Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G241100.3
Synonym
Functional annotation Leucine Rich Repeat domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PNL0
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF118
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g46090.1 : Leucine Rich Repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G222000 MBTB6 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.006G225700 expressed protein -
3 Sobic.005G081900 - -
4 Sobic.007G201600 - -
5 Sobic.007G022000 importin subunit beta, putative, expressed K14293: KPNB1, importin subunit beta-1
6 Sobic.002G162450 - -
7 Sobic.010G060800 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
8 Sobic.007G094050 - -
9 Sobic.002G027232 - -
10 Sobic.008G053900 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
11 Sobic.010G145650 - -
12 Sobic.003G195700 OsSCP32 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed -
13 Sobic.005G157733 - -
14 Sobic.002G084600 - -
15 Sobic.008G003800 - -
16 Sobic.009G007200 expressed protein -
17 Sobic.008G010000 expressed protein -
18 Sobic.010G135900 - -
19 Sobic.004G227550 - -
20 Sobic.004G227550 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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