6 Sobic.003G058100 kelch repeat-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G123600 transcriptional regulator Sir2 family protein, putative, expressed K11416: SIRT6, NAD+-dependent protein deacetylase sirtuin 6
8 Sobic.007G178300 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
9 Sobic.002G327500 TKL_IRAK_DUF26-lc.10 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
10 Sobic.003G399900 pentatricopeptide repeat protein PPR1106-17, putative, expressed -
11 Sobic.006G061000 pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G094800 OsFBX125 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G368000 6-phosphogluconolactonase, putative, expressed K01057: PGLS, pgl, 6-phosphogluconolactonase
14 Sobic.006G084701 - -
15 Sobic.002G021066 - -
16 Sobic.010G248100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@ATEXO70G1, putative, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
17 Sobic.006G008300 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily C member, putative, expressed K11649: SWI/SNF related-matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily C
18 Sobic.001G130100 expressed protein -
19 Sobic.009G184600 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
20 Sobic.010G202900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G098230 Sobic008G098230 Sobic005G024600 Sobic005G024600 Sobic008G098230--Sobic005G024600 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic008G098230--Sobic006G066000 Sobic004G332600 Sobic004G332600 Sobic008G098230--Sobic004G332600 Sobic002G054901 Sobic002G054901 Sobic008G098230--Sobic002G054901 Sobic007G105000 Sobic007G105000 Sobic008G098230--Sobic007G105000 Sobic003G058100 Sobic003G058100 Sobic008G098230--Sobic003G058100 Sobic006G123600 Sobic006G123600 Sobic008G098230--Sobic006G123600 Sobic007G178300 Sobic007G178300 Sobic008G098230--Sobic007G178300 Sobic002G327500 Sobic002G327500 Sobic008G098230--Sobic002G327500 Sobic009G205000 Sobic009G205000 Sobic005G024600--Sobic009G205000 Sobic003G303000 Sobic003G303000 Sobic005G024600--Sobic003G303000 Sobic008G072050 Sobic008G072050 Sobic005G024600--Sobic008G072050 Sobic005G110550 Sobic005G110550 Sobic005G024600--Sobic005G110550 Sobic007G202000 Sobic007G202000 Sobic005G024600--Sobic007G202000 Sobic004G041000 Sobic004G041000 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Octagon: transcription factors


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