Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G016201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5WSZ8
Pfam -
Panther DB PTHR21650
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G61000 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g38010.1 : nuf2 family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009022
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G420400 tRNA synthetases class II domain containing protein, expressed K01893: NARS, asparaginyl-tRNA synthetase
2 Sobic.009G121000 expressed protein -
3 Sobic.010G153201 - -
4 Sobic.001G016100 pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.005G118400 expressed protein -
6 Sobic.003G332700 Os1bglu5 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
7 Sobic.007G185700 CRS2-associated factor 1, chloroplast precursor, putative, expressed -
8 Sobic.002G006600 -(PubMedID : 26976818)@aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14272: glutamate--glyoxylate aminotransferase
9 Sobic.003G442700 - -
10 Sobic.003G017100 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G530900 expressed protein -
12 Sobic.008G137400 - -
13 Sobic.004G179400 ferrochelatase 2(PubMedID : 26465154)@ferrochelatase-2, chloroplast precursor, putative, expressed K01772: hemH, protoporphyrin/coproporphyrin ferrochelatase
14 Sobic.010G002700 expressed protein -
15 Sobic.010G043800 uncharacterized protein ycf45, putative, expressed -
16 Sobic.001G198100 PAP fibrillin family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G037500 expressed protein -
18 Sobic.005G063000 short chain dehydrogenase/reductase protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G261573 - -
20 Sobic.010G176550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G016201 Sobic001G016201 Sobic001G420400 Sobic001G420400 Sobic001G016201--Sobic001G420400 Sobic009G121000 Sobic009G121000 Sobic001G016201--Sobic009G121000 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic001G016201--Sobic010G153201 Sobic001G016100 Sobic001G016100 Sobic001G016201--Sobic001G016100 Sobic005G118400 Sobic005G118400 Sobic001G016201--Sobic005G118400 Sobic003G332700 Sobic003G332700 Sobic001G016201--Sobic003G332700 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic001G016201--Sobic007G185700 Sobic002G006600 Sobic002G006600 Sobic001G016201--Sobic002G006600 Sobic003G442700 Sobic003G442700 Sobic001G016201--Sobic003G442700 Sobic004G179400 Sobic004G179400 Sobic001G420400--Sobic004G179400 Sobic001G420400--Sobic001G016201 Sobic001G420400--Sobic009G121000 Sobic001G420400--Sobic010G153201 Sobic001G530900 Sobic001G530900 Sobic001G420400--Sobic001G530900 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic001G420400--Sobic009G215500 Sobic006G089500 Sobic006G089500 Sobic001G420400--Sobic006G089500 Sobic001G420400--Sobic007G185700 Sobic001G420400--Sobic003G442700 Sobic010G043800 Sobic010G043800 Sobic009G121000--Sobic010G043800 Sobic005G063000 Sobic005G063000 Sobic009G121000--Sobic005G063000 Sobic003G247400 Sobic003G247400 Sobic009G121000--Sobic003G247400 Sobic001G198100 Sobic001G198100 Sobic009G121000--Sobic001G198100 Sobic006G142600 Sobic006G142600 Sobic009G121000--Sobic006G142600 Sobic003G160800 Sobic003G160800 Sobic009G121000--Sobic003G160800 Sobic003G276300 Sobic003G276300 Sobic009G121000--Sobic003G276300 Sobic007G103400 Sobic007G103400 Sobic009G121000--Sobic007G103400 Sobic010G002700 Sobic010G002700 Sobic009G121000--Sobic010G002700 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic010G153201--Sobic002G097700 Sobic010G153201--Sobic005G118400 Sobic001G540600 Sobic001G540600 Sobic010G153201--Sobic001G540600 Sobic010G153201--Sobic001G530900 Sobic002G073250 Sobic002G073250 Sobic010G153201--Sobic002G073250 Sobic001G378100 Sobic001G378100 Sobic010G153201--Sobic001G378100 Sobic010G153201--Sobic004G179400 Sobic010G153201--Sobic010G002700 Sobic010G153201--Sobic007G185700 Sobic001G016100--Sobic009G121000 Sobic002G028400 Sobic002G028400 Sobic001G016100--Sobic002G028400 Sobic001G054100 Sobic001G054100 Sobic001G016100--Sobic001G054100 Sobic003G094350 Sobic003G094350 Sobic001G016100--Sobic003G094350 Sobic010G002000 Sobic010G002000 Sobic001G016100--Sobic010G002000 Sobic002G133900 Sobic002G133900 Sobic001G016100--Sobic002G133900 Sobic001G016100--Sobic010G043800 Sobic003G372900 Sobic003G372900 Sobic001G016100--Sobic003G372900 Sobic001G028100 Sobic001G028100 Sobic001G016100--Sobic001G028100 Sobic005G118400--Sobic010G002700 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic005G118400--Sobic005G068700 Sobic005G118400--Sobic001G378100 Sobic005G118400--Sobic001G540600 Sobic003G185900 Sobic003G185900 Sobic005G118400--Sobic003G185900 Sobic001G504400 Sobic001G504400 Sobic005G118400--Sobic001G504400 Sobic008G033000 Sobic008G033000 Sobic005G118400--Sobic008G033000 Sobic005G118400--Sobic001G530900 Sobic002G056500 Sobic002G056500 Sobic005G118400--Sobic002G056500 Sobic001G073900 Sobic001G073900 Sobic003G332700--Sobic001G073900 Sobic008G001900 Sobic008G001900 Sobic003G332700--Sobic008G001900 Sobic008G117000 Sobic008G117000 Sobic003G332700--Sobic008G117000 Sobic003G332700--Sobic001G530900 Sobic004G235600 Sobic004G235600 Sobic003G332700--Sobic004G235600 Sobic001G531500 Sobic001G531500 Sobic003G332700--Sobic001G531500 Sobic003G332700--Sobic003G442700 Sobic010G085100 Sobic010G085100 Sobic003G332700--Sobic010G085100 Sobic003G332700--Sobic005G118400 Sobic007G185700--Sobic001G054100 Sobic003G234900 Sobic003G234900 Sobic007G185700--Sobic003G234900 Sobic003G141100 Sobic003G141100 Sobic007G185700--Sobic003G141100 Sobic001G500600 Sobic001G500600 Sobic007G185700--Sobic001G500600 Sobic003G217700 Sobic003G217700 Sobic007G185700--Sobic003G217700 Sobic007G185700--Sobic001G530900 Sobic003G352500 Sobic003G352500 Sobic007G185700--Sobic003G352500 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic007G185700--Sobic001G261573 Sobic005G231100 Sobic005G231100 Sobic007G185700--Sobic005G231100 Sobic003G017100 Sobic003G017100 Sobic002G006600--Sobic003G017100 Sobic002G006600--Sobic001G198100 Sobic002G006600--Sobic010G002700 Sobic001G169900 Sobic001G169900 Sobic002G006600--Sobic001G169900 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic002G006600--Sobic003G429650 Sobic004G164400 Sobic004G164400 Sobic002G006600--Sobic004G164400 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic002G006600--Sobic006G182900 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic002G006600--Sobic009G209300 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic002G006600--Sobic006G105400 Sobic001G465700 Sobic001G465700 Sobic003G442700--Sobic001G465700 Sobic003G442700--Sobic004G235600 Sobic003G442700--Sobic008G001900 Sobic003G442700--Sobic003G332700 Sobic003G442700--Sobic009G121000 Sobic002G042500 Sobic002G042500 Sobic003G442700--Sobic002G042500 Sobic001G060401 Sobic001G060401 Sobic003G442700--Sobic001G060401 Sobic004G001300 Sobic004G001300 Sobic003G442700--Sobic004G001300 Sobic003G442700--Sobic001G073900
Octagon: transcription factors


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