Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G161000.1
Synonym
Functional annotation powdery mildew resistance protein PM3F, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q3H9
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF579
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g25740.1 : powdery mildew resistance protein PM3F, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G001300 -(PubMedID : 26976818)@erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15893: glycerate dehydrogenase
2 Sobic.001G261573 - -
3 Sobic.010G176550 - -
4 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
5 Sobic.003G442700 - -
6 Sobic.003G003600 similar to Nodule inception protein-like(PubMedID : 29862293)@NIN, putative, expressed -
7 Sobic.003G149300 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.005G039500 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
9 Sobic.002G402600 pleckstrin homology domain-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G005600 SEC14 cytosolic factor family protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G079400 - -
12 Sobic.003G254000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39
14 Sobic.010G277500 expressed protein -
15 Sobic.008G001000 AGC_PVPK_like_kin82y.2 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
16 Sobic.001G359900 expressed protein -
17 Sobic.007G099100 - -
18 Sobic.007G113800 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
19 Sobic.001G354501 - K07877: Ras-related protein Rab-2A
20 Sobic.003G161100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G161000 Sobic003G161000 Sobic004G001300 Sobic004G001300 Sobic003G161000--Sobic004G001300 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic003G161000--Sobic001G261573 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic003G161000--Sobic010G176550 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic003G161000--Sobic002G031400 Sobic003G442700 Sobic003G442700 Sobic003G161000--Sobic003G442700 Sobic003G003600 Sobic003G003600 Sobic003G161000--Sobic003G003600 Sobic003G149300 Sobic003G149300 Sobic003G161000--Sobic003G149300 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic003G161000--Sobic005G039500 Sobic002G402600 Sobic002G402600 Sobic003G161000--Sobic002G402600 Sobic001G118100 Sobic001G118100 Sobic004G001300--Sobic001G118100 Sobic007G204900 Sobic007G204900 Sobic004G001300--Sobic007G204900 Sobic008G001000 Sobic008G001000 Sobic004G001300--Sobic008G001000 Sobic004G001300--Sobic003G442700 Sobic004G001300--Sobic003G161000 Sobic001G098301 Sobic001G098301 Sobic004G001300--Sobic001G098301 Sobic004G001300--Sobic003G003600 Sobic003G137100 Sobic003G137100 Sobic004G001300--Sobic003G137100 Sobic001G060401 Sobic001G060401 Sobic004G001300--Sobic001G060401 Sobic003G254000 Sobic003G254000 Sobic001G261573--Sobic003G254000 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic001G261573--Sobic007G185700 Sobic001G261573--Sobic010G176550 Sobic002G231200 Sobic002G231200 Sobic001G261573--Sobic002G231200 Sobic001G261573--Sobic005G039500 Sobic006G058100 Sobic006G058100 Sobic001G261573--Sobic006G058100 Sobic003G234900 Sobic003G234900 Sobic001G261573--Sobic003G234900 Sobic001G261573--Sobic003G161000 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic001G261573--Sobic009G209300 Sobic010G176550--Sobic002G031400 Sobic004G034800 Sobic004G034800 Sobic010G176550--Sobic004G034800 Sobic010G176550--Sobic001G261573 Sobic003G217700 Sobic003G217700 Sobic010G176550--Sobic003G217700 Sobic010G176550--Sobic007G185700 Sobic001G035900 Sobic001G035900 Sobic010G176550--Sobic001G035900 Sobic010G176550--Sobic003G234900 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic010G176550--Sobic010G005600 Sobic010G032900 Sobic010G032900 Sobic010G176550--Sobic010G032900 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic002G031400--Sobic010G277500 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic002G031400--Sobic007G161000 Sobic002G031400--Sobic001G035900 Sobic002G031400--Sobic003G254000 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic002G031400--Sobic008G011100 Sobic002G031400--Sobic010G176550 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic002G031400--Sobic003G280800 Sobic009G260500 Sobic009G260500 Sobic002G031400--Sobic009G260500 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic002G031400--Sobic004G258700 Sobic001G465700 Sobic001G465700 Sobic003G442700--Sobic001G465700 Sobic004G235600 Sobic004G235600 Sobic003G442700--Sobic004G235600 Sobic008G001900 Sobic008G001900 Sobic003G442700--Sobic008G001900 Sobic003G332700 Sobic003G332700 Sobic003G442700--Sobic003G332700 Sobic009G121000 Sobic009G121000 Sobic003G442700--Sobic009G121000 Sobic002G042500 Sobic002G042500 Sobic003G442700--Sobic002G042500 Sobic003G442700--Sobic001G060401 Sobic003G442700--Sobic004G001300 Sobic001G073900 Sobic001G073900 Sobic003G442700--Sobic001G073900 Sobic001G065600 Sobic001G065600 Sobic003G003600--Sobic001G065600 Sobic003G003600--Sobic001G073900 Sobic003G003600--Sobic003G442700 Sobic003G003600--Sobic004G001300 Sobic001G418700 Sobic001G418700 Sobic003G003600--Sobic001G418700 Sobic003G003600--Sobic003G161000 Sobic003G003600--Sobic008G001000 Sobic001G158900 Sobic001G158900 Sobic003G003600--Sobic001G158900 Sobic002G385700 Sobic002G385700 Sobic003G003600--Sobic002G385700 Sobic002G293600 Sobic002G293600 Sobic003G149300--Sobic002G293600 Sobic003G040000 Sobic003G040000 Sobic003G149300--Sobic003G040000 Sobic009G127400 Sobic009G127400 Sobic003G149300--Sobic009G127400 Sobic003G149300--Sobic003G161000 Sobic001G514100 Sobic001G514100 Sobic003G149300--Sobic001G514100 Sobic003G155300 Sobic003G155300 Sobic003G149300--Sobic003G155300 Sobic005G197300 Sobic005G197300 Sobic003G149300--Sobic005G197300 Sobic003G149300--Sobic001G261573 Sobic009G129100 Sobic009G129100 Sobic003G149300--Sobic009G129100 Sobic005G039500--Sobic003G254000 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic005G039500--Sobic001G067850 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G039500--Sobic003G113200 Sobic005G039500--Sobic001G261573 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G039500--Sobic003G429650 Sobic009G212700 Sobic009G212700 Sobic005G039500--Sobic009G212700 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G039500--Sobic002G243900 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic005G039500--Sobic004G035000 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic005G039500--Sobic007G037900 Sobic002G402600--Sobic002G031400 Sobic001G420500 Sobic001G420500 Sobic002G402600--Sobic001G420500 Sobic002G402600--Sobic009G260500 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G402600--Sobic009G210500 Sobic002G402600--Sobic010G277500 Sobic002G402600--Sobic005G039500 Sobic002G402600--Sobic003G161000 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic002G402600--Sobic001G407200 Sobic008G150700 Sobic008G150700 Sobic002G402600--Sobic008G150700
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