Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G530900.1
Synonym Sb01g049380
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQZ3
Pfam -
Panther DB PTHR31755:SF1 PTHR31755
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G36320 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g20110.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034331 , Zm00025a010987
Brachypodium PNT72139 , PNT72140
Barley -
Wheat TraesCS1A02G002300 , TraesCS1B02G001600 , TraesCS1B02G001600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G530900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G002700 expressed protein -
2 Sobic.009G215500 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K15196: BRF1, transcription factor IIIB 90 kDa subunit
3 Sobic.001G378100 relA-SpoT like protein RSH1, putative, expressed -
4 Sobic.007G185700 CRS2-associated factor 1, chloroplast precursor, putative, expressed -
5 Sobic.005G118400 expressed protein -
6 Sobic.005G084500 uncharacterized protein yqxC, putative, expressed K06442: 23S rRNA (cytidine1920-2'-O)/16S rRNA (cytidine1409-2'-O)-methyltransferase
7 Sobic.003G332700 Os1bglu5 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
8 Sobic.001G465700 aminotransferase, putative, expressed K00833: adenosylmethionine---8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
9 Sobic.003G217700 - -
10 Sobic.001G374100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
11 Sobic.008G044100 expressed protein -
12 Sobic.004G042200 OsFBO8 - F-box and other domain containing protein, expressed K12115: clock-associated PAS protein ZTL
13 Sobic.001G133000 expressed protein -
14 Sobic.002G118200 tetratricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed K03255: TIF31, protein TIF31
15 Sobic.003G155100 suppressor of Mek, putative, expressed K17491: SMEK, protein phosphatase 4 regulatory subunit 3
16 Sobic.004G134200 GTP binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G337400 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G043800 uncharacterized protein ycf45, putative, expressed -
19 Sobic.003G017100 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G077700 DUF647 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G530900 Sobic001G530900 Sobic010G002700 Sobic010G002700 Sobic001G530900--Sobic010G002700 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic001G530900--Sobic009G215500 Sobic001G378100 Sobic001G378100 Sobic001G530900--Sobic001G378100 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic001G530900--Sobic007G185700 Sobic005G118400 Sobic005G118400 Sobic001G530900--Sobic005G118400 Sobic005G084500 Sobic005G084500 Sobic001G530900--Sobic005G084500 Sobic003G332700 Sobic003G332700 Sobic001G530900--Sobic003G332700 Sobic001G465700 Sobic001G465700 Sobic001G530900--Sobic001G465700 Sobic003G217700 Sobic003G217700 Sobic001G530900--Sobic003G217700 Sobic003G017100 Sobic003G017100 Sobic010G002700--Sobic003G017100 Sobic001G169900 Sobic001G169900 Sobic010G002700--Sobic001G169900 Sobic010G002700--Sobic005G118400 Sobic010G043800 Sobic010G043800 Sobic010G002700--Sobic010G043800 Sobic010G002700--Sobic001G378100 Sobic007G136200 Sobic007G136200 Sobic010G002700--Sobic007G136200 Sobic003G276300 Sobic003G276300 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Octagon: transcription factors


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