Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G073800.2
Synonym Sb05g006110
Functional annotation OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5Y6T0
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10400 : F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g09970.1 : OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G208200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
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Gene co-expression network
sample Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic005G208200 Sobic005G208200 Sobic005G073800--Sobic005G208200 Sobic003G080300 Sobic003G080300 Sobic005G073800--Sobic003G080300 Sobic009G180550 Sobic009G180550 Sobic005G073800--Sobic009G180550 Sobic008G012100 Sobic008G012100 Sobic005G073800--Sobic008G012100 Sobic004G223400 Sobic004G223400 Sobic005G073800--Sobic004G223400 Sobic010G208750 Sobic010G208750 Sobic005G073800--Sobic010G208750 Sobic008G012150 Sobic008G012150 Sobic005G073800--Sobic008G012150 Sobic002G021900 Sobic002G021900 Sobic005G073800--Sobic002G021900 Sobic005G167000 Sobic005G167000 Sobic005G073800--Sobic005G167000 Sobic005G223600 Sobic005G223600 Sobic005G208200--Sobic005G223600 Sobic005G208200--Sobic003G080300 Sobic005G208200--Sobic008G012100 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic005G208200--Sobic005G205200 Sobic005G223925 Sobic005G223925 Sobic005G208200--Sobic005G223925 Sobic005G208200--Sobic005G073800 Sobic005G208200--Sobic010G208750 Sobic007G006200 Sobic007G006200 Sobic005G208200--Sobic007G006200 Sobic004G344600 Sobic004G344600 Sobic005G208200--Sobic004G344600 Sobic003G080300--Sobic004G344600 Sobic009G246400 Sobic009G246400 Sobic003G080300--Sobic009G246400 Sobic010G178401 Sobic010G178401 Sobic003G080300--Sobic010G178401 Sobic003G080300--Sobic005G208200 Sobic009G259100 Sobic009G259100 Sobic003G080300--Sobic009G259100 Sobic002G161400 Sobic002G161400 Sobic003G080300--Sobic002G161400 Sobic001G112900 Sobic001G112900 Sobic003G080300--Sobic001G112900 Sobic003G080300--Sobic004G223400 Sobic003G340300 Sobic003G340300 Sobic003G080300--Sobic003G340300 Sobic007G163433 Sobic007G163433 Sobic009G180550--Sobic007G163433 Sobic009G180550--Sobic002G021900 Sobic003G340350 Sobic003G340350 Sobic009G180550--Sobic003G340350 Sobic004G206800 Sobic004G206800 Sobic009G180550--Sobic004G206800 Sobic009G180550--Sobic008G012100 Sobic002G052100 Sobic002G052100 Sobic009G180550--Sobic002G052100 Sobic009G180550--Sobic008G012150 Sobic009G180550--Sobic005G073800 Sobic002G052000 Sobic002G052000 Sobic009G180550--Sobic002G052000 Sobic008G012100--Sobic008G012150 Sobic008G012100--Sobic007G163433 Sobic008G012100--Sobic002G021900 Sobic008G012100--Sobic003G340350 Sobic008G012100--Sobic004G206800 Sobic008G012100--Sobic010G208750 Sobic002G109200 Sobic002G109200 Sobic008G012100--Sobic002G109200 Sobic008G012100--Sobic002G052100 Sobic008G012100--Sobic005G208200 Sobic010G138800 Sobic010G138800 Sobic004G223400--Sobic010G138800 Sobic004G223400--Sobic003G080300 Sobic002G030900 Sobic002G030900 Sobic004G223400--Sobic002G030900 Sobic002G072500 Sobic002G072500 Sobic004G223400--Sobic002G072500 Sobic008G115700 Sobic008G115700 Sobic004G223400--Sobic008G115700 Sobic010G100900 Sobic010G100900 Sobic004G223400--Sobic010G100900 Sobic006G243800 Sobic006G243800 Sobic004G223400--Sobic006G243800 Sobic003G295300 Sobic003G295300 Sobic004G223400--Sobic003G295300 Sobic001G434000 Sobic001G434000 Sobic004G223400--Sobic001G434000 Sobic010G208750--Sobic008G012100 Sobic010G208750--Sobic002G021900 Sobic010G208750--Sobic007G163433 Sobic010G208750--Sobic003G340350 Sobic010G208750--Sobic004G206800 Sobic010G208750--Sobic008G012150 Sobic010G208750--Sobic002G109200 Sobic010G208750--Sobic005G208200 Sobic010G208750--Sobic002G052100 Sobic008G012150--Sobic008G012100 Sobic008G012150--Sobic002G021900 Sobic008G012150--Sobic007G163433 Sobic008G012150--Sobic002G052100 Sobic008G012150--Sobic003G340350 Sobic003G175800 Sobic003G175800 Sobic008G012150--Sobic003G175800 Sobic008G012150--Sobic004G206800 Sobic008G012150--Sobic009G180550 Sobic006G020300 Sobic006G020300 Sobic008G012150--Sobic006G020300 Sobic002G021900--Sobic007G163433 Sobic002G021900--Sobic003G340350 Sobic002G021900--Sobic004G206800 Sobic002G021900--Sobic008G012100 Sobic002G021900--Sobic009G180550 Sobic002G021900--Sobic010G208750 Sobic002G021900--Sobic002G052100 Sobic002G021900--Sobic008G012150 Sobic002G021900--Sobic003G175800 Sobic010G178000 Sobic010G178000 Sobic005G167000--Sobic010G178000 Sobic010G045100 Sobic010G045100 Sobic005G167000--Sobic010G045100 Sobic001G250000 Sobic001G250000 Sobic005G167000--Sobic001G250000 Sobic010G207100 Sobic010G207100 Sobic005G167000--Sobic010G207100 Sobic005G167000--Sobic001G434000 Sobic003G154400 Sobic003G154400 Sobic005G167000--Sobic003G154400 Sobic006G036300 Sobic006G036300 Sobic005G167000--Sobic006G036300 Sobic005G167000--Sobic009G180550 Sobic003G157000 Sobic003G157000 Sobic005G167000--Sobic003G157000
Octagon: transcription factors


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