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Transcriptome id Sobic.005G110300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PRN6
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110200 - -
2 Sobic.002G008900 sister chromatid cohesion 2, putative, expressed K06672: SCC2, cohesin loading factor subunit SCC2
3 Sobic.004G174200 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
4 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39
5 Sobic.002G169633 - -
6 Sobic.004G010151 - -
7 Sobic.002G134200 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11293: HIRA, protein HIRA/HIR1
8 Sobic.010G239600 RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 family protein, putative, expressed K15216: RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
9 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
10 Sobic.008G185300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
12 Sobic.009G191000 MATH domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G070500 expressed protein -
14 Sobic.007G193700 Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G071400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11293: HIRA, protein HIRA/HIR1
16 Sobic.005G001000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K10643: CNOT4, NOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4
17 Sobic.010G256700 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
18 Sobic.006G182900 expressed protein -
19 Sobic.001G287201 - -
20 Sobic.001G375100 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110300 Sobic005G110300 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic005G110300--Sobic005G110200 Sobic002G008900 Sobic002G008900 Sobic005G110300--Sobic002G008900 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic005G110300--Sobic004G174200 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic005G110300--Sobic007G116200 Sobic002G169633 Sobic002G169633 Sobic005G110300--Sobic002G169633 Sobic004G010151 Sobic004G010151 Sobic005G110300--Sobic004G010151 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G110300--Sobic002G134200 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic005G110300--Sobic010G239600 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic005G110300--Sobic005G032800 Sobic005G110200--Sobic005G110300 Sobic005G110200--Sobic002G134200 Sobic005G110200--Sobic007G116200 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic005G110200--Sobic008G185300 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G110200--Sobic005G090401 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic005G110200--Sobic006G182900 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic005G032800 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic005G110200--Sobic006G032500 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic002G008900--Sobic009G191000 Sobic002G411600 Sobic002G411600 Sobic002G008900--Sobic002G411600 Sobic007G062800 Sobic007G062800 Sobic002G008900--Sobic007G062800 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic002G008900--Sobic003G422500 Sobic005G001000 Sobic005G001000 Sobic002G008900--Sobic005G001000 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic002G008900--Sobic010G010700 Sobic004G034900 Sobic004G034900 Sobic002G008900--Sobic004G034900 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic002G008900--Sobic010G206900 Sobic009G053900 Sobic009G053900 Sobic002G008900--Sobic009G053900 Sobic004G291900 Sobic004G291900 Sobic004G174200--Sobic004G291900 Sobic004G174200--Sobic002G411600 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic004G174200--Sobic008G001200 Sobic004G174200--Sobic010G206900 Sobic004G174200--Sobic002G008900 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic004G174200--Sobic001G289800 Sobic004G174200--Sobic005G001000 Sobic004G174200--Sobic003G422500 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic004G174200--Sobic001G194200 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic007G116200--Sobic006G216800 Sobic007G116200--Sobic010G010700 Sobic007G116200--Sobic002G134200 Sobic007G116200--Sobic006G182900 Sobic004G359800 Sobic004G359800 Sobic007G116200--Sobic004G359800 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic007G116200--Sobic010G139000 Sobic010G256700 Sobic010G256700 Sobic007G116200--Sobic010G256700 Sobic004G209600 Sobic004G209600 Sobic007G116200--Sobic004G209600 Sobic007G116200--Sobic003G280800 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic002G169633--Sobic001G072500 Sobic002G169633--Sobic005G032800 Sobic002G169633--Sobic004G359800 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic002G169633--Sobic004G263600 Sobic002G169633--Sobic004G174200 Sobic002G169633--Sobic010G239600 Sobic007G020500 Sobic007G020500 Sobic002G169633--Sobic007G020500 Sobic006G131500 Sobic006G131500 Sobic002G169633--Sobic006G131500 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic002G169633--Sobic007G193700 Sobic004G010151--Sobic005G110300 Sobic004G010151--Sobic007G116200 Sobic004G010151--Sobic005G110200 Sobic004G010151--Sobic004G174200 Sobic004G010151--Sobic002G008900 Sobic004G127400 Sobic004G127400 Sobic004G010151--Sobic004G127400 Sobic001G071400 Sobic001G071400 Sobic004G010151--Sobic001G071400 Sobic004G010151--Sobic009G191000 Sobic001G111850 Sobic001G111850 Sobic004G010151--Sobic001G111850 Sobic002G134200--Sobic001G071400 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic002G134200--Sobic002G309600 Sobic002G134200--Sobic003G280800 Sobic002G134200--Sobic006G216800 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic002G134200--Sobic002G133400 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic002G134200--Sobic008G047800 Sobic005G008800 Sobic005G008800 Sobic002G134200--Sobic005G008800 Sobic002G134200--Sobic009G191000 Sobic002G134200--Sobic002G008900 Sobic010G239600--Sobic007G193700 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic010G239600--Sobic006G055200 Sobic010G112000 Sobic010G112000 Sobic010G239600--Sobic010G112000 Sobic010G239600--Sobic002G008900 Sobic010G239600--Sobic004G263600 Sobic010G239600--Sobic010G010700 Sobic010G239600--Sobic002G169633 Sobic010G239600--Sobic005G001000 Sobic001G454500 Sobic001G454500 Sobic010G239600--Sobic001G454500 Sobic005G032800--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic005G032800--Sobic001G474600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G032800--Sobic002G173000 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic005G032800--Sobic006G021250 Sobic005G032800--Sobic002G134200 Sobic005G032800--Sobic002G169633 Sobic001G498600 Sobic001G498600 Sobic005G032800--Sobic001G498600 Sobic005G032800--Sobic010G112000 Sobic001G292200 Sobic001G292200 Sobic005G032800--Sobic001G292200
Octagon: transcription factors


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