Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G101800.1,Sobic.009G101800.2
Synonym Sb09g016180
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
peptide transporter PTR3-A, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R1Y0 , A0A1Z5R1Y1
Pfam PF00854
Panther DB PTHR11654 PTHR11654:SF155
NCBI CDD KOG1237; H+/oligopeptide symporter
KEGG Orthology K14638; SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G40460 : Major facilitator superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g27010.1 : peptide transporter PTR3-A, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK06827 , KQK06826
Barley HORVU7Hr1G106160.13 , HORVU7Hr1G106160.12 , HORVU7Hr1G106160.11 , HORVU7Hr1G106160.7 , HORVU7Hr1G106160.5 , HORVU7Hr1G106160.4 , HORVU7Hr1G106160.3 , HORVU7Hr1G106160.2 , HORVU7Hr1G106160.8
Wheat TraesCS7B02G362700 , TraesCS6A02G041300 , TraesCS7A02G461200 , TraesCS4D02G335100 , TraesCS7D02G491400 , TraesCS7D02G449400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G101800 Sobic009G101800 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic009G101800--Sobic008G166550 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic009G101800--Sobic007G202300 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic009G101800--Sobic008G101100 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic009G101800--Sobic009G248801 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic009G101800--Sobic002G115050 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic009G101800--Sobic002G097700 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic009G101800--Sobic002G017500 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic009G101800--Sobic003G416000 Sobic008G184900 Sobic008G184900 Sobic009G101800--Sobic008G184900 Sobic002G431500 Sobic002G431500 Sobic008G166550--Sobic002G431500 Sobic008G166550--Sobic007G202300 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic008G166550--Sobic002G244200 Sobic008G166550--Sobic003G416000 Sobic008G166550--Sobic008G101100 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic008G166550--Sobic005G095000 Sobic008G166550--Sobic002G017500 Sobic008G166550--Sobic002G115050 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic008G166550--Sobic005G093800 Sobic007G202300--Sobic008G166550 Sobic007G202300--Sobic002G244200 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic007G202300--Sobic001G000300 Sobic007G202300--Sobic009G248801 Sobic007G202300--Sobic008G101100 Sobic007G202300--Sobic002G017500 Sobic007G202300--Sobic003G416000 Sobic007G202300--Sobic005G093800 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic007G202300--Sobic007G185300 Sobic008G101100--Sobic003G416000 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic008G166550 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic008G101100--Sobic001G223550 Sobic008G101100--Sobic007G202300 Sobic008G101100--Sobic009G248801 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic005G133600 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic008G101100--Sobic005G089400 Sobic008G101100--Sobic002G017500 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic009G248801--Sobic004G086150 Sobic009G248801--Sobic002G244200 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic009G248801--Sobic003G160100 Sobic009G248801--Sobic005G095000 Sobic009G248801--Sobic007G202300 Sobic009G248801--Sobic005G133600 Sobic009G248801--Sobic008G101100 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic009G248801--Sobic007G090403 Sobic009G248801--Sobic008G166550 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G115050--Sobic005G075100 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic002G115050--Sobic010G141966 Sobic002G115050--Sobic005G093800 Sobic002G115050--Sobic008G166550 Sobic002G115050--Sobic002G097700 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic002G115050--Sobic002G115075 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G038800 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic002G115050--Sobic004G181600 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic002G115050--Sobic003G127001 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic002G097700--Sobic010G153201 Sobic002G097700--Sobic008G184900 Sobic002G097700--Sobic002G115050 Sobic002G097700--Sobic005G075100 Sobic002G097700--Sobic010G141966 Sobic010G100516 Sobic010G100516 Sobic002G097700--Sobic010G100516 Sobic005G118400 Sobic005G118400 Sobic002G097700--Sobic005G118400 Sobic002G097700--Sobic004G181600 Sobic001G038601 Sobic001G038601 Sobic002G097700--Sobic001G038601 Sobic002G017500--Sobic003G416000 Sobic003G080700 Sobic003G080700 Sobic002G017500--Sobic003G080700 Sobic002G017500--Sobic008G166550 Sobic002G017500--Sobic002G244200 Sobic002G017500--Sobic008G101100 Sobic002G017500--Sobic007G202300 Sobic002G017500--Sobic007G090403 Sobic002G017500--Sobic003G160100 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic002G017500--Sobic001G413000 Sobic003G416000--Sobic002G017500 Sobic003G416000--Sobic008G101100 Sobic003G416000--Sobic008G166550 Sobic003G416000--Sobic002G244200 Sobic003G416000--Sobic005G089400 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic007G202300 Sobic003G416000--Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic005G133600 Sobic008G185200 Sobic008G185200 Sobic008G184900--Sobic008G185200 Sobic008G184900--Sobic002G097700 Sobic008G184900--Sobic008G166550 Sobic008G184900--Sobic005G095000 Sobic008G184900--Sobic002G115050 Sobic002G379750 Sobic002G379750 Sobic008G184900--Sobic002G379750 Sobic009G194500 Sobic009G194500 Sobic008G184900--Sobic009G194500 Sobic008G184900--Sobic002G431500 Sobic001G251800 Sobic001G251800 Sobic008G184900--Sobic001G251800
Octagon: transcription factors


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