Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G156950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN42
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g43960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK01381
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G003800 - -
2 Sobic.010G208750 - K02887: RP-L20, MRPL20, large subunit ribosomal protein L20
3 Sobic.007G163433 - -
4 Sobic.005G223925 - -
5 Sobic.005G205200 - -
6 Sobic.008G012100 csAtPR5, putative, expressed -
7 Sobic.003G340350 - -
8 Sobic.004G206800 - -
9 Sobic.005G208200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
10 Sobic.005G223600 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
11 Sobic.002G021900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsWAK80 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
12 Sobic.003G348000 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G024200 expressed protein -
14 Sobic.002G052100 early light-induced protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G052000 early light-induced protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G109200 - -
17 Sobic.009G180550 - -
18 Sobic.005G073800 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G280100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G221900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G156950 Sobic004G156950 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic004G156950--Sobic008G003800 Sobic010G208750 Sobic010G208750 Sobic004G156950--Sobic010G208750 Sobic007G163433 Sobic007G163433 Sobic004G156950--Sobic007G163433 Sobic005G223925 Sobic005G223925 Sobic004G156950--Sobic005G223925 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic004G156950--Sobic005G205200 Sobic008G012100 Sobic008G012100 Sobic004G156950--Sobic008G012100 Sobic003G340350 Sobic003G340350 Sobic004G156950--Sobic003G340350 Sobic004G206800 Sobic004G206800 Sobic004G156950--Sobic004G206800 Sobic005G208200 Sobic005G208200 Sobic004G156950--Sobic005G208200 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic008G003800--Sobic010G060800 Sobic008G010000 Sobic008G010000 Sobic008G003800--Sobic008G010000 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic008G003800--Sobic010G024200 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic008G003800--Sobic005G221900 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic008G003800--Sobic004G161501 Sobic008G003800--Sobic005G223925 Sobic002G162450 Sobic002G162450 Sobic008G003800--Sobic002G162450 Sobic005G223600 Sobic005G223600 Sobic008G003800--Sobic005G223600 Sobic008G003800--Sobic005G205200 Sobic010G208750--Sobic008G012100 Sobic002G021900 Sobic002G021900 Sobic010G208750--Sobic002G021900 Sobic010G208750--Sobic007G163433 Sobic010G208750--Sobic003G340350 Sobic010G208750--Sobic004G206800 Sobic008G012150 Sobic008G012150 Sobic010G208750--Sobic008G012150 Sobic002G109200 Sobic002G109200 Sobic010G208750--Sobic002G109200 Sobic010G208750--Sobic005G208200 Sobic002G052100 Sobic002G052100 Sobic010G208750--Sobic002G052100 Sobic007G163433--Sobic003G340350 Sobic007G163433--Sobic004G206800 Sobic007G163433--Sobic002G021900 Sobic007G163433--Sobic008G012100 Sobic007G163433--Sobic002G052100 Sobic009G180550 Sobic009G180550 Sobic007G163433--Sobic009G180550 Sobic002G052000 Sobic002G052000 Sobic007G163433--Sobic002G052000 Sobic007G163433--Sobic002G109200 Sobic007G163433--Sobic010G208750 Sobic005G223925--Sobic005G223600 Sobic005G223925--Sobic005G221900 Sobic005G223925--Sobic005G208200 Sobic005G223925--Sobic005G205200 Sobic005G223925--Sobic010G024200 Sobic005G223925--Sobic008G003800 Sobic007G005900 Sobic007G005900 Sobic005G223925--Sobic007G005900 Sobic005G223925--Sobic008G012100 Sobic005G223925--Sobic008G010000 Sobic005G205200--Sobic005G208200 Sobic005G205200--Sobic005G223600 Sobic005G205200--Sobic005G223925 Sobic005G205200--Sobic010G024200 Sobic005G205200--Sobic005G221900 Sobic005G205200--Sobic008G003800 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic005G205200--Sobic006G036700 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic005G205200--Sobic003G348000 Sobic005G205200--Sobic010G060800 Sobic008G012100--Sobic008G012150 Sobic008G012100--Sobic007G163433 Sobic008G012100--Sobic002G021900 Sobic008G012100--Sobic003G340350 Sobic008G012100--Sobic004G206800 Sobic008G012100--Sobic010G208750 Sobic008G012100--Sobic002G109200 Sobic008G012100--Sobic002G052100 Sobic008G012100--Sobic005G208200 Sobic003G340350--Sobic004G206800 Sobic003G340350--Sobic007G163433 Sobic003G340350--Sobic002G021900 Sobic003G340350--Sobic008G012100 Sobic003G340350--Sobic002G052100 Sobic003G340350--Sobic002G052000 Sobic003G340350--Sobic009G180550 Sobic002G108700 Sobic002G108700 Sobic003G340350--Sobic002G108700 Sobic003G340350--Sobic002G109200 Sobic004G206800--Sobic003G340350 Sobic004G206800--Sobic007G163433 Sobic004G206800--Sobic002G021900 Sobic004G206800--Sobic008G012100 Sobic004G206800--Sobic002G108700 Sobic004G206800--Sobic002G052100 Sobic004G206800--Sobic002G052000 Sobic004G206800--Sobic009G180550 Sobic004G206800--Sobic002G109200 Sobic005G208200--Sobic005G223600 Sobic003G080300 Sobic003G080300 Sobic005G208200--Sobic003G080300 Sobic005G208200--Sobic008G012100 Sobic005G208200--Sobic005G205200 Sobic005G208200--Sobic005G223925 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic005G208200--Sobic005G073800 Sobic005G208200--Sobic010G208750 Sobic007G006200 Sobic007G006200 Sobic005G208200--Sobic007G006200 Sobic004G344600 Sobic004G344600 Sobic005G208200--Sobic004G344600
Octagon: transcription factors


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