Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G003800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PAN4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G060800 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G010000 expressed protein -
3 Sobic.010G024200 expressed protein -
4 Sobic.005G221900 - -
5 Sobic.004G161501 - -
6 Sobic.005G223925 - -
7 Sobic.002G162450 - -
8 Sobic.005G223600 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
9 Sobic.005G205200 - -
10 Sobic.006G222000 MBTB6 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.006G036700 - -
12 Sobic.005G081900 - -
13 Sobic.006G035400 - -
14 Sobic.004G156950 - -
15 Sobic.006G225700 expressed protein -
16 Sobic.004G154532 - -
17 Sobic.003G227501 - -
18 Sobic.006G241100 Leucine Rich Repeat domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G027232 - -
20 Sobic.009G007200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic008G003800--Sobic010G060800 Sobic008G010000 Sobic008G010000 Sobic008G003800--Sobic008G010000 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic008G003800--Sobic010G024200 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic008G003800--Sobic005G221900 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic008G003800--Sobic004G161501 Sobic005G223925 Sobic005G223925 Sobic008G003800--Sobic005G223925 Sobic002G162450 Sobic002G162450 Sobic008G003800--Sobic002G162450 Sobic005G223600 Sobic005G223600 Sobic008G003800--Sobic005G223600 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic008G003800--Sobic005G205200 Sobic010G060800--Sobic008G003800 Sobic010G060800--Sobic010G024200 Sobic010G060800--Sobic008G010000 Sobic010G060800--Sobic005G221900 Sobic006G222000 Sobic006G222000 Sobic010G060800--Sobic006G222000 Sobic010G060800--Sobic002G162450 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic010G060800--Sobic005G081900 Sobic006G035400 Sobic006G035400 Sobic010G060800--Sobic006G035400 Sobic010G060800--Sobic004G161501 Sobic008G010000--Sobic008G003800 Sobic008G010000--Sobic010G060800 Sobic008G010000--Sobic010G024200 Sobic008G010000--Sobic005G221900 Sobic008G010000--Sobic002G162450 Sobic008G010000--Sobic005G223925 Sobic008G010000--Sobic005G223600 Sobic008G010000--Sobic006G222000 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic008G010000--Sobic006G036700 Sobic010G024200--Sobic005G221900 Sobic010G024200--Sobic010G060800 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic010G024200--Sobic001G419600 Sobic010G024200--Sobic006G036700 Sobic010G024200--Sobic008G003800 Sobic010G024200--Sobic005G205200 Sobic010G024200--Sobic005G223925 Sobic010G024200--Sobic005G223600 Sobic010G024200--Sobic008G010000 Sobic005G221900--Sobic010G024200 Sobic005G221900--Sobic005G223925 Sobic005G221900--Sobic005G223600 Sobic005G221900--Sobic010G060800 Sobic005G221900--Sobic006G036700 Sobic005G221900--Sobic001G419600 Sobic005G221900--Sobic008G003800 Sobic005G221900--Sobic005G205200 Sobic005G221900--Sobic008G010000 Sobic004G161501--Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic006G035400 Sobic004G161501--Sobic010G060800 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic004G161501--Sobic002G153200 Sobic004G338701 Sobic004G338701 Sobic004G161501--Sobic004G338701 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic004G161501--Sobic009G007200 SobicK010300 SobicK010300 Sobic004G161501--SobicK010300 Sobic004G161501--Sobic002G162450 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic004G161501--Sobic002G143766 Sobic005G223925--Sobic005G223600 Sobic005G223925--Sobic005G221900 Sobic005G208200 Sobic005G208200 Sobic005G223925--Sobic005G208200 Sobic005G223925--Sobic005G205200 Sobic005G223925--Sobic010G024200 Sobic005G223925--Sobic008G003800 Sobic007G005900 Sobic007G005900 Sobic005G223925--Sobic007G005900 Sobic008G012100 Sobic008G012100 Sobic005G223925--Sobic008G012100 Sobic005G223925--Sobic008G010000 Sobic002G162450--Sobic010G060800 Sobic002G162450--Sobic008G003800 Sobic002G162450--Sobic006G222000 Sobic002G162450--Sobic008G010000 Sobic005G157733 Sobic005G157733 Sobic002G162450--Sobic005G157733 Sobic006G241100 Sobic006G241100 Sobic002G162450--Sobic006G241100 Sobic002G162450--Sobic004G161501 Sobic007G022000 Sobic007G022000 Sobic002G162450--Sobic007G022000 Sobic006G225700 Sobic006G225700 Sobic002G162450--Sobic006G225700 Sobic005G223600--Sobic005G223925 Sobic005G223600--Sobic005G208200 Sobic005G223600--Sobic005G221900 Sobic005G223600--Sobic005G205200 Sobic005G223600--Sobic010G024200 Sobic005G223600--Sobic008G012100 Sobic005G223600--Sobic007G005900 Sobic005G223600--Sobic008G003800 Sobic010G208750 Sobic010G208750 Sobic005G223600--Sobic010G208750 Sobic005G205200--Sobic005G208200 Sobic005G205200--Sobic005G223600 Sobic005G205200--Sobic005G223925 Sobic005G205200--Sobic010G024200 Sobic005G205200--Sobic005G221900 Sobic005G205200--Sobic008G003800 Sobic005G205200--Sobic006G036700 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic005G205200--Sobic003G348000 Sobic005G205200--Sobic010G060800
Octagon: transcription factors


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