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Transcriptome id Sobic.010G183300.1
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UniProt C5Z5L5
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cDNA sequences
Sobic.010G183300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G186900 - K12812: DDX39B, UAP56, ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
2 Sobic.002G257750 - -
3 Sobic.004G244900 expressed protein -
4 Sobic.003G119600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G054000 tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G201300 - -
7 Sobic.003G264800 expressed protein -
8 Sobic.002G383800 GTP-binding protein, putative, expressed K06944: uncharacterized protein
9 Sobic.005G106600 CGMC_MAPKCGMC_2.1 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
10 Sobic.004G344000 expressed protein -
11 Sobic.001G244700 RIO1 family protein, expressed K08851: TP53RK, PRPK, TP53 regulating kinase and related kinases
12 Sobic.003G253600 protein kinase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G337400 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G091600 methyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.001G133000 expressed protein -
16 Sobic.006G259800 inducer of CBF expression 2, putative, expressed -
17 Sobic.001G333500 chaperone protein clpB 1, putative, expressed K03695: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB
18 Sobic.003G077700 DUF647 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G243600 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G173600 serine racemase, putative, expressed K12235: serine racemase


Gene co-expression network
sample Sobic010G183300 Sobic010G183300 Sobic003G186900 Sobic003G186900 Sobic010G183300--Sobic003G186900 Sobic002G257750 Sobic002G257750 Sobic010G183300--Sobic002G257750 Sobic004G244900 Sobic004G244900 Sobic010G183300--Sobic004G244900 Sobic003G119600 Sobic003G119600 Sobic010G183300--Sobic003G119600 Sobic008G054000 Sobic008G054000 Sobic010G183300--Sobic008G054000 Sobic009G201300 Sobic009G201300 Sobic010G183300--Sobic009G201300 Sobic003G264800 Sobic003G264800 Sobic010G183300--Sobic003G264800 Sobic002G383800 Sobic002G383800 Sobic010G183300--Sobic002G383800 Sobic005G106600 Sobic005G106600 Sobic010G183300--Sobic005G106600 Sobic003G166200 Sobic003G166200 Sobic003G186900--Sobic003G166200 Sobic003G186900--Sobic003G264800 Sobic003G186900--Sobic005G106600 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic003G186900--Sobic006G219600 Sobic002G072400 Sobic002G072400 Sobic003G186900--Sobic002G072400 Sobic004G337400 Sobic004G337400 Sobic003G186900--Sobic004G337400 Sobic010G171600 Sobic010G171600 Sobic003G186900--Sobic010G171600 Sobic001G333800 Sobic001G333800 Sobic003G186900--Sobic001G333800 Sobic001G207800 Sobic001G207800 Sobic003G186900--Sobic001G207800 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic002G257750--Sobic003G398700 Sobic002G257750--Sobic005G106600 Sobic002G257750--Sobic003G119600 Sobic003G253600 Sobic003G253600 Sobic002G257750--Sobic003G253600 Sobic006G185100 Sobic006G185100 Sobic002G257750--Sobic006G185100 Sobic003G388100 Sobic003G388100 Sobic002G257750--Sobic003G388100 Sobic006G050700 Sobic006G050700 Sobic002G257750--Sobic006G050700 Sobic002G257750--Sobic004G244900 Sobic010G132600 Sobic010G132600 Sobic002G257750--Sobic010G132600 Sobic001G457800 Sobic001G457800 Sobic004G244900--Sobic001G457800 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic004G244900--Sobic004G334300 Sobic004G244900--Sobic003G119600 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic004G244900--Sobic003G155100 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic004G244900--Sobic008G001200 Sobic004G356700 Sobic004G356700 Sobic004G244900--Sobic004G356700 Sobic004G244900--Sobic009G201300 Sobic002G275700 Sobic002G275700 Sobic004G244900--Sobic002G275700 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic004G244900--Sobic003G168100 Sobic003G119600--Sobic009G201300 Sobic001G439300 Sobic001G439300 Sobic003G119600--Sobic001G439300 Sobic002G325300 Sobic002G325300 Sobic003G119600--Sobic002G325300 Sobic003G119600--Sobic004G244900 Sobic003G119600--Sobic002G257750 Sobic003G119600--Sobic005G106600 Sobic003G119600--Sobic004G356700 Sobic003G119600--Sobic003G253600 Sobic003G354600 Sobic003G354600 Sobic003G119600--Sobic003G354600 Sobic008G054000--Sobic004G244900 Sobic008G054000--Sobic004G356700 Sobic008G054000--Sobic004G334300 Sobic008G054000--Sobic002G257750 Sobic008G044100 Sobic008G044100 Sobic008G054000--Sobic008G044100 Sobic008G054000--Sobic003G398700 Sobic003G101700 Sobic003G101700 Sobic008G054000--Sobic003G101700 Sobic002G316600 Sobic002G316600 Sobic008G054000--Sobic002G316600 Sobic002G344000 Sobic002G344000 Sobic008G054000--Sobic002G344000 Sobic009G201300--Sobic006G219600 Sobic009G201300--Sobic003G155100 Sobic009G201300--Sobic006G050700 Sobic009G201300--Sobic003G119600 Sobic009G201300--Sobic004G244900 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic009G201300--Sobic001G133000 Sobic009G201300--Sobic008G001200 Sobic009G201300--Sobic001G457800 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic009G201300--Sobic002G211800 Sobic003G264800--Sobic003G186900 Sobic003G003450 Sobic003G003450 Sobic003G264800--Sobic003G003450 Sobic006G232600 Sobic006G232600 Sobic003G264800--Sobic006G232600 Sobic003G264800--Sobic005G106600 Sobic003G264800--Sobic002G072400 Sobic009G103000 Sobic009G103000 Sobic003G264800--Sobic009G103000 Sobic004G238200 Sobic004G238200 Sobic003G264800--Sobic004G238200 Sobic004G207400 Sobic004G207400 Sobic003G264800--Sobic004G207400 Sobic003G264800--Sobic004G337400 Sobic008G070800 Sobic008G070800 Sobic002G383800--Sobic008G070800 Sobic003G221400 Sobic003G221400 Sobic002G383800--Sobic003G221400 Sobic001G355800 Sobic001G355800 Sobic002G383800--Sobic001G355800 Sobic001G333100 Sobic001G333100 Sobic002G383800--Sobic001G333100 Sobic002G131200 Sobic002G131200 Sobic002G383800--Sobic002G131200 Sobic002G383800--Sobic008G054000 Sobic003G311900 Sobic003G311900 Sobic002G383800--Sobic003G311900 Sobic002G311100 Sobic002G311100 Sobic002G383800--Sobic002G311100 Sobic004G131800 Sobic004G131800 Sobic002G383800--Sobic004G131800 Sobic003G220100 Sobic003G220100 Sobic005G106600--Sobic003G220100 Sobic005G106600--Sobic001G333800 Sobic009G038900 Sobic009G038900 Sobic005G106600--Sobic009G038900 Sobic005G106600--Sobic001G133000 Sobic004G312600 Sobic004G312600 Sobic005G106600--Sobic004G312600 Sobic007G058100 Sobic007G058100 Sobic005G106600--Sobic007G058100 Sobic007G136200 Sobic007G136200 Sobic005G106600--Sobic007G136200 Sobic005G106600--Sobic006G219600 Sobic001G378100 Sobic001G378100 Sobic005G106600--Sobic001G378100
Octagon: transcription factors


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