Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G170000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8Y0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G176550 - -
2 Sobic.001G227200 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 1A, putative, expressed K00861: RFK, riboflavin kinase
3 Sobic.001G261573 - -
4 Sobic.009G209300 starch synthase, putative, expressed -
5 Sobic.002G343901 - -
6 Sobic.001G036050 - -
7 Sobic.003G254000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G208900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
9 Sobic.010G139000 surp module family protein, putative, expressed K13123: G patch domain-containing protein 1
10 Sobic.006G058100 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA homolog CD4B,chloroplast precursor, putative, expressed K03696: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
11 Sobic.010G277500 expressed protein -
12 Sobic.004G096600 - -
13 Sobic.001G455600 cysteine synthase, putative, expressed K01738: cysteine synthase
14 Sobic.004G140600 exonuclease, putative, expressed K13288: orn, REX2, oligoribonuclease
15 Sobic.001G456900 expressed protein -
16 Sobic.003G234900 radical SAM enzyme, putative, expressed K06941: 23S rRNA (adenine2503-C2)-methyltransferase
17 Sobic.008G092532 - -
18 Sobic.004G209600 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G067100 aspartyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01876: aspartyl-tRNA synthetase
20 Sobic.006G079400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G170000 Sobic009G170000 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic009G170000--Sobic010G176550 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic009G170000--Sobic001G227200 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic009G170000--Sobic001G261573 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic009G170000--Sobic009G209300 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic009G170000--Sobic002G343901 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic009G170000--Sobic001G036050 Sobic003G254000 Sobic003G254000 Sobic009G170000--Sobic003G254000 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic009G170000--Sobic004G208900 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic009G170000--Sobic010G139000 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic010G176550--Sobic002G031400 Sobic004G034800 Sobic004G034800 Sobic010G176550--Sobic004G034800 Sobic010G176550--Sobic001G261573 Sobic003G217700 Sobic003G217700 Sobic010G176550--Sobic003G217700 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic010G176550--Sobic007G185700 Sobic001G035900 Sobic001G035900 Sobic010G176550--Sobic001G035900 Sobic003G234900 Sobic003G234900 Sobic010G176550--Sobic003G234900 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic010G176550--Sobic010G005600 Sobic010G032900 Sobic010G032900 Sobic010G176550--Sobic010G032900 Sobic004G140600 Sobic004G140600 Sobic001G227200--Sobic004G140600 Sobic009G177500 Sobic009G177500 Sobic001G227200--Sobic009G177500 Sobic005G106500 Sobic005G106500 Sobic001G227200--Sobic005G106500 Sobic001G227200--Sobic010G139000 Sobic001G227200--Sobic002G343901 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic001G227200--Sobic004G258700 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic001G227200--Sobic001G311500 Sobic001G227200--Sobic001G036050 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic001G227200--Sobic001G456900 Sobic001G261573--Sobic003G254000 Sobic001G261573--Sobic007G185700 Sobic001G261573--Sobic010G176550 Sobic002G231200 Sobic002G231200 Sobic001G261573--Sobic002G231200 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic001G261573--Sobic005G039500 Sobic006G058100 Sobic006G058100 Sobic001G261573--Sobic006G058100 Sobic001G261573--Sobic003G234900 Sobic003G161000 Sobic003G161000 Sobic001G261573--Sobic003G161000 Sobic001G261573--Sobic009G209300 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic009G209300--Sobic003G332800 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic009G209300--Sobic006G216800 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic009G209300--Sobic003G429650 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic009G209300--Sobic006G182900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic009G209300--Sobic006G048500 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic009G209300--Sobic007G116200 Sobic002G006600 Sobic002G006600 Sobic009G209300--Sobic002G006600 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic009G209300--Sobic003G148000 Sobic009G209300--Sobic001G036050 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic002G343901--Sobic002G180666 Sobic002G343901--Sobic006G216800 Sobic002G343901--Sobic009G177500 Sobic002G343901--Sobic003G148000 Sobic002G343901--Sobic001G227200 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic002G343901--Sobic008G162900 Sobic002G343901--Sobic004G140600 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic002G343901--Sobic002G133400 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic002G343901--Sobic005G112300 Sobic001G036050--Sobic010G139000 Sobic001G036050--Sobic001G456900 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic001G036050--Sobic004G096600 Sobic001G036050--Sobic002G133400 Sobic001G036050--Sobic006G216800 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic001G036050--Sobic004G314000 Sobic001G036050--Sobic004G258700 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic001G036050--Sobic010G123600 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic001G036050--Sobic003G170900 Sobic003G254000--Sobic001G035900 Sobic003G254000--Sobic001G261573 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic003G254000--Sobic004G035000 Sobic003G254000--Sobic002G031400 Sobic003G254000--Sobic005G039500 Sobic002G064750 Sobic002G064750 Sobic003G254000--Sobic002G064750 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic003G254000--Sobic001G274200 Sobic007G099100 Sobic007G099100 Sobic003G254000--Sobic007G099100 Sobic003G254000--Sobic003G429650 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic004G208900--Sobic009G040600 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic004G208900--Sobic010G277500 Sobic003G052200 Sobic003G052200 Sobic004G208900--Sobic003G052200 Sobic004G208900--Sobic010G139000 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic004G208900--Sobic008G113100 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic004G208900--Sobic002G006900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic004G208900--Sobic008G028700 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic004G208900--Sobic003G280800 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic004G208900--Sobic009G126400 Sobic010G139000--Sobic004G314000 Sobic010G139000--Sobic005G112300 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic010G139000--Sobic010G279450 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic010G139000--Sobic010G206900 Sobic010G139000--Sobic001G311500 Sobic010G139000--Sobic001G036050 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic010G139000--Sobic010G112100 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic010G139000--Sobic010G010700 Sobic005G008800 Sobic005G008800 Sobic010G139000--Sobic005G008800
Octagon: transcription factors


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