Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G013600.1,Sobic.008G013600.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PB12 , A0A1B6PB78
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.004G188400 photoperiodic flowering time gene(PubMedID : 22394582)@FAD binding domain of DNA photolyase domain containing protein, expressed K12118: cryptochrome 1
2 Sobic.004G065650 - -
3 Sobic.001G486300 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
4 Sobic.009G034200 CBL-interacting protein kinase 1(PubMedID : 26320239)@Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.3 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K07198: PRKAA, 5'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha subunit
5 Sobic.005G110472 - -
6 Sobic.001G067850 - -
7 Sobic.007G037100 MYB family transcription factor, putative, expressed -
8 Sobic.007G037900 oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold containing protein, expressed -
9 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
10 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G088580 - -
12 Sobic.001G107500 cyclin-dependent kinase, putative, expressed K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
13 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G179201 - -
15 Sobic.006G137400 - -
16 Sobic.001G118100 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G390400 expressed protein -
18 Sobic.002G380500 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
19 Sobic.010G124001 - -
20 Sobic.010G202000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G013600 Sobic008G013600 Sobic004G188400 Sobic004G188400 Sobic008G013600--Sobic004G188400 Sobic004G065650 Sobic004G065650 Sobic008G013600--Sobic004G065650 Sobic001G486300 Sobic001G486300 Sobic008G013600--Sobic001G486300 Sobic009G034200 Sobic009G034200 Sobic008G013600--Sobic009G034200 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic008G013600--Sobic005G110472 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic008G013600--Sobic001G067850 Sobic007G037100 Sobic007G037100 Sobic008G013600--Sobic007G037100 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic008G013600--Sobic007G037900 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic008G013600--Sobic004G290800 Sobic001G372700 Sobic001G372700 Sobic004G188400--Sobic001G372700 Sobic004G188400--Sobic004G065650 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic004G188400--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic004G188400--Sobic003G268300 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic004G188400--Sobic006G082600 Sobic004G188400--Sobic005G110472 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic004G188400--Sobic004G196700 Sobic004G188400--Sobic007G037900 Sobic002G165300 Sobic002G165300 Sobic004G188400--Sobic002G165300 Sobic004G065650--Sobic004G188400 Sobic004G065650--Sobic005G110472 Sobic004G065650--Sobic007G037900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic004G065650--Sobic006G088580 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic004G065650--Sobic009G140500 Sobic004G065650--Sobic008G013600 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic004G065650--Sobic010G124001 Sobic006G137400 Sobic006G137400 Sobic004G065650--Sobic006G137400 Sobic004G065650--Sobic001G067850 Sobic005G023900 Sobic005G023900 Sobic001G486300--Sobic005G023900 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic001G486300--Sobic001G420200 Sobic001G486300--Sobic003G268300 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic001G486300--Sobic007G011400 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic001G486300--Sobic001G497300 Sobic001G486300--Sobic004G290800 Sobic001G107500 Sobic001G107500 Sobic001G486300--Sobic001G107500 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic001G486300--Sobic001G251700 Sobic003G220200 Sobic003G220200 Sobic001G486300--Sobic003G220200 Sobic003G345400 Sobic003G345400 Sobic009G034200--Sobic003G345400 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic009G034200--Sobic007G113800 Sobic009G034200--Sobic009G140500 Sobic006G228500 Sobic006G228500 Sobic009G034200--Sobic006G228500 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic009G034200--Sobic003G179201 Sobic002G399100 Sobic002G399100 Sobic009G034200--Sobic002G399100 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic009G034200--Sobic010G056200 Sobic009G034200--Sobic001G067850 Sobic004G113800 Sobic004G113800 Sobic009G034200--Sobic004G113800 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic005G110472--Sobic003G170100 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic003G268300 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic003G390400 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G110472--Sobic002G243900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic005G110472--Sobic003G200200 Sobic005G110472--Sobic007G113800 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic005G110472--Sobic007G137900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic005G110472--Sobic003G176500 Sobic001G067850--Sobic002G243900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G067850--Sobic007G178700 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic001G067850--Sobic001G274200 Sobic001G067850--Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic001G420200 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic001G067850--Sobic005G144400 Sobic001G067850--Sobic007G096600 Sobic001G067850--Sobic007G037900 Sobic001G067850--Sobic006G088580 Sobic007G037100--Sobic006G082600 Sobic001G222300 Sobic001G222300 Sobic007G037100--Sobic001G222300 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic007G037100--Sobic008G116500 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic007G037100--Sobic002G001600 Sobic007G037100--Sobic010G124001 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic007G037100--Sobic007G211000 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic007G037100--Sobic007G078000 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G037100--Sobic001G162300 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic007G037100--Sobic002G283300 Sobic007G037900--Sobic003G268300 Sobic007G037900--Sobic001G420200 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic007G037900--Sobic006G246900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic007G037900--Sobic002G144933 Sobic007G037900--Sobic001G274200 Sobic007G037900--Sobic009G127900 Sobic007G037900--Sobic001G162300 Sobic007G037900--Sobic004G290800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic007G037900--Sobic002G157000 Sobic004G290800--Sobic009G127900 Sobic004G290800--Sobic001G420200 Sobic004G290800--Sobic007G178700 Sobic004G290800--Sobic007G037900 Sobic004G290800--Sobic003G268300 Sobic004G290800--Sobic001G162300 Sobic004G290800--Sobic002G157000 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic004G290800--Sobic001G111900 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic004G290800--Sobic001G446900
Octagon: transcription factors


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