Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K010300.1
Synonym GLT1, Sb1257s002010
Functional annotation glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt -
Pfam PF00310
Panther DB PTHR11938 PTHR11938:SF109
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53460 : NADH-dependent glutamate synthase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g48960.1 : glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047871 , Zm00025a047870 , Zm00025a052604 , Zm00025a038839 , Zm00025a031184 , Zm00025a051630 , Zm00025a028023 , Zm00025a042520 , Zm00025a009788
Brachypodium KQK09208
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.001G504900 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K13071: PAO, pheophorbide a oxygenase


Gene co-expression network
sample SobicK010300 SobicK010300 Sobic004G338701 Sobic004G338701 SobicK010300--Sobic004G338701 Sobic004G161501 Sobic004G161501 SobicK010300--Sobic004G161501 Sobic004G150700 Sobic004G150700 SobicK010300--Sobic004G150700 Sobic006G035400 Sobic006G035400 SobicK010300--Sobic006G035400 Sobic002G153200 Sobic002G153200 SobicK010300--Sobic002G153200 Sobic002G162450 Sobic002G162450 SobicK010300--Sobic002G162450 Sobic003G227501 Sobic003G227501 SobicK010300--Sobic003G227501 Sobic006G036700 Sobic006G036700 SobicK010300--Sobic006G036700 Sobic009G007200 Sobic009G007200 SobicK010300--Sobic009G007200 Sobic004G338701--SobicK010300 Sobic004G338701--Sobic004G161501 Sobic004G338701--Sobic004G150700 Sobic004G338701--Sobic002G153200 Sobic004G338701--Sobic009G007200 Sobic004G102750 Sobic004G102750 Sobic004G338701--Sobic004G102750 Sobic004G338701--Sobic006G035400 Sobic003G442601 Sobic003G442601 Sobic004G338701--Sobic003G442601 Sobic001G504900 Sobic001G504900 Sobic004G338701--Sobic001G504900 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic006G035400 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic002G153200 Sobic004G161501--Sobic004G338701 Sobic004G161501--Sobic009G007200 Sobic004G161501--SobicK010300 Sobic004G161501--Sobic002G162450 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic004G161501--Sobic002G143766 Sobic004G150700--Sobic002G153200 Sobic004G150700--Sobic004G338701 Sobic004G150700--SobicK010300 Sobic004G150700--Sobic004G161501 Sobic004G150700--Sobic002G143766 Sobic004G150700--Sobic009G007200 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic004G150700--Sobic001G233300 Sobic004G150700--Sobic001G504900 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic004G150700--Sobic004G154532 Sobic006G035400--Sobic006G036700 Sobic006G035400--Sobic004G161501 Sobic006G035400--Sobic010G060800 Sobic006G035400--Sobic003G227501 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic006G035400--Sobic010G024200 Sobic006G035400--Sobic002G153200 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic006G035400--Sobic010G145500 Sobic001G268000 Sobic001G268000 Sobic006G035400--Sobic001G268000 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic006G035400--Sobic010G271901 Sobic002G153200--Sobic002G143766 Sobic002G153200--Sobic009G007200 Sobic002G153200--Sobic001G233300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G153200--Sobic001G542150 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic005G077300 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic004G161501 Sobic002G153200--Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G154532 Sobic002G162450--Sobic010G060800 Sobic002G162450--Sobic008G003800 Sobic006G222000 Sobic006G222000 Sobic002G162450--Sobic006G222000 Sobic008G010000 Sobic008G010000 Sobic002G162450--Sobic008G010000 Sobic005G157733 Sobic005G157733 Sobic002G162450--Sobic005G157733 Sobic006G241100 Sobic006G241100 Sobic002G162450--Sobic006G241100 Sobic002G162450--Sobic004G161501 Sobic007G022000 Sobic007G022000 Sobic002G162450--Sobic007G022000 Sobic006G225700 Sobic006G225700 Sobic002G162450--Sobic006G225700 Sobic003G227501--Sobic004G154532 Sobic003G227501--Sobic006G036700 Sobic004G154466 Sobic004G154466 Sobic003G227501--Sobic004G154466 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic003G227501--Sobic003G348000 Sobic003G227501--Sobic006G035400 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic003G227501--Sobic002G171101 Sobic003G227501--Sobic004G102750 Sobic003G227501--Sobic010G145500 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic003G227501--Sobic005G205200 Sobic006G036700--Sobic006G035400 Sobic006G036700--Sobic003G227501 Sobic006G036700--Sobic010G271901 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic006G036700--Sobic005G221900 Sobic006G036700--Sobic010G024200 Sobic006G036700--Sobic004G154532 Sobic006G036700--Sobic005G205200 Sobic006G036700--Sobic010G060800 Sobic006G036700--Sobic010G145500 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic002G153200 Sobic009G007200--Sobic002G143766 Sobic009G007200--Sobic004G154532 Sobic009G007200--Sobic005G077300 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic009G007200--Sobic003G232001 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic009G007200--Sobic005G077200 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic005G081900 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic009G007200--Sobic007G095300
Octagon: transcription factors


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