Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G478500.2,Sobic.001G478500.1
Synonym Sb01g044820
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQ28 , A0A1B6QQ22
Pfam PF12371
Panther DB PTHR22050
NCBI CDD KOG3620; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G66820 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g08740.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000983
Brachypodium PNT78018 , PNT78019 , KQK23238 , PNT78020
Barley HORVU4Hr1G077840.1 , HORVU4Hr1G077840.2
Wheat TraesCS4B02G302500 , TraesCS4D02G301000 , TraesCS4A02G002700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G324700 - -
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11 Sobic.008G111200 - -
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15 Sobic.001G425150 - -
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18 Sobic.002G167800 expressed protein -
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20 Sobic.008G070800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G478500 Sobic001G478500 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic001G478500--Sobic004G324700 Sobic008G054000 Sobic008G054000 Sobic001G478500--Sobic008G054000 Sobic010G190700 Sobic010G190700 Sobic001G478500--Sobic010G190700 Sobic010G183300 Sobic010G183300 Sobic001G478500--Sobic010G183300 Sobic001G501800 Sobic001G501800 Sobic001G478500--Sobic001G501800 Sobic002G257750 Sobic002G257750 Sobic001G478500--Sobic002G257750 Sobic001G518100 Sobic001G518100 Sobic001G478500--Sobic001G518100 Sobic001G244700 Sobic001G244700 Sobic001G478500--Sobic001G244700 Sobic006G259800 Sobic006G259800 Sobic001G478500--Sobic006G259800 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic004G324700--Sobic005G145550 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic004G324700--Sobic007G163001 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic004G324700--Sobic005G189300 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic004G324700--Sobic002G031900 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic004G324700--Sobic010G214500 Sobic008G111200 Sobic008G111200 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Octagon: transcription factors


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