Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G147400.1
Synonym ULP1A
Functional annotation ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6P969
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06910 : UB-like protease 1A
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g21310.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G271100 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
2 Sobic.010G173201 - -
3 Sobic.007G130200 - -
4 Sobic.010G119500 cadmium tolerance factor, putative, expressed K11267: sister chromatid cohesion protein PDS5
5 Sobic.010G164350 - -
6 Sobic.006G048700 "fatty acid desaturase, up-regulated under severe drought stress"(PubMedID : 24655390)@Acyl-acyl-carrier-protein desaturase (Os)(PubMedID : 27208977)@acyl-desaturase, chloroplast precursor, putative, expressed K03921: FAB2, SSI2, acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase
7 Sobic.001G288301 - -
8 Sobic.005G210350 - -
9 Sobic.004G270000 coatomer subunit delta, putative, expressed -
10 Sobic.010G128500 - -
11 Sobic.002G047333 - K04078: groES, chaperonin GroES
12 Sobic.006G041432 - -
13 Sobic.002G173700 expressed protein -
14 Sobic.008G055432 - -
15 Sobic.007G020000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
16 Sobic.004G233300 - -
17 Sobic.008G013600 - -
18 Sobic.005G019500 - -
19 Sobic.004G006300 translationally-controlled tumor protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G226600 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein


Gene co-expression network
sample Sobic009G147400 Sobic009G147400 Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic009G147400--Sobic001G271100 Sobic010G173201 Sobic010G173201 Sobic009G147400--Sobic010G173201 Sobic007G130200 Sobic007G130200 Sobic009G147400--Sobic007G130200 Sobic010G119500 Sobic010G119500 Sobic009G147400--Sobic010G119500 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic009G147400--Sobic010G164350 Sobic006G048700 Sobic006G048700 Sobic009G147400--Sobic006G048700 Sobic001G288301 Sobic001G288301 Sobic009G147400--Sobic001G288301 Sobic005G210350 Sobic005G210350 Sobic009G147400--Sobic005G210350 Sobic004G270000 Sobic004G270000 Sobic009G147400--Sobic004G270000 Sobic001G271100--Sobic010G164350 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic001G271100--Sobic005G043800 Sobic001G271100--Sobic010G173201 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic001G271100--Sobic010G120700 Sobic010G128500 Sobic010G128500 Sobic001G271100--Sobic010G128500 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic001G271100--Sobic008G055432 Sobic001G271100--Sobic007G130200 Sobic006G045700 Sobic006G045700 Sobic001G271100--Sobic006G045700 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic001G271100--Sobic010G068200 Sobic010G173201--Sobic010G068200 Sobic010G173201--Sobic010G120700 Sobic010G173201--Sobic010G164350 Sobic010G173201--Sobic001G271100 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic010G173201--Sobic004G196500 Sobic010G173201--Sobic008G055432 Sobic010G173201--Sobic007G130200 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic010G173201--Sobic010G057700 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic010G173201--Sobic007G129401 Sobic007G130200--Sobic010G173201 Sobic007G130200--Sobic001G271100 Sobic007G130200--Sobic010G164350 Sobic007G130200--Sobic010G120700 Sobic007G130200--Sobic010G119500 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic007G130200--Sobic008G055366 Sobic007G130200--Sobic008G055432 Sobic007G226600 Sobic007G226600 Sobic007G130200--Sobic007G226600 Sobic007G130200--Sobic010G068200 Sobic002G417800 Sobic002G417800 Sobic010G119500--Sobic002G417800 Sobic010G119500--Sobic010G173201 Sobic010G119500--Sobic007G130200 Sobic004G149600 Sobic004G149600 Sobic010G119500--Sobic004G149600 Sobic010G119500--Sobic001G271100 Sobic010G119500--Sobic007G226600 Sobic010G119500--Sobic008G055366 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic010G119500--Sobic001G167200 Sobic004G010151 Sobic004G010151 Sobic010G119500--Sobic004G010151 Sobic010G164350--Sobic001G271100 Sobic010G164350--Sobic005G043800 Sobic010G164350--Sobic010G173201 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic010G164350--Sobic004G132150 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic010G164350--Sobic001G261480 Sobic010G164350--Sobic006G045700 Sobic010G164350--Sobic008G055432 Sobic010G164350--Sobic010G120700 Sobic004G233300 Sobic004G233300 Sobic010G164350--Sobic004G233300 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic006G048700--Sobic005G149500 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic006G048700--Sobic009G040700 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic006G048700--Sobic003G187400 Sobic003G008500 Sobic003G008500 Sobic006G048700--Sobic003G008500 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic006G048700--Sobic009G022200 Sobic006G173100 Sobic006G173100 Sobic006G048700--Sobic006G173100 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic006G048700--Sobic007G011400 Sobic006G048700--Sobic004G270000 Sobic002G165300 Sobic002G165300 Sobic006G048700--Sobic002G165300 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic001G288301--Sobic001G272532 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic001G288301--Sobic010G225226 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic001G288301--Sobic009G104201 Sobic001G288301--Sobic010G057700 Sobic001G288301--Sobic004G132150 Sobic005G019500 Sobic005G019500 Sobic001G288301--Sobic005G019500 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G288301--Sobic005G077466 Sobic001G271900 Sobic001G271900 Sobic001G288301--Sobic001G271900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G288301--Sobic007G178700 Sobic010G028950 Sobic010G028950 Sobic005G210350--Sobic010G028950 Sobic005G012000 Sobic005G012000 Sobic005G210350--Sobic005G012000 Sobic008G126200 Sobic008G126200 Sobic005G210350--Sobic008G126200 Sobic006G132100 Sobic006G132100 Sobic005G210350--Sobic006G132100 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic005G210350--Sobic005G212600 Sobic003G244800 Sobic003G244800 Sobic005G210350--Sobic003G244800 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G210350--Sobic008G009500 Sobic005G210350--Sobic005G043800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G210350--Sobic010G144000 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic004G270000--Sobic002G158700 Sobic002G197100 Sobic002G197100 Sobic004G270000--Sobic002G197100 Sobic004G270000--Sobic003G008500 Sobic010G276800 Sobic010G276800 Sobic004G270000--Sobic010G276800 Sobic009G135800 Sobic009G135800 Sobic004G270000--Sobic009G135800 Sobic004G270000--Sobic006G173100 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic004G270000--Sobic001G464200 Sobic003G176400 Sobic003G176400 Sobic004G270000--Sobic003G176400 Sobic005G013000 Sobic005G013000 Sobic004G270000--Sobic005G013000
Octagon: transcription factors


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