Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G338701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQ77
Pfam -
Panther DB PTHR31973 PTHR31973:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g37870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.K010300 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
2 Sobic.004G161501 - -
3 Sobic.004G150700 - -
4 Sobic.002G153200 - -
5 Sobic.009G007200 expressed protein -
6 Sobic.004G102750 - -
7 Sobic.006G035400 - -
8 Sobic.003G442601 - K03123: TFIIA2, GTF2A2, transcription initiation factor TFIIA small subunit
9 Sobic.001G504900 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K13071: PAO, pheophorbide a oxygenase
10 Sobic.003G227501 - -
11 Sobic.004G172300 OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G242500 glycosyl hydrolase family 47 domain contain protein, expressed K10084: ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1
13 Sobic.002G143766 - -
14 Sobic.002G107600 aldehyde oxidase, putative, expressed -
15 Sobic.001G233300 - -
16 Sobic.002G130000 dehydrodolichyl diphosphate synthase, putative, expressed K11778: DHDDS, RER2, ditrans,polycis-polyprenyl diphosphate synthase
17 Sobic.004G188500 nucleotide-sugar transporter family protein, putative, expressed K15272: solute carrier family 35 (UDP-sugar transporter), member A1/2/3
18 Sobic.002G420700 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@no apical meristem protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G542150 - -
20 Sobic.002G162450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G338701 Sobic004G338701 SobicK010300 SobicK010300 Sobic004G338701--SobicK010300 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic004G338701--Sobic004G161501 Sobic004G150700 Sobic004G150700 Sobic004G338701--Sobic004G150700 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic004G338701--Sobic002G153200 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic004G338701--Sobic009G007200 Sobic004G102750 Sobic004G102750 Sobic004G338701--Sobic004G102750 Sobic006G035400 Sobic006G035400 Sobic004G338701--Sobic006G035400 Sobic003G442601 Sobic003G442601 Sobic004G338701--Sobic003G442601 Sobic001G504900 Sobic001G504900 Sobic004G338701--Sobic001G504900 SobicK010300--Sobic004G338701 SobicK010300--Sobic004G161501 SobicK010300--Sobic004G150700 SobicK010300--Sobic006G035400 SobicK010300--Sobic002G153200 Sobic002G162450 Sobic002G162450 SobicK010300--Sobic002G162450 Sobic003G227501 Sobic003G227501 SobicK010300--Sobic003G227501 Sobic006G036700 Sobic006G036700 SobicK010300--Sobic006G036700 SobicK010300--Sobic009G007200 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic008G003800 Sobic004G161501--Sobic006G035400 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic010G060800 Sobic004G161501--Sobic002G153200 Sobic004G161501--Sobic004G338701 Sobic004G161501--Sobic009G007200 Sobic004G161501--SobicK010300 Sobic004G161501--Sobic002G162450 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic004G161501--Sobic002G143766 Sobic004G150700--Sobic002G153200 Sobic004G150700--Sobic004G338701 Sobic004G150700--SobicK010300 Sobic004G150700--Sobic004G161501 Sobic004G150700--Sobic002G143766 Sobic004G150700--Sobic009G007200 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic004G150700--Sobic001G233300 Sobic004G150700--Sobic001G504900 Sobic004G154532 Sobic004G154532 Sobic004G150700--Sobic004G154532 Sobic002G153200--Sobic002G143766 Sobic002G153200--Sobic009G007200 Sobic002G153200--Sobic001G233300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G153200--Sobic001G542150 Sobic005G077300 Sobic005G077300 Sobic002G153200--Sobic005G077300 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic001G000501 Sobic002G153200--Sobic004G161501 Sobic002G153200--Sobic004G150700 Sobic002G153200--Sobic004G154532 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic003G180600 Sobic009G007200--Sobic002G153200 Sobic009G007200--Sobic002G143766 Sobic009G007200--Sobic004G154532 Sobic009G007200--Sobic005G077300 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic009G007200--Sobic003G232001 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic009G007200--Sobic005G077200 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic009G007200--Sobic005G081900 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic009G007200--Sobic007G095300 Sobic007G097300 Sobic007G097300 Sobic004G102750--Sobic007G097300 Sobic004G102750--Sobic003G227501 Sobic004G102750--Sobic009G007200 Sobic004G102750--Sobic004G154532 Sobic004G188500 Sobic004G188500 Sobic004G102750--Sobic004G188500 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic004G102750--Sobic003G348000 Sobic004G102750--Sobic003G442601 Sobic004G102750--Sobic004G338701 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic004G102750--Sobic002G171101 Sobic006G035400--Sobic006G036700 Sobic006G035400--Sobic004G161501 Sobic006G035400--Sobic010G060800 Sobic006G035400--Sobic003G227501 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic006G035400--Sobic010G024200 Sobic006G035400--Sobic002G153200 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic006G035400--Sobic010G145500 Sobic001G268000 Sobic001G268000 Sobic006G035400--Sobic001G268000 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic006G035400--Sobic010G271901 Sobic009G080400 Sobic009G080400 Sobic003G442601--Sobic009G080400 Sobic010G272800 Sobic010G272800 Sobic003G442601--Sobic010G272800 Sobic010G020800 Sobic010G020800 Sobic003G442601--Sobic010G020800 Sobic006G104600 Sobic006G104600 Sobic003G442601--Sobic006G104600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic003G442601--Sobic005G149700 Sobic003G442601--Sobic003G227501 Sobic007G210500 Sobic007G210500 Sobic003G442601--Sobic007G210500 Sobic001G282600 Sobic001G282600 Sobic003G442601--Sobic001G282600 Sobic003G442601--Sobic003G348000 Sobic009G207600 Sobic009G207600 Sobic001G504900--Sobic009G207600 Sobic003G398100 Sobic003G398100 Sobic001G504900--Sobic003G398100 Sobic004G261900 Sobic004G261900 Sobic001G504900--Sobic004G261900 Sobic001G504900--Sobic005G149700 Sobic002G266000 Sobic002G266000 Sobic001G504900--Sobic002G266000 Sobic002G338100 Sobic002G338100 Sobic001G504900--Sobic002G338100 Sobic001G069900 Sobic001G069900 Sobic001G504900--Sobic001G069900 Sobic006G181300 Sobic006G181300 Sobic001G504900--Sobic006G181300 Sobic001G015500 Sobic001G015500 Sobic001G504900--Sobic001G015500
Octagon: transcription factors


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