Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G175400.2,Sobic.004G175400.1
Synonym Sb04g022550
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNS0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18560 : BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g02100.2 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G248801 - -
2 Sobic.004G086150 - -
3 Sobic.005G053200 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
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15 Sobic.008G187632 - -
16 Sobic.009G123900 L1P family of ribosomal proteins domain containing protein, expressed K02863: RP-L1, MRPL1, large subunit ribosomal protein L1
17 Sobic.007G095300 cbbY protein-related, putative, expressed -
18 Sobic.005G149200 ABC1 family domain containing protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
19 Sobic.001G419600 DnaK family protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G061100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA


Gene co-expression network
sample Sobic004G175400 Sobic004G175400 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic004G175400--Sobic009G248801 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic004G175400--Sobic004G086150 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic004G175400--Sobic005G053200 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic004G175400--Sobic001G000501 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic004G175400--Sobic007G090403 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic004G175400--Sobic001G459600 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic004G175400--Sobic001G517800 Sobic009G098200 Sobic009G098200 Sobic004G175400--Sobic009G098200 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic004G175400--Sobic004G003600 Sobic009G248801--Sobic004G086150 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic009G248801--Sobic002G244200 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic009G248801--Sobic003G160100 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic009G248801--Sobic005G095000 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic009G248801--Sobic007G202300 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic009G248801--Sobic005G133600 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic009G248801--Sobic008G101100 Sobic009G248801--Sobic007G090403 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic009G248801--Sobic008G166550 Sobic004G086150--Sobic009G248801 Sobic004G086150--Sobic003G160100 Sobic004G086150--Sobic002G244200 Sobic004G086150--Sobic005G095000 Sobic002G196600 Sobic002G196600 Sobic004G086150--Sobic002G196600 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic004G086150--Sobic005G068700 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic004G086150--Sobic009G123900 Sobic004G086150--Sobic007G090403 Sobic004G086150--Sobic004G175400 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G053200--Sobic007G010700 Sobic004G070500 Sobic004G070500 Sobic005G053200--Sobic004G070500 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic005G053200--Sobic002G249300 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic005G053200--Sobic003G174301 Sobic005G053200--Sobic001G000501 Sobic005G053200--Sobic009G248801 Sobic005G053200--Sobic005G133600 Sobic010G227800 Sobic010G227800 Sobic005G053200--Sobic010G227800 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic005G053200--Sobic005G089400 Sobic001G000501--Sobic001G459600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic005G089400 Sobic001G000501--Sobic007G010700 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic001G000501--Sobic008G084300 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G000501--Sobic005G149700 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G000501--Sobic004G034600 Sobic001G000501--Sobic005G053200 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic001G000501--Sobic004G253700 Sobic007G090403--Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic002G244200 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic007G090403--Sobic006G219600 Sobic001G062900 Sobic001G062900 Sobic007G090403--Sobic001G062900 Sobic005G149200 Sobic005G149200 Sobic007G090403--Sobic005G149200 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic007G090403--Sobic001G133000 Sobic007G090403--Sobic009G123900 Sobic006G065100 Sobic006G065100 Sobic007G090403--Sobic006G065100 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic007G090403--Sobic009G215500 Sobic001G459600--Sobic001G517800 Sobic001G459600--Sobic001G000501 Sobic001G459600--Sobic004G034600 Sobic001G459600--Sobic001G000700 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G166550 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic005G133600 Sobic001G517800--Sobic001G459600 Sobic003G301900 Sobic003G301900 Sobic001G517800--Sobic003G301900 Sobic001G517800--Sobic004G034600 Sobic010G020800 Sobic010G020800 Sobic001G517800--Sobic010G020800 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic001G517800--Sobic009G011600 Sobic001G517800--Sobic005G149200 Sobic003G320700 Sobic003G320700 Sobic001G517800--Sobic003G320700 Sobic003G322700 Sobic003G322700 Sobic001G517800--Sobic003G322700 Sobic002G146300 Sobic002G146300 Sobic001G517800--Sobic002G146300 Sobic009G098200--Sobic001G459600 Sobic003G317500 Sobic003G317500 Sobic009G098200--Sobic003G317500 Sobic009G098200--Sobic002G418800 Sobic009G098200--Sobic004G175400 Sobic009G098200--Sobic001G000501 Sobic009G098200--Sobic001G517800 Sobic009G098200--Sobic001G000700 Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic009G098200--Sobic010G057633 Sobic009G098200--Sobic009G248801 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic004G003600--Sobic007G095300 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic004G003600--Sobic001G419600 Sobic004G003600--Sobic004G175400 Sobic003G409000 Sobic003G409000 Sobic004G003600--Sobic003G409000 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic004G003600--Sobic003G232001 Sobic001G038601 Sobic001G038601 Sobic004G003600--Sobic001G038601 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic004G003600--Sobic002G077400 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic004G003600--Sobic003G180600 Sobic008G029200 Sobic008G029200 Sobic004G003600--Sobic008G029200
Octagon: transcription factors


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