Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G257750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5R4
Pfam PF14968
Panther DB PTHR31198
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24900 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g32940.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047577 , Zm00025a014304
Brachypodium PNT64894
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G398700 expressed protein K15210: snRNA-activating protein complex subunit 3
2 Sobic.005G106600 CGMC_MAPKCGMC_2.1 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
3 Sobic.003G119600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G253600 protein kinase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G185100 ranBP1 domain containing protein, expressed K14295: NUP50, nuclear pore complex protein Nup50
6 Sobic.003G388100 expressed protein -
7 Sobic.006G050700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
8 Sobic.004G244900 expressed protein -
9 Sobic.010G132600 selenoprotein O, putative, expressed -
10 Sobic.008G044100 expressed protein -
11 Sobic.008G054000 tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G530900 expressed protein -
13 Sobic.003G155100 suppressor of Mek, putative, expressed K17491: SMEK, protein phosphatase 4 regulatory subunit 3
14 Sobic.010G123600 WW domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G456900 expressed protein -
16 Sobic.003G220100 - -
17 Sobic.004G042200 OsFBO8 - F-box and other domain containing protein, expressed K12115: clock-associated PAS protein ZTL
18 Sobic.007G136800 polypyrimidine tract-binding protein, putative, expressed K14948: PTBP2, polypyrimidine tract-binding protein 2
19 Sobic.002G344000 expressed protein -
20 Sobic.001G133000 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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